Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Ear-ps4-201ENSMUST00000166834 450 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Gm25457-201ENSMUST00000179509 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Gm5900-201ENSMUST00000179862 375 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Tmsb15b2-202ENSMUST00000180194 243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Gm28383-201ENSMUST00000187563 139 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Gm29229-201ENSMUST00000188874 323 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Gm29262-201ENSMUST00000190084 196 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Gm18433-201ENSMUST00000192747 197 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Gm3724-201ENSMUST00000197957 349 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Gm26314-201ENSMUST00000083891 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Gm22678-201ENSMUST00000116974 101 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Gm26181-201ENSMUST00000157687 106 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Gm23793-201ENSMUST00000179396 117 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Gm26864-201ENSMUST00000181346 156 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Mir6346-201ENSMUST00000183982 81 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Gm43676-201ENSMUST00000197532 540 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Gm43865-201ENSMUST00000204721 127 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Serf1-201ENSMUST00000022145 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 AC155241.1-201ENSMUST00000222709 415 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Mir29b-2-201ENSMUST00000083478 81 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Mir410-201ENSMUST00000083563 81 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Gm25896-201ENSMUST00000083713 136 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Olfr307-202ENSMUST00000213705 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Olfr1148-202ENSMUST00000215230 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Gm25832-201ENSMUST00000104140 130 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Gm24907-201ENSMUST00000116932 128 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Gm11798-201ENSMUST00000119150 421 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Gm13518-201ENSMUST00000120018 233 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Gm14972-201ENSMUST00000121780 364 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 AI847159-201ENSMUST00000137728 305 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Gm24388-201ENSMUST00000177872 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Mir6355-201ENSMUST00000183687 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 C230029F24Rik-202ENSMUST00000188673 554 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Gm43578-201ENSMUST00000201250 459 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Nbdy-205ENSMUST00000208235 132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 AC158597.1-201ENSMUST00000216234 150 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 AC163646.2-201ENSMUST00000227962 141 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Gm23462-201ENSMUST00000083264 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Olfr1316-201ENSMUST00000099596 945 ntAPPRIS P2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Olfr385-202ENSMUST00000215689 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Gm13885-201ENSMUST00000117569 187 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Gm24726-201ENSMUST00000158232 121 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Gm25012-201ENSMUST00000158396 164 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Gm25711-201ENSMUST00000158633 128 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Gm24737-201ENSMUST00000158861 100 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Vmn2r-ps55-201ENSMUST00000173834 240 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Mir6399-201ENSMUST00000184050 84 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Gm44794-201ENSMUST00000206550 411 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Gm32817-202ENSMUST00000210738 527 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Olfr927-ps1-201ENSMUST00000216759 782 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 AC102369.1-201ENSMUST00000218415 373 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 AC121942.2-201ENSMUST00000223824 600 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 AC192333.1-201ENSMUST00000224573 376 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 CT033785.1-201ENSMUST00000224872 272 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 AC027184.1-201ENSMUST00000226991 424 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Gm25929-201ENSMUST00000082784 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Gm23721-201ENSMUST00000083005 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Gm23731-201ENSMUST00000083749 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Gm25651-201ENSMUST00000083782 119 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Olfr229-202ENSMUST00000214904 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Gm14405-201ENSMUST00000117808 2330 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Gm22021-201ENSMUST00000104353 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Gm13672-201ENSMUST00000117554 459 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Gm25543-201ENSMUST00000122678 312 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Gm15281-201ENSMUST00000125181 351 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Gm22836-201ENSMUST00000158441 61 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Gm23024-201ENSMUST00000158770 292 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Gm17100-201ENSMUST00000168963 272 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Gm22800-201ENSMUST00000175627 94 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Mir6995-201ENSMUST00000183658 71 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Gm29235-201ENSMUST00000185786 442 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Mir3087-201ENSMUST00000199405 56 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Igkv13-55-1-201ENSMUST00000200400 308 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 AL603630.1-201ENSMUST00000214781 147 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Gm24406-201ENSMUST00000083026 128 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Gm23041-201ENSMUST00000083868 106 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Gm26249-201ENSMUST00000116708 118 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Gm24275-201ENSMUST00000116780 146 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Gm11834-201ENSMUST00000122257 585 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Gm11192-201ENSMUST00000127017 151 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Gm25888-201ENSMUST00000157778 302 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Gm25982-201ENSMUST00000157920 101 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Gm20462-201ENSMUST00000172623 408 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Gm24573-201ENSMUST00000175499 112 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 C920009B18Rik-204ENSMUST00000181733 123 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Gtpbp4-ps1-201ENSMUST00000184732 249 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Gm37650-201ENSMUST00000193570 248 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Gm44337-201ENSMUST00000196553 114 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 AC130829.3-201ENSMUST00000222735 154 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Gm24765-201ENSMUST00000083691 103 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Rtf1A2AQ19 Zfp788-207ENSMUST00000170770 2499 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
Rtf1A2AQ19 Zfp980-202ENSMUST00000180014 1938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
Rtf1A2AQ19 Gm14882-201ENSMUST00000117216 218 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Rtf1A2AQ19 Gm23589-201ENSMUST00000157660 105 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Rtf1A2AQ19 Gm26914-201ENSMUST00000182262 223 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Rtf1A2AQ19 Mir8116-201ENSMUST00000184134 97 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Rtf1A2AQ19 Ranbp2-ps2-201ENSMUST00000184379 370 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Rtf1A2AQ19 Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 184 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Rtf1A2AQ19 Gm42672-201ENSMUST00000197821 352 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Rtf1A2AQ19 Snhg1-208ENSMUST00000206029 408 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
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