Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Gm29005-201ENSMUST00000186773 320 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm28383-201ENSMUST00000187563 139 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm29262-201ENSMUST00000190084 196 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 1700016B01Rik-201ENSMUST00000197688 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm44726-201ENSMUST00000203427 217 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Olfr185-ps1-201ENSMUST00000205894 881 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm36368-201ENSMUST00000212026 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Snord68-201ENSMUST00000082516 86 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm26314-201ENSMUST00000083891 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Olfr1039-203ENSMUST00000216566 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Vmn1r75-203ENSMUST00000226855 6548 ntAPPRIS P2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm12433-201ENSMUST00000119659 255 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm15861-201ENSMUST00000120979 339 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm25543-201ENSMUST00000122678 312 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm26150-201ENSMUST00000157426 151 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm24222-201ENSMUST00000158834 93 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Cfap61-214ENSMUST00000167179 183 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm3027-201ENSMUST00000167579 451 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm25253-201ENSMUST00000179958 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Mir6997-201ENSMUST00000184313 71 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm19901-201ENSMUST00000192191 495 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Ighv2-8-201ENSMUST00000193935 262 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm44071-201ENSMUST00000204180 448 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Snhg1-208ENSMUST00000206029 408 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm45403-201ENSMUST00000209453 276 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 AC116589.3-202ENSMUST00000221770 649 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 AC116589.6-201ENSMUST00000222252 649 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 AC239878.2-201ENSMUST00000224048 464 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 AC117202.2-201ENSMUST00000226491 1101 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm24165-201ENSMUST00000082718 128 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm43706-201ENSMUST00000198767 2652 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 AC161250.2-201ENSMUST00000215114 3107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm23015-201ENSMUST00000104145 128 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm12770-201ENSMUST00000121734 462 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm13942-201ENSMUST00000136950 325 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm27926-201ENSMUST00000157180 66 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm26401-201ENSMUST00000158502 76 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm9156-201ENSMUST00000189660 463 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm37162-201ENSMUST00000191708 551 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm37054-201ENSMUST00000193481 543 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Igkv13-76-201ENSMUST00000197621 347 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Olfr1442-204ENSMUST00000208657 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm45557-201ENSMUST00000210004 1651 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 AC133934.2-201ENSMUST00000221729 4129 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 1700019M22Rik-201ENSMUST00000073560 354 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Snord118-201ENSMUST00000082965 135 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Olfr1450-202ENSMUST00000213587 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Cldn8Q9Z260 Gm13714-201ENSMUST00000117313 221 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cldn8Q9Z260 Gm13729-201ENSMUST00000120328 406 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cldn8Q9Z260 Gm4128-201ENSMUST00000154338 461 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Cldn8Q9Z260 Gm22082-201ENSMUST00000157587 161 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cldn8Q9Z260 Gm24858-201ENSMUST00000158058 323 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cldn8Q9Z260 Mir669n-201ENSMUST00000158636 54 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cldn8Q9Z260 Mir3092-201ENSMUST00000174954 96 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cldn8Q9Z260 Gm22264-201ENSMUST00000178200 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cldn8Q9Z260 Gm37128-201ENSMUST00000192599 232 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cldn8Q9Z260 Gm45907-201ENSMUST00000213023 193 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cldn8Q9Z260 Olfr1035-ps1-202ENSMUST00000213364 288 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Cldn8Q9Z260 Gm45815-201ENSMUST00000220241 146 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cldn8Q9Z260 Defb21-201ENSMUST00000070722 427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
Cldn8Q9Z260 Gm24536-201ENSMUST00000083144 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cldn8Q9Z260 Gm24615-201ENSMUST00000083268 113 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cldn8Q9Z260 Olfr152-201ENSMUST00000090709 951 ntAPPRIS P2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Cldn8Q9Z260 Gm22656-201ENSMUST00000104199 171 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn8Q9Z260 Gm26249-201ENSMUST00000116708 118 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn8Q9Z260 Gm13432-201ENSMUST00000118861 241 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn8Q9Z260 Gm43439-201ENSMUST00000138710 322 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn8Q9Z260 Gm23854-201ENSMUST00000158378 108 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn8Q9Z260 Gm17100-201ENSMUST00000168963 272 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn8Q9Z260 Gm26936-201ENSMUST00000182424 382 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn8Q9Z260 Gtpbp4-ps1-201ENSMUST00000184732 249 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn8Q9Z260 Gm21409-201ENSMUST00000186110 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn8Q9Z260 Gm9227-201ENSMUST00000194733 566 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn8Q9Z260 Gm43035-201ENSMUST00000197626 517 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn8Q9Z260 AC117232.1-201ENSMUST00000197964 119 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn8Q9Z260 Gm44256-201ENSMUST00000203304 335 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn8Q9Z260 Gm45456-201ENSMUST00000210841 243 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn8Q9Z260 Gm20102-201ENSMUST00000222445 220 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn8Q9Z260 Vmn2r-ps102-203ENSMUST00000222739 604 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn8Q9Z260 Gm24406-201ENSMUST00000083026 128 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn8Q9Z260 Olfr831-ps1-201ENSMUST00000086496 890 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cldn8Q9Z260 Rgs13-201ENSMUST00000052375 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn8Q9Z260 Gm33962-201ENSMUST00000182643 2592 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn8Q9Z260 Mir758-201ENSMUST00000103260 81 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn8Q9Z260 Igkv5-39-201ENSMUST00000103370 287 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn8Q9Z260 Gm11512-201ENSMUST00000119669 663 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn8Q9Z260 Gm22227-201ENSMUST00000157356 259 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn8Q9Z260 Gm22603-201ENSMUST00000157603 96 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn8Q9Z260 Gm22665-201ENSMUST00000158720 275 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn8Q9Z260 Gm25707-201ENSMUST00000175120 96 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn8Q9Z260 Gm26727-201ENSMUST00000180773 366 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn8Q9Z260 Mir7241-201ENSMUST00000184532 64 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn8Q9Z260 Gm27959-201ENSMUST00000185172 111 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn8Q9Z260 Gm37027-201ENSMUST00000194642 256 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn8Q9Z260 Gm45344-201ENSMUST00000211610 341 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn8Q9Z260 AC160863.1-201ENSMUST00000218412 317 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn8Q9Z260 Olfr746-201ENSMUST00000080616 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn8Q9Z260 Skint5-202ENSMUST00000169631 4497 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
Cldn8Q9Z260 Gm26624-201ENSMUST00000181486 3769 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Cldn8Q9Z260 n-R5s158-201ENSMUST00000104095 118 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.4 ms