Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Vmn1r178-205ENSMUST00000227993 2518 ntAPPRIS P1 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm22678-201ENSMUST00000116974 101 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm13396-201ENSMUST00000120617 271 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm5396-201ENSMUST00000121222 532 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm6956-201ENSMUST00000134724 546 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm25982-201ENSMUST00000157920 101 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm24053-201ENSMUST00000158620 105 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Mir9-3-201ENSMUST00000175497 90 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm24656-201ENSMUST00000177548 132 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Tmsb15b2-202ENSMUST00000180194 243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Mir6406-201ENSMUST00000183592 120 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm32175-201ENSMUST00000193641 346 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm43472-201ENSMUST00000200175 154 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm45119-201ENSMUST00000207612 199 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm34783-201ENSMUST00000209159 303 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 RMST_1.1-206ENSMUST00000218255 309 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm23404-201ENSMUST00000082543 97 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm26126-201ENSMUST00000083188 164 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Mir29b-2-201ENSMUST00000083478 81 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm25896-201ENSMUST00000083713 136 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 2410141K09Rik-201ENSMUST00000091541 288 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Nkain2-202ENSMUST00000092603 273 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm10720-201ENSMUST00000099050 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm15303-201ENSMUST00000118676 2624 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Olfr921-203ENSMUST00000217114 4120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Mir701-201ENSMUST00000102208 109 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Mir873a-201ENSMUST00000104863 77 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm13439-201ENSMUST00000117541 409 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm14624-201ENSMUST00000117746 192 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm13588-201ENSMUST00000120026 135 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm14574-201ENSMUST00000120644 279 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm11192-201ENSMUST00000127017 151 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 2210417A02Rik-201ENSMUST00000150265 550 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm25827-201ENSMUST00000157089 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm25434-201ENSMUST00000158278 167 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm24572-201ENSMUST00000175505 88 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm29005-201ENSMUST00000186773 320 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm29296-201ENSMUST00000188146 320 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm29229-201ENSMUST00000188874 323 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm43624-201ENSMUST00000197368 180 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm43676-201ENSMUST00000197532 540 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Trav15n-3-201ENSMUST00000200498 168 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 AC154296.2-201ENSMUST00000214696 545 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm10264-201ENSMUST00000220589 429 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm33654-201ENSMUST00000221704 215 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm21937-201ENSMUST00000222825 218 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 CT033785.1-201ENSMUST00000224872 272 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm25788-201ENSMUST00000082721 131 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm25813-201ENSMUST00000082748 191 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm23246-201ENSMUST00000083371 67 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Mir181a-1-201ENSMUST00000083631 87 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm25651-201ENSMUST00000083782 119 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Olfr948-202ENSMUST00000216132 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Skint5-202ENSMUST00000169631 4497 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Olfr606-202ENSMUST00000214631 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm24282-201ENSMUST00000104232 66 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm13885-201ENSMUST00000117569 187 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Nell1os-201ENSMUST00000134584 489 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm23589-201ENSMUST00000157660 105 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm24504-201ENSMUST00000157679 100 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm24726-201ENSMUST00000158232 121 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Mir669n-201ENSMUST00000158636 54 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm24222-201ENSMUST00000158834 93 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm17689-201ENSMUST00000170030 330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm25933-201ENSMUST00000178943 108 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm29397-201ENSMUST00000185205 333 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm37399-201ENSMUST00000195224 416 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm43512-201ENSMUST00000198495 176 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Snhg1-208ENSMUST00000206029 408 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Olfr927-ps1-201ENSMUST00000216759 782 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 AC159709.1-201ENSMUST00000220445 349 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 AC120540.2-201ENSMUST00000221716 387 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Olfr497-201ENSMUST00000076406 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm23721-201ENSMUST00000083005 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm23462-201ENSMUST00000083264 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm23731-201ENSMUST00000083749 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm22365-201ENSMUST00000093750 117 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 AW112010-201ENSMUST00000099676 770 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Olfr143-202ENSMUST00000213129 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm42755-201ENSMUST00000198533 1493 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm23950-201ENSMUST00000104026 129 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm23951-201ENSMUST00000104029 132 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm23109-201ENSMUST00000116867 126 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm22032-201ENSMUST00000116946 116 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm15010-201ENSMUST00000117153 407 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Rhox11-ps2-201ENSMUST00000117962 451 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm11798-201ENSMUST00000119150 421 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm12926-201ENSMUST00000121158 409 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm14972-201ENSMUST00000121780 364 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm15365-201ENSMUST00000122392 300 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm23435-201ENSMUST00000157183 156 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm22316-201ENSMUST00000158012 216 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm24005-201ENSMUST00000158459 296 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm16306-201ENSMUST00000160568 176 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm7592-201ENSMUST00000160674 627 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm25956-201ENSMUST00000175115 217 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm10717-205ENSMUST00000177601 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm25121-201ENSMUST00000179846 79 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm34302-201ENSMUST00000192926 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm37650-201ENSMUST00000193570 248 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
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