Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm9747-201ENSMUST00000023262 2822 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Tug1-201ENSMUST00000132077 6719 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Il1rapl1-202ENSMUST00000113964 1936 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Olfr1039-202ENSMUST00000214364 3925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm14914-201ENSMUST00000117576 2031 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Olfr1033-202ENSMUST00000213865 3664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Olfr1454-204ENSMUST00000217568 4215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm25168-201ENSMUST00000104189 132 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm22193-201ENSMUST00000116868 76 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm15733-201ENSMUST00000132957 242 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm23326-201ENSMUST00000157419 105 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm24480-201ENSMUST00000157442 103 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm22380-201ENSMUST00000157479 95 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Mir1934-201ENSMUST00000158127 83 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm25066-201ENSMUST00000158145 123 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm17161-201ENSMUST00000169187 524 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm22853-201ENSMUST00000174974 131 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm25535-201ENSMUST00000175364 125 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm27648-201ENSMUST00000184315 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm44476-201ENSMUST00000196225 91 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 AC122194.1-201ENSMUST00000220549 293 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm25205-201ENSMUST00000082841 103 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm26265-201ENSMUST00000083277 135 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm22739-201ENSMUST00000083437 160 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm25895-201ENSMUST00000083714 100 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Olfr194-202ENSMUST00000213228 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Gm42448-201ENSMUST00000197122 2644 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Pkhd1l1-202ENSMUST00000166957 12747 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Pkhd1l1-201ENSMUST00000038336 12741 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Olfr136-204ENSMUST00000214035 1925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Olfr679-202ENSMUST00000214328 5184 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 C87977-201ENSMUST00000105753 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Gm16162-201ENSMUST00000162296 297 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Gm5224-201ENSMUST00000183060 350 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Mir6914-201ENSMUST00000184999 69 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Gm37146-201ENSMUST00000192572 463 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Gm32381-201ENSMUST00000203192 476 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Gm44182-201ENSMUST00000204052 115 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Gm44824-201ENSMUST00000207021 229 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 AC117198.1-201ENSMUST00000217080 651 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Gm19563-201ENSMUST00000222031 270 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Gm11351-202ENSMUST00000225724 478 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Gm45159-201ENSMUST00000208630 25241 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r42-203ENSMUST00000227279 4138 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Lrrc19-202ENSMUST00000107101 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Gm12128-201ENSMUST00000131013 2914 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Gm22051-201ENSMUST00000117002 127 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Gm20613-201ENSMUST00000175828 345 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Gm27645-201ENSMUST00000183348 77 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Mir7578-201ENSMUST00000183455 82 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Gm44024-201ENSMUST00000203008 476 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Gm43899-201ENSMUST00000203675 246 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 AC140254.1-201ENSMUST00000220063 331 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 CT030687.1-201ENSMUST00000221854 162 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Gm23138-201ENSMUST00000083365 103 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Gm3055-202ENSMUST00000218939 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Zfp781-202ENSMUST00000219144 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Gm43256-201ENSMUST00000199995 3091 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Csnka2ip-202ENSMUST00000209382 2859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Olfr681-205ENSMUST00000216247 4729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Gm26135-201ENSMUST00000101993 72 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 n-R5s179-201ENSMUST00000122564 118 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Gm13667-201ENSMUST00000132332 617 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Mir1966-201ENSMUST00000158807 108 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Gm25835-201ENSMUST00000158917 144 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Snord50b-201ENSMUST00000178497 72 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Ptma-ps1-201ENSMUST00000181079 309 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Mir7062-201ENSMUST00000185038 66 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Gm37698-201ENSMUST00000192605 463 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 CT030161.1-201ENSMUST00000218411 124 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 AC164086.1-201ENSMUST00000221038 289 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 AC114010.1-201ENSMUST00000222060 379 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 AC154552.7-201ENSMUST00000222824 156 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Zfp709-201ENSMUST00000034259 2181 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Zfp934-202ENSMUST00000101547 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Ifi203-201ENSMUST00000042228 3754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Ms4a14-201ENSMUST00000187467 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Gm13479-201ENSMUST00000130773 4722 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Gm9218-201ENSMUST00000121068 2694 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Snord89-201ENSMUST00000104516 110 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Gm15282-201ENSMUST00000117707 300 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Gm15861-201ENSMUST00000120979 339 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Gm23183-201ENSMUST00000122595 323 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Gm22310-201ENSMUST00000157509 116 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Gm23101-201ENSMUST00000157550 137 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Gm23588-201ENSMUST00000157659 99 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Gm26022-201ENSMUST00000158663 108 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Gm14435-203ENSMUST00000172025 192 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Gm17469-201ENSMUST00000177942 498 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Gm17693-201ENSMUST00000178004 498 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Gm21903-201ENSMUST00000178039 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Gm17361-201ENSMUST00000178121 498 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Gm17522-201ENSMUST00000178144 498 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Gm21616-201ENSMUST00000178416 498 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Gm17584-201ENSMUST00000178471 498 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Snhg14-207ENSMUST00000188162 770 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Ighv1-28-201ENSMUST00000192987 351 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Gm43562-201ENSMUST00000196439 238 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Gm44355-201ENSMUST00000200417 104 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rabgef1Q9JM13 Gm24705-201ENSMUST00000082808 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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