Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Gm22365-201ENSMUST00000093750 117 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Cnga3Q9JJZ8 Gm14405-201ENSMUST00000117808 2330 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Gm25543-201ENSMUST00000122678 312 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Gm15281-201ENSMUST00000125181 351 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Gm22791-201ENSMUST00000157232 145 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Gm16038-201ENSMUST00000159317 193 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Gm20462-201ENSMUST00000172623 408 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Gm10717-205ENSMUST00000177601 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Mir6406-201ENSMUST00000183592 120 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Gm10105-201ENSMUST00000184601 270 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Gm29406-201ENSMUST00000186400 235 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Gm7654-201ENSMUST00000186738 683 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Mir1291-201ENSMUST00000199842 117 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Gm45150-201ENSMUST00000206051 467 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Gm16351-202ENSMUST00000209660 337 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Gm5023-201ENSMUST00000217442 587 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Snora34-201ENSMUST00000083402 138 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Gm37602-201ENSMUST00000195187 3310 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Gm23951-201ENSMUST00000104029 132 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Gm13729-201ENSMUST00000120328 406 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Gm25827-201ENSMUST00000157089 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 9230113P08Rik-202ENSMUST00000176153 414 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Gm27722-201ENSMUST00000183908 76 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Gm29397-201ENSMUST00000185205 333 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Gm18357-201ENSMUST00000188184 580 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 AC164161.1-201ENSMUST00000214076 639 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 AC102369.1-201ENSMUST00000218415 373 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 AC122905.2-201ENSMUST00000220325 269 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Gm25402-201ENSMUST00000082966 131 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Gm23731-201ENSMUST00000083749 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Gm23041-201ENSMUST00000083868 106 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Gm44114-201ENSMUST00000203270 2727 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Zfp273-201ENSMUST00000012725 2277 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Zfp735-201ENSMUST00000080407 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Gm22494-201ENSMUST00000104495 128 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Gm6956-201ENSMUST00000134724 546 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Gm22803-201ENSMUST00000158049 283 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Gm23813-201ENSMUST00000175153 77 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Gm43238-201ENSMUST00000196463 359 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Gm43021-201ENSMUST00000198692 337 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Snord43-201ENSMUST00000199549 108 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Olfr152-201ENSMUST00000090709 951 ntAPPRIS P2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Knl1-203ENSMUST00000099542 6525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Mir466f-3-201ENSMUST00000104788 94 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Gm23109-201ENSMUST00000116867 126 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Gm12926-201ENSMUST00000121158 409 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Gm24858-201ENSMUST00000158058 323 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Vmn1r-ps59-201ENSMUST00000172698 199 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 1700015G11Rik-203ENSMUST00000185841 305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Gm28995-201ENSMUST00000186625 261 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Gm29296-201ENSMUST00000188146 320 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Gm28930-201ENSMUST00000189525 437 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Trav15n-3-201ENSMUST00000200498 168 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Gm44010-201ENSMUST00000204432 331 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Olfr184-ps1-201ENSMUST00000205922 516 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Gm44938-201ENSMUST00000208614 427 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Gm34783-201ENSMUST00000209159 303 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Olfr942-ps1-201ENSMUST00000215640 662 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Gm19194-201ENSMUST00000192015 3774 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Olfr1253-203ENSMUST00000215185 4984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Olfr1291-ps1-201ENSMUST00000121345 5403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Gm26500-201ENSMUST00000101867 106 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Gm12351-201ENSMUST00000118727 292 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Gm6829-201ENSMUST00000119858 360 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Defa-ps8-201ENSMUST00000120972 279 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Gm25982-201ENSMUST00000157920 101 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Gm23858-201ENSMUST00000158384 106 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Mir669n-201ENSMUST00000158636 54 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Mir9-3-201ENSMUST00000175497 90 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 4930555M17Rik-201ENSMUST00000176666 402 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Mir7026-201ENSMUST00000184384 67 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Mir3961-201ENSMUST00000198795 59 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Gm42960-201ENSMUST00000202160 241 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Olfr711-203ENSMUST00000216335 4724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 AC125488.1-201ENSMUST00000219586 212 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 AC120540.2-201ENSMUST00000221716 387 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Gm24412-201ENSMUST00000083426 109 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Olfr576-201ENSMUST00000098213 3132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Gm42755-201ENSMUST00000198533 1493 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Mir872-201ENSMUST00000104728 81 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Gm13432-201ENSMUST00000118861 241 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Gm11798-201ENSMUST00000119150 421 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Gm14972-201ENSMUST00000121780 364 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Gm24192-201ENSMUST00000157978 145 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Gm22731-201ENSMUST00000158086 94 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Gm17100-201ENSMUST00000168963 272 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Gm27544-201ENSMUST00000185069 155 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Gm3952-201ENSMUST00000195093 573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Gm37399-201ENSMUST00000195224 416 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Gm44811-201ENSMUST00000209120 228 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 CT009718.1-201ENSMUST00000220784 395 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 AC133598.3-201ENSMUST00000224322 568 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 AC100209.2-201ENSMUST00000224461 451 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Mir301-201ENSMUST00000083655 86 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Mir151-201ENSMUST00000083678 68 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Olfr389-203ENSMUST00000215418 3417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Cnga3Q9JJZ8 Mir758-201ENSMUST00000103260 81 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Cnga3Q9JJZ8 Gm26249-201ENSMUST00000116708 118 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Cnga3Q9JJZ8 Gm12235-201ENSMUST00000118596 170 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Cnga3Q9JJZ8 Gm23435-201ENSMUST00000157183 156 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.1 ms