Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 AC135292.1-201ENSMUST00000227665 204 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Gm22704-201ENSMUST00000083027 137 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Mir137-201ENSMUST00000083635 73 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Gm23039-201ENSMUST00000083870 161 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Olfr1325-202ENSMUST00000216007 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Gm12954-201ENSMUST00000118610 611 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Gm6829-201ENSMUST00000119858 360 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Gm14402-201ENSMUST00000122217 508 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Ear-ps8-201ENSMUST00000161935 354 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Gm18341-201ENSMUST00000197538 622 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 AL603834.1-201ENSMUST00000198372 121 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 4930598N05Rik-207ENSMUST00000208997 83 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Gm18000-201ENSMUST00000212153 800 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 AC157476.1-201ENSMUST00000215555 169 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 AC131759.1-201ENSMUST00000220642 310 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Gm26327-201ENSMUST00000093724 111 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Cp-202ENSMUST00000091309 4029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Olfr352-202ENSMUST00000217325 3337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Gm23128-201ENSMUST00000104257 132 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Gm9119-201ENSMUST00000118866 495 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Gm12325-201ENSMUST00000135553 320 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Gm26277-201ENSMUST00000157097 152 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Gm25914-201ENSMUST00000157618 153 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Scgb2b14-ps-201ENSMUST00000189424 336 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Gm23128-202ENSMUST00000196578 133 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Gm44425-201ENSMUST00000203739 429 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Gm44524-201ENSMUST00000203899 271 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Gm6796-201ENSMUST00000211919 243 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 AC188459.1-201ENSMUST00000216651 300 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 4930520P13Rik-201ENSMUST00000222622 505 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 n-R5s176-201ENSMUST00000082683 109 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Gm23850-201ENSMUST00000083830 169 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Olfr109-203ENSMUST00000214938 5550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Olfr679-204ENSMUST00000215704 5018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r82-203ENSMUST00000227672 3651 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Igkv17-127-201ENSMUST00000103309 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Gm23584-201ENSMUST00000157655 129 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Gm17364-201ENSMUST00000163881 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Mir3092-201ENSMUST00000174954 96 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Mir3076-201ENSMUST00000175415 60 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Gm24106-201ENSMUST00000175498 127 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Gm27761-201ENSMUST00000184091 131 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Snhg14-203ENSMUST00000185815 670 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Gm37997-201ENSMUST00000193515 267 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 D730003K21Rik-201ENSMUST00000215052 589 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Gm29521-204ENSMUST00000216859 279 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 AC165293.1-201ENSMUST00000219669 329 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Gm24966-201ENSMUST00000082443 79 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Zfp729b-201ENSMUST00000012873 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Olfr592-202ENSMUST00000106893 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Gm43256-201ENSMUST00000199995 3091 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Traj56-201ENSMUST00000103689 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Gm24132-201ENSMUST00000104745 91 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Gm8260-201ENSMUST00000119230 353 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Gm11204-201ENSMUST00000122438 147 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 DQ267100-201ENSMUST00000122600 72 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Gm22521-201ENSMUST00000158272 134 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Mir3103-201ENSMUST00000175474 67 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Mir6370-201ENSMUST00000183510 120 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Gm27869-201ENSMUST00000184327 122 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Gm43220-201ENSMUST00000199299 282 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Gm44256-201ENSMUST00000203304 335 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Gm9967-203ENSMUST00000206903 408 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Gm45452-201ENSMUST00000210905 177 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 AC160984.2-201ENSMUST00000224927 791 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 AC154213.2-201ENSMUST00000227138 187 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Gm25856-201ENSMUST00000082786 75 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Gm24164-201ENSMUST00000093663 104 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Olfr1369-ps1-205ENSMUST00000215941 3597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Nlrp9a-201ENSMUST00000071780 3125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 AC122850.1-201ENSMUST00000220380 5690 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Olfr68-202ENSMUST00000216811 4093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Olfr299-202ENSMUST00000217253 4479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Olfr1168-202ENSMUST00000215996 2322 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Igkv6-13-201ENSMUST00000103395 287 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Mir466p-201ENSMUST00000103925 89 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Mir466k-201ENSMUST00000116774 122 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Gm15183-201ENSMUST00000118933 348 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Gm24443-201ENSMUST00000157242 132 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Gm22883-201ENSMUST00000157376 106 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Gm24716-201ENSMUST00000157524 104 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Gm7582-201ENSMUST00000160831 603 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Gm5269-201ENSMUST00000183590 138 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Gm36189-201ENSMUST00000204113 523 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Gm5002-201ENSMUST00000207145 223 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 CAAA01090905.1-201ENSMUST00000219056 426 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Gm18188-201ENSMUST00000219386 478 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Muc16-204ENSMUST00000208663 25437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r87-202ENSMUST00000211249 1835 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Gm5141-202ENSMUST00000201047 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Slco6c1-202ENSMUST00000189547 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Gm23183-201ENSMUST00000122595 323 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Mir1967-201ENSMUST00000157789 82 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Gm22097-201ENSMUST00000157929 278 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Gm16111-201ENSMUST00000162128 285 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Snord93-201ENSMUST00000175580 71 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Obox4-ps37-201ENSMUST00000177223 276 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Mir103-2-201ENSMUST00000083629 86 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Gm37479-201ENSMUST00000194169 3841 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r211-202ENSMUST00000228645 5447 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
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