Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Gm25316-201ENSMUST00000116826 118 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rab11fip1Q9D620 Gm11936-201ENSMUST00000118323 160 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rab11fip1Q9D620 Gm12793-201ENSMUST00000119268 292 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rab11fip1Q9D620 Gm12071-201ENSMUST00000121968 469 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rab11fip1Q9D620 Gm16218-201ENSMUST00000155424 388 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rab11fip1Q9D620 Gm24885-201ENSMUST00000158783 270 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rab11fip1Q9D620 Gm24487-201ENSMUST00000178017 63 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rab11fip1Q9D620 Gm22621-201ENSMUST00000179678 74 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rab11fip1Q9D620 Trav6-3-202ENSMUST00000183604 305 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rab11fip1Q9D620 Trav6d-3-202ENSMUST00000184883 308 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rab11fip1Q9D620 Scgb3a2-203ENSMUST00000189750 578 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rab11fip1Q9D620 Trav5d-2-201ENSMUST00000196107 275 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rab11fip1Q9D620 Gm23370-202ENSMUST00000197008 129 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rab11fip1Q9D620 Trav5n-2-201ENSMUST00000197136 275 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rab11fip1Q9D620 Gm44459-201ENSMUST00000203926 160 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rab11fip1Q9D620 Gm32817-202ENSMUST00000210738 527 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rab11fip1Q9D620 AC122465.2-201ENSMUST00000221774 354 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rab11fip1Q9D620 Ppp1r3a-201ENSMUST00000045096 6965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rab11fip1Q9D620 Olfr630-201ENSMUST00000106880 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rab11fip1Q9D620 Gm36989-201ENSMUST00000193225 2160 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rab11fip1Q9D620 Gm42770-201ENSMUST00000199657 4155 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rab11fip1Q9D620 Gm14327-202ENSMUST00000108935 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rab11fip1Q9D620 Gm15215-201ENSMUST00000117773 489 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rab11fip1Q9D620 Gm12646-201ENSMUST00000119144 238 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rab11fip1Q9D620 Gm11794-201ENSMUST00000119446 237 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rab11fip1Q9D620 Gm14792-201ENSMUST00000119725 258 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rab11fip1Q9D620 Rpl31-ps6-201ENSMUST00000119959 378 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rab11fip1Q9D620 Gm14551-201ENSMUST00000120802 256 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rab11fip1Q9D620 Gm23641-201ENSMUST00000157857 101 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rab11fip1Q9D620 Gm24056-201ENSMUST00000158617 146 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rab11fip1Q9D620 Gm25718-201ENSMUST00000158632 118 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rab11fip1Q9D620 Gm25956-201ENSMUST00000175115 217 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rab11fip1Q9D620 Gm21798-201ENSMUST00000180105 261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rab11fip1Q9D620 Gm42739-201ENSMUST00000200687 226 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rab11fip1Q9D620 Gm19118-201ENSMUST00000222554 98 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rab11fip1Q9D620 Trdn-201ENSMUST00000095762 4514 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rab11fip1Q9D620 Olfr1046-202ENSMUST00000213987 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rab11fip1Q9D620 Zfp119a-201ENSMUST00000079642 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
Rab11fip1Q9D620 Gm13439-201ENSMUST00000117541 409 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rab11fip1Q9D620 Gm14978-201ENSMUST00000129000 304 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Rab11fip1Q9D620 Gm15961-201ENSMUST00000156090 266 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Rab11fip1Q9D620 Gm24997-201ENSMUST00000157910 105 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rab11fip1Q9D620 Gm24900-201ENSMUST00000158128 134 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rab11fip1Q9D620 Gm25162-201ENSMUST00000158906 159 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rab11fip1Q9D620 Gm22308-201ENSMUST00000177609 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rab11fip1Q9D620 Gm27521-201ENSMUST00000184022 64 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rab11fip1Q9D620 Gm27997-201ENSMUST00000184942 69 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rab11fip1Q9D620 Gm44960-201ENSMUST00000207403 141 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rab11fip1Q9D620 4930431P19Rik-201ENSMUST00000207570 451 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rab11fip1Q9D620 Gm7065-201ENSMUST00000222150 474 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rab11fip1Q9D620 AC173345.1-201ENSMUST00000222837 306 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Rab11fip1Q9D620 CT010454.1-201ENSMUST00000225975 265 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rab11fip1Q9D620 Gm22997-201ENSMUST00000082845 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rab11fip1Q9D620 Gm22443-201ENSMUST00000082890 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rab11fip1Q9D620 Gm23041-201ENSMUST00000083868 106 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rab11fip1Q9D620 Gm1980-201ENSMUST00000123131 2306 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Rab11fip1Q9D620 Ccdc178-201ENSMUST00000025160 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
Rab11fip1Q9D620 Gm22674-201ENSMUST00000104413 131 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rab11fip1Q9D620 Gm12721-201ENSMUST00000120621 268 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rab11fip1Q9D620 Gm15213-201ENSMUST00000122098 216 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rab11fip1Q9D620 n-R5s164-201ENSMUST00000122664 112 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rab11fip1Q9D620 Mir1942-201ENSMUST00000157274 63 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rab11fip1Q9D620 Gm22814-201ENSMUST00000157452 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rab11fip1Q9D620 Gm24729-201ENSMUST00000158225 137 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rab11fip1Q9D620 Gm23759-201ENSMUST00000158351 268 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rab11fip1Q9D620 Gm24501-201ENSMUST00000158452 62 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rab11fip1Q9D620 Gm22093-201ENSMUST00000158980 111 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rab11fip1Q9D620 Gm6660-201ENSMUST00000179149 468 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rab11fip1Q9D620 Gm25121-201ENSMUST00000179846 79 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rab11fip1Q9D620 Mir6355-201ENSMUST00000183687 106 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rab11fip1Q9D620 Mir7081-201ENSMUST00000184490 75 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rab11fip1Q9D620 Gm2077-201ENSMUST00000195017 319 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rab11fip1Q9D620 Mir497-201ENSMUST00000200557 84 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rab11fip1Q9D620 Scgb2b2-202ENSMUST00000205821 357 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rab11fip1Q9D620 Gm9377-201ENSMUST00000207227 623 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rab11fip1Q9D620 Olfr1315-ps1-202ENSMUST00000208654 945 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rab11fip1Q9D620 Gm45365-201ENSMUST00000209489 256 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rab11fip1Q9D620 Gm45941-202ENSMUST00000223144 389 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rab11fip1Q9D620 Defb40-201ENSMUST00000066258 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rab11fip1Q9D620 Gm23625-201ENSMUST00000082457 100 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rab11fip1Q9D620 Gm24044-201ENSMUST00000083107 156 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rab11fip1Q9D620 Gm22154-201ENSMUST00000083844 131 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rab11fip1Q9D620 Gm10222-201ENSMUST00000088336 294 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rab11fip1Q9D620 Gm26327-201ENSMUST00000093724 111 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rab11fip1Q9D620 Gm44527-201ENSMUST00000182210 2945 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rab11fip1Q9D620 C230088H06Rik-202ENSMUST00000181752 3010 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rab11fip1Q9D620 Olfr1105-202ENSMUST00000215978 3012 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rab11fip1Q9D620 Gm26500-201ENSMUST00000101867 106 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rab11fip1Q9D620 Gm24172-201ENSMUST00000104127 117 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rab11fip1Q9D620 Mir1195-201ENSMUST00000116818 98 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rab11fip1Q9D620 Gm15183-201ENSMUST00000118933 348 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rab11fip1Q9D620 Gm24629-201ENSMUST00000122762 89 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rab11fip1Q9D620 Gm25054-201ENSMUST00000157370 97 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rab11fip1Q9D620 Gm22382-201ENSMUST00000158185 130 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rab11fip1Q9D620 Gm24005-201ENSMUST00000158459 296 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rab11fip1Q9D620 Gm23196-201ENSMUST00000158806 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rab11fip1Q9D620 Ighv1-78-201ENSMUST00000163670 294 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rab11fip1Q9D620 Gm24084-201ENSMUST00000175173 137 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rab11fip1Q9D620 Gm24304-201ENSMUST00000177635 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rab11fip1Q9D620 Gm24415-201ENSMUST00000180218 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.3 ms