Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm21094-201ENSMUST00000177842 498 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Gm20837-201ENSMUST00000178446 498 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Gm21739-201ENSMUST00000178639 498 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Gm28891-201ENSMUST00000178751 498 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Gm28490-201ENSMUST00000179076 498 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Gm22510-201ENSMUST00000179304 79 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Gm26336-201ENSMUST00000179449 79 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Gm21861-201ENSMUST00000179480 498 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Gm26390-201ENSMUST00000179628 79 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Gm21256-201ENSMUST00000179672 498 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Gm20838-201ENSMUST00000179884 498 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Gm21679-201ENSMUST00000180373 498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Gm8151-201ENSMUST00000184817 871 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Gm28912-201ENSMUST00000189001 234 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Gm18296-201ENSMUST00000192475 783 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Gm37027-201ENSMUST00000194642 256 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Gm43911-201ENSMUST00000203097 76 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Gm44282-201ENSMUST00000203199 190 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Clec4a4-201ENSMUST00000079379 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Gm18360-201ENSMUST00000173327 1524 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Olfr1002-202ENSMUST00000215548 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Gm26049-201ENSMUST00000157313 108 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Scarna3b-201ENSMUST00000157533 139 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Gm22315-201ENSMUST00000158010 143 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 2310075C17Rik-201ENSMUST00000161216 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 4930518C09Rik-201ENSMUST00000172700 478 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Mir3098-201ENSMUST00000175416 87 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Gm21754-201ENSMUST00000177550 479 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Gm27894-201ENSMUST00000184177 92 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Gm29640-201ENSMUST00000187972 278 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Gm29352-201ENSMUST00000188054 544 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 AC123709.1-201ENSMUST00000224848 345 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 AC126939.3-201ENSMUST00000226061 166 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Mir410-201ENSMUST00000083563 81 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Pcdh11x-208ENSMUST00000193899 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Mir743b-201ENSMUST00000104751 77 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Gm25102-201ENSMUST00000122479 112 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Oosp2-202ENSMUST00000135994 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Gm23557-201ENSMUST00000157820 138 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Gm29005-201ENSMUST00000186773 320 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 184 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Gm45207-201ENSMUST00000207469 145 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Gm44654-201ENSMUST00000208052 329 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 AC153541.1-201ENSMUST00000213786 294 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Snord14a-201ENSMUST00000082807 87 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Gm24977-201ENSMUST00000083106 163 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 AC124456.1-201ENSMUST00000217391 2597 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Gm11407-201ENSMUST00000120362 1058 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Gm15861-201ENSMUST00000120979 339 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Nell1os-201ENSMUST00000134584 489 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Gm23221-201ENSMUST00000158118 93 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Gm20874-201ENSMUST00000178356 663 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Gm22263-201ENSMUST00000180060 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Ranbp2-ps4-201ENSMUST00000183481 385 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Gm27226-201ENSMUST00000184676 511 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Gm27385-201ENSMUST00000184747 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Gm28453-203ENSMUST00000187041 189 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 1700010N08Rik-201ENSMUST00000187456 189 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Ighv2-8-201ENSMUST00000193935 262 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Gm43245-201ENSMUST00000197603 468 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Obox4-ps25-201ENSMUST00000199090 210 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Gm42857-201ENSMUST00000200823 339 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Gm44429-201ENSMUST00000203542 186 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Gm45315-201ENSMUST00000209283 333 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 mt-Co3-201ENSMUST00000082409 784 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 AC154515.1-201ENSMUST00000226085 2841 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Mir374b-201ENSMUST00000102314 95 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Gm23854-201ENSMUST00000158378 108 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Ska2l-ps-201ENSMUST00000186208 360 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Gm29603-201ENSMUST00000186792 334 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Vamp4-208ENSMUST00000194810 600 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Gm43035-201ENSMUST00000197626 517 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Scgb2b2-202ENSMUST00000205821 357 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Olfr1481-ps1-201ENSMUST00000207312 134 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 AC167669.4-201ENSMUST00000225967 140 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 CT025538.2-201ENSMUST00000226083 772 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Gm24623-201ENSMUST00000082616 194 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 AC133079.1-201ENSMUST00000220943 1881 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Gm21814-203ENSMUST00000203729 1352 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Gm44240-201ENSMUST00000204015 2654 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Gm24282-201ENSMUST00000104232 66 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Gm22027-201ENSMUST00000122737 127 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Gm23523-201ENSMUST00000180190 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Gm11392-201ENSMUST00000181419 710 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 1700029M03Rik-201ENSMUST00000187300 444 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Gm43723-201ENSMUST00000196886 189 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Gm43140-201ENSMUST00000197317 456 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 AC162387.1-201ENSMUST00000213369 213 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 AC134334.1-201ENSMUST00000214277 255 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Gm7495-201ENSMUST00000215099 426 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 AC160863.1-201ENSMUST00000218412 317 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 AC152414.2-201ENSMUST00000219620 537 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Gm10092-201ENSMUST00000077110 180 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Gm26066-201ENSMUST00000083385 109 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Mir221-201ENSMUST00000083488 95 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Zfp981-203ENSMUST00000179175 2953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Gm37061-201ENSMUST00000195066 3243 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Gm12417-201ENSMUST00000119153 403 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Gm11606-201ENSMUST00000120706 617 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Zbed3Q9D0L1 Gm13153-201ENSMUST00000120969 637 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
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