Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 2310075C17Rik-201ENSMUST00000161216 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps59-201ENSMUST00000172698 199 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Smr3a-202ENSMUST00000189633 467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 1700024I08Rik-202ENSMUST00000222074 407 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 AC159885.1-201ENSMUST00000222221 199 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 AC144733.1-201ENSMUST00000222893 1289 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 AC123709.1-201ENSMUST00000224848 345 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Mir340-201ENSMUST00000083483 98 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm8935-202ENSMUST00000105727 1959 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Gm44240-201ENSMUST00000204015 2654 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Olfr141-201ENSMUST00000216117 2935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Mir374b-201ENSMUST00000102314 95 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Traj26-201ENSMUST00000103715 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Gm23907-201ENSMUST00000104595 189 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Gm13457-201ENSMUST00000117885 267 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Gm14775-201ENSMUST00000122089 310 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Gm23212-201ENSMUST00000122718 60 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Gm10721-201ENSMUST00000143083 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Gm16225-201ENSMUST00000146152 276 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Gm25054-201ENSMUST00000157370 97 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Trbv22-201ENSMUST00000191697 291 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Gm44337-201ENSMUST00000196553 114 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Mir7118-201ENSMUST00000197760 61 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 AC163357.1-201ENSMUST00000220847 233 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Gm24623-201ENSMUST00000082616 194 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Gm22972-201ENSMUST00000083297 131 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Gm10718-201ENSMUST00000099046 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Gm42639-201ENSMUST00000197061 1871 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Gm25832-201ENSMUST00000104140 130 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Gm24338-201ENSMUST00000104205 127 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Gm25495-201ENSMUST00000104431 131 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Gm23854-201ENSMUST00000158378 108 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Gm26501-201ENSMUST00000178307 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Gm26936-201ENSMUST00000182424 382 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Gm28995-201ENSMUST00000186625 261 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Gm29005-201ENSMUST00000186773 320 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 1700029M03Rik-201ENSMUST00000187300 444 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Gm38041-201ENSMUST00000194445 661 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Gm44483-201ENSMUST00000197203 97 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Trav15d-3-201ENSMUST00000198604 167 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Trav15n-3-201ENSMUST00000200498 168 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 AC153541.1-201ENSMUST00000213786 294 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Gm21937-201ENSMUST00000222825 218 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Snord14a-201ENSMUST00000082807 87 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Gm25859-201ENSMUST00000083710 91 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Gm25651-201ENSMUST00000083782 119 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Ighv3-1-201ENSMUST00000103478 350 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Gm24282-201ENSMUST00000104232 66 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Vma21-ps-201ENSMUST00000114578 306 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Gm26249-201ENSMUST00000116708 118 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Gm22193-201ENSMUST00000116868 76 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Nell1os-201ENSMUST00000134584 489 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Gm23230-201ENSMUST00000157298 133 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Gm22221-201ENSMUST00000157362 103 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Gm26150-201ENSMUST00000157426 151 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Gm25423-201ENSMUST00000157609 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Gm25163-201ENSMUST00000158905 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 9230113P08Rik-202ENSMUST00000176153 414 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Gm27711-201ENSMUST00000183802 118 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Gm8151-201ENSMUST00000184817 871 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Gm29640-201ENSMUST00000187972 278 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Gm37658-201ENSMUST00000192672 315 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Gm34073-201ENSMUST00000195736 212 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Gm45116-201ENSMUST00000207392 275 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Snora3-201ENSMUST00000083082 132 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Gm37061-201ENSMUST00000195066 3243 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 AC164629.4-201ENSMUST00000218505 3247 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Gm11857-201ENSMUST00000119817 324 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 n-R5s150-201ENSMUST00000122705 108 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Gm24901-201ENSMUST00000158125 110 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Gm23289-201ENSMUST00000175615 108 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 4930598A11Rik-201ENSMUST00000180742 628 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Gm21064-202ENSMUST00000190583 278 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 AC129202.1-201ENSMUST00000224895 526 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 AC167669.4-201ENSMUST00000225967 140 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 AC126939.3-201ENSMUST00000226061 166 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Gm10092-201ENSMUST00000077110 180 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Mir221-201ENSMUST00000083488 95 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Gm15162-201ENSMUST00000119325 283 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Rpl31-ps6-201ENSMUST00000119959 378 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Sval2-203ENSMUST00000120605 497 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Gm22027-201ENSMUST00000122737 127 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Gm16038-201ENSMUST00000159317 193 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 6430573P05Rik-201ENSMUST00000192562 508 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Gm43723-201ENSMUST00000196886 189 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Gm44429-201ENSMUST00000203542 186 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 AL772265.1-201ENSMUST00000214379 305 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 AC192333.2-201ENSMUST00000224771 196 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Snord118-201ENSMUST00000082965 135 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Gm25896-201ENSMUST00000083713 136 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Gm25507-201ENSMUST00000116981 144 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Gm14355-201ENSMUST00000117352 264 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Gm25102-201ENSMUST00000122479 112 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Gm14364-201ENSMUST00000129209 267 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Gm24915-201ENSMUST00000157288 78 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Gm25914-201ENSMUST00000157618 153 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Gm23411-201ENSMUST00000157988 62 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Gm26405-201ENSMUST00000158495 100 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Gm8871-202ENSMUST00000168945 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Ccdc47Q9D024 Gm10715-202ENSMUST00000177969 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
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