Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Gm43993-201ENSMUST00000203972 247 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Olfr1483-ps1-201ENSMUST00000208241 334 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm18346-201ENSMUST00000216782 325 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 AC069074.2-201ENSMUST00000217819 428 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm24474-201ENSMUST00000220504 469 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 AC122465.2-201ENSMUST00000221774 354 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 n-R5s197-201ENSMUST00000083302 119 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm26175-201ENSMUST00000083794 131 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm22154-201ENSMUST00000083844 131 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Rgs13-201ENSMUST00000052375 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Olfr229-202ENSMUST00000214904 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Vmn2r70-201ENSMUST00000168230 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Olfr868-202ENSMUST00000212999 4233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Ighv9-3-201ENSMUST00000103473 351 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm25539-201ENSMUST00000116886 122 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm12434-201ENSMUST00000141580 653 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm25280-201ENSMUST00000157269 101 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm23858-201ENSMUST00000158384 106 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm24501-201ENSMUST00000158452 62 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm17689-201ENSMUST00000170030 330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm27220-201ENSMUST00000183453 262 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm27249-201ENSMUST00000185049 328 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 AC130477.2-201ENSMUST00000228158 274 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm10542-201ENSMUST00000097586 273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm42635-201ENSMUST00000200266 2571 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Snhg14-213ENSMUST00000190666 3708 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Cyp3a59-201ENSMUST00000035571 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm3055-202ENSMUST00000218939 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Zfp781-202ENSMUST00000219144 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm23941-201ENSMUST00000101953 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Traj39-201ENSMUST00000103703 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm14748-201ENSMUST00000119819 411 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm15669-201ENSMUST00000147834 526 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm12510-201ENSMUST00000152190 362 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm23980-201ENSMUST00000157135 158 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm23535-201ENSMUST00000157542 106 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm25373-201ENSMUST00000158156 115 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm25253-201ENSMUST00000179958 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm37377-201ENSMUST00000191733 304 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Klk1b28-ps-201ENSMUST00000206374 217 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Olfr772-202ENSMUST00000214672 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Olfr746-201ENSMUST00000080616 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 F8-202ENSMUST00000114085 7295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Olfr1240-202ENSMUST00000216123 4603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
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Sgo1Q9CXH7 Gm11862-201ENSMUST00000119678 659 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Gm23983-201ENSMUST00000157142 114 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Gm26157-201ENSMUST00000158974 126 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 4930473D10Rik-201ENSMUST00000161975 487 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
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Sgo1Q9CXH7 Gm27271-201ENSMUST00000183509 170 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Gm27997-201ENSMUST00000184942 69 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Gm45005-201ENSMUST00000206640 157 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Defb21-201ENSMUST00000070722 427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
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Sgo1Q9CXH7 Gm23845-201ENSMUST00000083834 152 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Gm9218-201ENSMUST00000121068 2694 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Snhg14-209ENSMUST00000188976 2193 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
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Sgo1Q9CXH7 Gm15101-201ENSMUST00000178818 1502 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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Sgo1Q9CXH7 Gm13942-201ENSMUST00000136950 325 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
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Sgo1Q9CXH7 Gm11786-201ENSMUST00000120799 155 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Gm24627-201ENSMUST00000122764 138 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Gm13793-201ENSMUST00000124214 438 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Mir3965-201ENSMUST00000175570 69 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Mir7k-201ENSMUST00000184115 110 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Gm43722-201ENSMUST00000196054 124 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Mir7232-201ENSMUST00000197929 74 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Gm3724-201ENSMUST00000197957 349 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Mir9-1-201ENSMUST00000199907 89 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Gm20144-201ENSMUST00000203031 165 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Gm34314-201ENSMUST00000203622 367 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 AC173345.2-201ENSMUST00000222795 153 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 AC183092.1-201ENSMUST00000224301 153 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 1700019M22Rik-201ENSMUST00000073560 354 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Olfr1161-203ENSMUST00000217006 3647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Vmn1r28-201ENSMUST00000226813 10877 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 Vmn1r28-202ENSMUST00000227805 10892 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Sgo1Q9CXH7 AL645643.1-201ENSMUST00000222438 3897 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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