Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 4930596I21Rik-201ENSMUST00000200494 461 ntTSL 1 (best) BASIC-0.12□□□□□ -2.43
PtprtQ99M80 Gm18213-201ENSMUST00000207850 178 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PtprtQ99M80 AC152414.2-201ENSMUST00000219620 537 ntTSL 1 (best) BASIC-0.12□□□□□ -2.43
PtprtQ99M80 AC120540.1-201ENSMUST00000221879 324 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PtprtQ99M80 Gm24456-201ENSMUST00000083198 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
PtprtQ99M80 AC164297.1-201ENSMUST00000224484 1561 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PtprtQ99M80 Gm23202-201ENSMUST00000104376 129 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PtprtQ99M80 Gm22607-201ENSMUST00000158291 105 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PtprtQ99M80 Gm22234-201ENSMUST00000174906 65 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PtprtQ99M80 Cldn34c3-201ENSMUST00000178148 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
PtprtQ99M80 Gm22252-201ENSMUST00000179316 79 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PtprtQ99M80 Gm21978-201ENSMUST00000179696 377 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PtprtQ99M80 Esp18-201ENSMUST00000179848 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
PtprtQ99M80 Gm26914-201ENSMUST00000182262 223 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PtprtQ99M80 Gm27522-201ENSMUST00000183949 230 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PtprtQ99M80 Gm23370-201ENSMUST00000199545 130 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PtprtQ99M80 Gm34783-201ENSMUST00000209159 303 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PtprtQ99M80 Gm45541-201ENSMUST00000210443 54 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PtprtQ99M80 AC162931.1-201ENSMUST00000214184 267 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PtprtQ99M80 AC156794.1-201ENSMUST00000214415 214 ntTSL 5 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
PtprtQ99M80 Mir325-201ENSMUST00000083491 98 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
PtprtQ99M80 Gm12730-201ENSMUST00000125277 291 ntTSL 5 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
PtprtQ99M80 Gm27396-201ENSMUST00000157708 58 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PtprtQ99M80 Gm22668-201ENSMUST00000158716 260 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PtprtQ99M80 Gm23090-201ENSMUST00000177331 78 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PtprtQ99M80 Gm28560-201ENSMUST00000186091 315 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PtprtQ99M80 Gm28334-201ENSMUST00000186653 315 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
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PtprtQ99M80 Gm28481-201ENSMUST00000189231 315 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PtprtQ99M80 Gm29059-201ENSMUST00000191534 315 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
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PtprtQ99M80 Gm18747-201ENSMUST00000198129 648 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PtprtQ99M80 Igkv13-55-1-201ENSMUST00000200400 308 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
PtprtQ99M80 Gm39154-201ENSMUST00000210257 560 ntTSL 5 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
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PtprtQ99M80 Eif3s6-ps2-201ENSMUST00000163304 219 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PtprtQ99M80 Vmn2r-ps62-201ENSMUST00000174119 616 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PtprtQ99M80 1700029M03Rik-201ENSMUST00000187300 444 ntTSL 1 (best) BASIC-0.15□□□□□ -2.43
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PtprtQ99M80 AC161250.2-201ENSMUST00000215114 3107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
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PtprtQ99M80 A130030D18Rik-201ENSMUST00000128608 654 ntTSL 1 (best) BASIC-0.16□□□□□ -2.44
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PtprtQ99M80 1700031L13Rik-204ENSMUST00000188072 812 ntTSL 5 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
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PtprtQ99M80 Gm6105-201ENSMUST00000200580 624 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
PtprtQ99M80 Gm43955-201ENSMUST00000204332 142 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
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PtprtQ99M80 n-R5s42-201ENSMUST00000082697 104 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
PtprtQ99M80 Gm23939-201ENSMUST00000082880 133 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
PtprtQ99M80 Gm25650-201ENSMUST00000083784 162 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
PtprtQ99M80 AC124426.1-203ENSMUST00000221814 1362 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
PtprtQ99M80 Gm37096-201ENSMUST00000192317 2058 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
PtprtQ99M80 Gm14566-201ENSMUST00000118915 321 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
PtprtQ99M80 Gm11583-201ENSMUST00000132296 466 ntTSL 5 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
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