Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Gm43250-201ENSMUST00000196536 273 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Usp38Q8BW70 Gm44490-201ENSMUST00000198566 127 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Usp38Q8BW70 Gm45296-201ENSMUST00000209625 205 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Usp38Q8BW70 Gm22571-201ENSMUST00000082984 70 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Usp38Q8BW70 Cd209e-201ENSMUST00000033888 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Usp38Q8BW70 Olfr974-202ENSMUST00000213246 3561 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Usp38Q8BW70 Olfr726-204ENSMUST00000215105 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Usp38Q8BW70 Olfr1309-205ENSMUST00000216948 5168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Usp38Q8BW70 C230088H06Rik-202ENSMUST00000181752 3010 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.97
Usp38Q8BW70 Olfr298-204ENSMUST00000217110 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Gm26473-201ENSMUST00000116763 127 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Rpl31-ps22-201ENSMUST00000117961 337 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Gm13967-201ENSMUST00000120404 380 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Gm23232-201ENSMUST00000157300 105 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Gm23223-201ENSMUST00000158119 127 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Gm22389-201ENSMUST00000158193 301 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Gm24771-201ENSMUST00000158508 137 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Mir6925-201ENSMUST00000197857 70 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Trav14-1-201ENSMUST00000198297 399 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Gm34599-201ENSMUST00000198924 288 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Mir497-201ENSMUST00000200557 84 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Gm44010-201ENSMUST00000204432 331 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 AL731706.1-202ENSMUST00000226652 180 ntAPPRIS P5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Gm26314-201ENSMUST00000083891 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Ifi203-202ENSMUST00000081216 3610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Gm14020-201ENSMUST00000118165 662 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Gm14792-201ENSMUST00000119725 258 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Gm16117-201ENSMUST00000160544 324 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Gm23714-201ENSMUST00000179259 105 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Gm27402-201ENSMUST00000183890 120 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Gm27747-201ENSMUST00000184707 85 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Gm37923-201ENSMUST00000191624 161 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Ighv1-1-201ENSMUST00000194912 291 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Gm18341-201ENSMUST00000197538 622 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Gm20083-201ENSMUST00000205849 751 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 AC155715.1-201ENSMUST00000213575 463 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 AC124524.1-201ENSMUST00000225833 181 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 AC151833.1-201ENSMUST00000227752 574 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Gm10298-201ENSMUST00000074801 265 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Gm23727-201ENSMUST00000083352 164 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Gm25896-201ENSMUST00000083713 136 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 AC125374.3-201ENSMUST00000214983 2810 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Hsf3-202ENSMUST00000119035 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Olfr606-203ENSMUST00000217250 2313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Gm27723-201ENSMUST00000157398 63 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Gm24348-201ENSMUST00000158710 130 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Vmn1r-ps83-201ENSMUST00000172677 705 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 CT030166.2-201ENSMUST00000222021 368 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 AC154271.1-201ENSMUST00000224780 383 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 AC123860.1-201ENSMUST00000228033 481 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 AC165284.1-201ENSMUST00000228614 458 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Gm23453-201ENSMUST00000083326 106 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Gm10222-201ENSMUST00000088336 294 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Olfr135-202ENSMUST00000213217 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Gm10400-201ENSMUST00000203920 3835 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Gm43780-201ENSMUST00000196510 3600 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Gm15526-201ENSMUST00000112504 204 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Gm15183-201ENSMUST00000118933 348 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Gm11572-201ENSMUST00000119164 120 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Gm15162-201ENSMUST00000119325 283 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Gm11794-201ENSMUST00000119446 237 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Gm12443-201ENSMUST00000122308 323 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Gm13656-201ENSMUST00000123829 345 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Gm11240-201ENSMUST00000142047 751 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Gm23559-201ENSMUST00000157824 103 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Gm23474-201ENSMUST00000158884 75 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Gm23355-201ENSMUST00000177614 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Gm25450-201ENSMUST00000179144 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Gm23148-201ENSMUST00000180367 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Gm27991-201ENSMUST00000184804 137 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Gm37713-201ENSMUST00000191746 198 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Gm33051-201ENSMUST00000192940 274 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Gm43427-201ENSMUST00000198188 331 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Gm43626-201ENSMUST00000198575 162 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Gm8013-201ENSMUST00000200139 462 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Gm44408-201ENSMUST00000200205 66 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Gm15235-201ENSMUST00000200572 194 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Vmn2r-ps50-201ENSMUST00000209317 120 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 AC145736.2-201ENSMUST00000216305 365 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Gm40810-201ENSMUST00000219149 253 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 AC093316.2-201ENSMUST00000220015 172 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Gm7214-201ENSMUST00000222428 272 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 AC127578.1-201ENSMUST00000227289 93 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Gm25258-201ENSMUST00000083049 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Gm26497-201ENSMUST00000083146 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Gm26327-201ENSMUST00000093724 111 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Olfr1437-202ENSMUST00000207241 3751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Gm45178-201ENSMUST00000207744 4110 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Olfr1354-202ENSMUST00000204587 3781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Ifi203-201ENSMUST00000042228 3754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Vmn1r67-202ENSMUST00000226237 2352 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Olfr1463-202ENSMUST00000207246 2315 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Mir542-201ENSMUST00000102186 85 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Gm24282-201ENSMUST00000104232 66 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Gm6444-201ENSMUST00000119611 458 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Gm28825-201ENSMUST00000186233 238 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Gm29242-201ENSMUST00000186570 457 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Gm38060-201ENSMUST00000194822 464 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Gm44524-201ENSMUST00000203899 271 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Usp38Q8BW70 Gm45365-201ENSMUST00000209489 256 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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