Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Gm22535-201ENSMUST00000158174 119 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Gm24308-201ENSMUST00000177773 114 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Igkv2-93-1-201ENSMUST00000196774 272 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Trav15d-3-201ENSMUST00000198604 167 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Vmn1r-ps13-201ENSMUST00000204697 134 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Gm45445-201ENSMUST00000209586 232 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 AC155715.1-201ENSMUST00000213575 463 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Olfr1064-ps1-201ENSMUST00000213670 600 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 AC027184.1-201ENSMUST00000226991 424 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Gm25628-201ENSMUST00000084002 105 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 AC123052.1-201ENSMUST00000220604 4616 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Gm10033-201ENSMUST00000072427 1813 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Gm20939-201ENSMUST00000108007 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Gm25888-201ENSMUST00000157778 302 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Gm29005-201ENSMUST00000186773 320 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Gm37377-201ENSMUST00000191733 304 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Gm37566-201ENSMUST00000192363 4355 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Gm25820-202ENSMUST00000197479 128 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Gm43626-201ENSMUST00000198575 162 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Gm43978-201ENSMUST00000203491 451 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Gm2511-201ENSMUST00000205521 457 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Olfr1483-ps1-201ENSMUST00000208241 334 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Gm18617-201ENSMUST00000222311 259 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Gm24152-201ENSMUST00000082764 163 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Zfp280c-202ENSMUST00000076635 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Olfr1309-205ENSMUST00000216948 5168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Olfr183-201ENSMUST00000073320 2040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Gm45844-205ENSMUST00000210333 3861 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Mir465b-1-201ENSMUST00000103940 79 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Mir465b-2-201ENSMUST00000104662 79 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Gm11115-201ENSMUST00000113255 54 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Gm23599-201ENSMUST00000157261 251 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Gm25059-201ENSMUST00000157367 117 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Gm25933-201ENSMUST00000178943 108 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Gm26200-201ENSMUST00000180273 79 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Gm10421-202ENSMUST00000186114 132 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Gm43587-201ENSMUST00000199590 204 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 AC166830.2-201ENSMUST00000225821 196 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Gm25793-201ENSMUST00000083287 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Mir181a-2-201ENSMUST00000083489 76 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Mir32-201ENSMUST00000083610 70 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Vmn1r86-201ENSMUST00000094828 951 ntAPPRIS P2 BASIC2.54□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 AC157570.1-201ENSMUST00000218052 3778 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Olfr251-202ENSMUST00000214865 4930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Gm42639-201ENSMUST00000197061 1871 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 CT030170.3-201ENSMUST00000221205 1815 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Vmn1r29-204ENSMUST00000228038 4520 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 AC121844.2-201ENSMUST00000219067 2066 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Gm37331-201ENSMUST00000192367 3375 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Gm14894-201ENSMUST00000117170 270 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Vmn1r-ps125-201ENSMUST00000117767 290 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Gm12647-201ENSMUST00000118977 265 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Gm22479-201ENSMUST00000122566 81 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Gm23980-201ENSMUST00000157135 158 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Gm22242-201ENSMUST00000175224 118 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Ska2l-ps-201ENSMUST00000186208 360 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Gm28408-201ENSMUST00000191557 463 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Gm37449-201ENSMUST00000193016 270 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Gm37650-201ENSMUST00000193570 248 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Gm18658-201ENSMUST00000195558 270 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Igkv13-55-1-201ENSMUST00000200400 308 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Gm44909-201ENSMUST00000208756 165 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Gm36368-201ENSMUST00000212026 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 AC154552.7-201ENSMUST00000222824 156 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Gm23851-201ENSMUST00000083831 103 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 A630081D01Rik-201ENSMUST00000195842 1833 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Cd209e-201ENSMUST00000033888 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Rex2-201ENSMUST00000075775 3993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 AC152951.2-201ENSMUST00000218293 3587 ntBASIC2.53□□□□□ -2.01
Atg4cQ811C2 Gm12235-201ENSMUST00000118596 170 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Atg4cQ811C2 Gm24480-201ENSMUST00000157442 103 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Atg4cQ811C2 Gm22216-201ENSMUST00000157557 114 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Atg4cQ811C2 Gm23033-201ENSMUST00000157996 134 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Atg4cQ811C2 Mir7226-201ENSMUST00000184953 60 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Atg4cQ811C2 Gm29512-201ENSMUST00000185544 315 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Atg4cQ811C2 Gm28110-201ENSMUST00000185782 315 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Atg4cQ811C2 Gm29057-201ENSMUST00000186468 315 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Atg4cQ811C2 Gm29661-201ENSMUST00000186781 315 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Atg4cQ811C2 Gm28737-201ENSMUST00000186808 315 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Atg4cQ811C2 Gm29118-201ENSMUST00000186908 315 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Atg4cQ811C2 Gm28433-201ENSMUST00000187085 315 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Atg4cQ811C2 Gm28759-201ENSMUST00000187621 315 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Atg4cQ811C2 Gm28831-201ENSMUST00000187739 315 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Atg4cQ811C2 Gm28200-201ENSMUST00000187778 315 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Atg4cQ811C2 Gm28752-201ENSMUST00000188340 315 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Atg4cQ811C2 Gm29378-201ENSMUST00000188723 315 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Atg4cQ811C2 Gm28569-201ENSMUST00000188748 315 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Atg4cQ811C2 Gm28120-201ENSMUST00000188812 315 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Atg4cQ811C2 Gm28369-201ENSMUST00000188993 315 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Atg4cQ811C2 Gm29037-201ENSMUST00000189092 313 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Atg4cQ811C2 Gm28909-201ENSMUST00000189406 315 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Atg4cQ811C2 Gm28861-201ENSMUST00000189681 315 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Atg4cQ811C2 Gm29180-201ENSMUST00000190003 315 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Atg4cQ811C2 Gm29575-201ENSMUST00000190597 315 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Atg4cQ811C2 Gm29469-201ENSMUST00000191448 315 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Atg4cQ811C2 Igkv14-118-1-201ENSMUST00000198645 334 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Atg4cQ811C2 Mir7215-201ENSMUST00000200383 51 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Atg4cQ811C2 Gm44555-201ENSMUST00000209008 148 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Atg4cQ811C2 AC141895.1-201ENSMUST00000218141 273 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Atg4cQ811C2 Gm25589-201ENSMUST00000082502 166 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 278.1 ms