Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm12823-201ENSMUST00000134494 318 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm24221-201ENSMUST00000158833 313 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm20438-201ENSMUST00000174441 329 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Vmn1r-ps150-201ENSMUST00000176659 736 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm27676-201ENSMUST00000183669 61 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm28995-201ENSMUST00000186625 261 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Igkv13-55-1-201ENSMUST00000200400 308 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Vmn1r-ps6-201ENSMUST00000201079 934 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Zfp932-207ENSMUST00000187241 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm25059-201ENSMUST00000157367 117 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm22233-201ENSMUST00000157464 114 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm23586-201ENSMUST00000157657 123 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm22962-201ENSMUST00000157962 73 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm24808-201ENSMUST00000157993 118 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm25868-201ENSMUST00000158253 114 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm22164-201ENSMUST00000158413 106 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm17377-201ENSMUST00000165184 207 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm24137-201ENSMUST00000180055 79 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm22391-201ENSMUST00000180356 79 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm27660-201ENSMUST00000184028 208 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 4930511M18Rik-201ENSMUST00000197811 679 ntTSL 1 (best) BASIC0.44□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm2829-201ENSMUST00000213121 499 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Snord96a-201ENSMUST00000082791 81 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm22785-201ENSMUST00000104087 132 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Defa-ps13-201ENSMUST00000120695 204 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm15214-201ENSMUST00000122155 470 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm11358-201ENSMUST00000122310 373 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm25325-201ENSMUST00000122559 86 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm22027-201ENSMUST00000122737 127 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm25596-201ENSMUST00000178368 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm23144-201ENSMUST00000180226 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Ska2l-ps-201ENSMUST00000186208 360 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Igkv13-62-1-201ENSMUST00000198690 317 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm10297-201ENSMUST00000207136 651 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Defa-ps13-202ENSMUST00000212360 204 ntTSL 1 (best) BASIC0.43□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm18160-201ENSMUST00000214279 827 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 AC158597.1-201ENSMUST00000216234 150 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm25213-201ENSMUST00000102388 113 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm26147-201ENSMUST00000104479 114 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Tas2r122-201ENSMUST00000105077 930 ntAPPRIS P1 BASIC0.42□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Mir6411-201ENSMUST00000183556 108 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm29005-201ENSMUST00000186773 320 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm20896-202ENSMUST00000188585 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.42□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm23370-201ENSMUST00000199545 130 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Scgb2b2-202ENSMUST00000205821 357 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm45912-201ENSMUST00000210646 543 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 AC156795.1-201ENSMUST00000214655 414 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 CT485612.4-201ENSMUST00000223405 250 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Olfr822-201ENSMUST00000080460 942 ntAPPRIS P1 BASIC0.42□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm23848-201ENSMUST00000083826 106 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm15175-201ENSMUST00000117629 132 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm12016-201ENSMUST00000119079 681 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm13324-201ENSMUST00000148607 569 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm23277-201ENSMUST00000157914 136 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm29513-201ENSMUST00000185741 202 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm42925-201ENSMUST00000197359 285 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Mirlet7f-1-201ENSMUST00000198652 89 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 AC120540.1-201ENSMUST00000221879 324 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm24588-201ENSMUST00000116696 83 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 n-R5s157-201ENSMUST00000122543 121 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm24480-201ENSMUST00000157442 103 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm20409-201ENSMUST00000173457 130 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm11168-201ENSMUST00000177722 684 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm11168-202ENSMUST00000178077 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm25156-201ENSMUST00000179809 79 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm37291-201ENSMUST00000195637 533 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 AC112274.2-201ENSMUST00000218436 170 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm23538-201ENSMUST00000157535 101 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NischQ80TM9 Gm25371-201ENSMUST00000158162 101 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NischQ80TM9 Gm17052-201ENSMUST00000165496 289 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NischQ80TM9 Gm21738-201ENSMUST00000177817 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
NischQ80TM9 Snord116l14-201ENSMUST00000179875 94 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NischQ80TM9 Gm29613-201ENSMUST00000185846 313 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NischQ80TM9 Gm29134-201ENSMUST00000186579 126 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NischQ80TM9 Gm29544-201ENSMUST00000188860 313 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NischQ80TM9 Gm28337-201ENSMUST00000190425 666 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NischQ80TM9 Gm28808-201ENSMUST00000190978 313 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NischQ80TM9 Gm31123-201ENSMUST00000192094 666 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NischQ80TM9 AC123830.1-201ENSMUST00000217156 609 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
NischQ80TM9 Gm10264-201ENSMUST00000220589 429 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NischQ80TM9 Gm3333-201ENSMUST00000221637 452 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
NischQ80TM9 Gm22620-201ENSMUST00000082700 133 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NischQ80TM9 Gm24610-201ENSMUST00000083270 109 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NischQ80TM9 Mirlet7d-201ENSMUST00000083519 103 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NischQ80TM9 Gm10719-201ENSMUST00000099047 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
NischQ80TM9 AC163660.3-201ENSMUST00000224253 1563 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NischQ80TM9 AC125532.1-201ENSMUST00000216210 2334 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NischQ80TM9 Gm24836-201ENSMUST00000122609 108 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NischQ80TM9 Gm22765-201ENSMUST00000158371 128 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NischQ80TM9 Rnu7-201ENSMUST00000158458 62 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NischQ80TM9 Mir3964-201ENSMUST00000174898 74 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NischQ80TM9 Gm21815-201ENSMUST00000178213 664 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NischQ80TM9 Gm37599-201ENSMUST00000193067 489 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NischQ80TM9 Gm30484-201ENSMUST00000200327 449 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
NischQ80TM9 Gm44028-201ENSMUST00000205205 355 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
NischQ80TM9 AC164086.1-201ENSMUST00000221038 289 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NischQ80TM9 AC124569.1-201ENSMUST00000225932 101 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NischQ80TM9 Gm10717-201ENSMUST00000075573 684 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
NischQ80TM9 D130040H23Rik-201ENSMUST00000078257 1218 ntTSL 2 BASIC0.39□□□□□ -2.35
NischQ80TM9 Snord1a-201ENSMUST00000083160 74 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
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