Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gm25836-201ENSMUST00000158918 123 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Gm24487-201ENSMUST00000178017 63 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Gm25020-201ENSMUST00000178071 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Gm37313-201ENSMUST00000191673 290 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Igkv4-65-201ENSMUST00000196986 358 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 AC173345.1-201ENSMUST00000222837 306 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 AC121942.2-201ENSMUST00000223824 600 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 AC133156.1-202ENSMUST00000227284 363 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Defb40-201ENSMUST00000066258 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Olfr1450-203ENSMUST00000213925 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Gm14678-201ENSMUST00000121396 482 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Nell1os-201ENSMUST00000134584 489 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Gm23120-201ENSMUST00000157654 287 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Gm22434-201ENSMUST00000158549 122 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Gm44083-201ENSMUST00000203114 337 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 AC122428.1-201ENSMUST00000213709 217 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 CT009718.1-201ENSMUST00000220784 395 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Gm23041-201ENSMUST00000083868 106 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Snhg14-213ENSMUST00000190666 3708 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Gm42755-201ENSMUST00000198533 1493 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Gm24098-201ENSMUST00000102075 109 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Gm25381-201ENSMUST00000102078 109 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Gm23766-201ENSMUST00000103894 80 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Gm12785-201ENSMUST00000122052 172 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 n-R5s189-201ENSMUST00000122675 114 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Gm16362-201ENSMUST00000135189 214 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Gm16358-201ENSMUST00000146046 210 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Gm5269-201ENSMUST00000183590 138 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Gm29005-201ENSMUST00000186773 320 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Gm2829-201ENSMUST00000213121 499 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 AC188459.1-201ENSMUST00000216651 300 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 AC122905.2-201ENSMUST00000220325 269 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Gm45941-202ENSMUST00000223144 389 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 AC168062.3-201ENSMUST00000227025 165 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Mir29b-2-201ENSMUST00000083478 81 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Gm37761-201ENSMUST00000194989 2098 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Ighv1-47-201ENSMUST00000103518 294 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Traj6-201ENSMUST00000103734 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Gm14978-201ENSMUST00000129000 304 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Gm25956-201ENSMUST00000175115 217 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Gm28418-201ENSMUST00000186179 423 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Igkv2-93-1-201ENSMUST00000196774 272 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Gm45296-201ENSMUST00000209625 205 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Olfr1202-203ENSMUST00000217059 1153 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 AC132437.1-201ENSMUST00000218308 320 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 AC114010.1-201ENSMUST00000222060 379 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 AC130829.3-201ENSMUST00000222735 154 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Gm23731-201ENSMUST00000083749 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Gm22866-201ENSMUST00000083947 177 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Gm26111-201ENSMUST00000083969 106 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 AC158598.1-201ENSMUST00000214349 3847 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Olfr868-201ENSMUST00000212767 4196 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Olfr143-202ENSMUST00000213129 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Olfr868-202ENSMUST00000212999 4233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Mir758-201ENSMUST00000103260 81 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Gm25421-201ENSMUST00000104218 164 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Gm24282-201ENSMUST00000104232 66 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Olfr1169-ps1-201ENSMUST00000121437 233 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Gm22554-201ENSMUST00000157798 147 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Gm22316-201ENSMUST00000158012 216 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Gm24726-201ENSMUST00000158232 121 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Gm7592-201ENSMUST00000160674 627 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Gm27898-201ENSMUST00000183987 80 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Gm27753-201ENSMUST00000184742 203 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Gm28627-201ENSMUST00000186141 453 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Gm29155-202ENSMUST00000186289 216 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Ttn-225ENSMUST00000190813 300 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Calml4-204ENSMUST00000214633 394 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 AC027184.1-201ENSMUST00000226991 424 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Mucl2-201ENSMUST00000037685 639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Mir410-201ENSMUST00000083563 81 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Gm10720-201ENSMUST00000099050 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Gm43473-201ENSMUST00000200442 5997 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Gm1980-201ENSMUST00000123131 2306 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Gm45393-201ENSMUST00000211634 2631 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Skint2-203ENSMUST00000106560 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Usp9y-201ENSMUST00000091188 8094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Scgb1b26-ps-201ENSMUST00000121845 291 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Gm16510-201ENSMUST00000153501 249 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Gm23589-201ENSMUST00000157660 105 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Gm23381-201ENSMUST00000157676 94 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Gm23779-201ENSMUST00000157938 64 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Gm24900-201ENSMUST00000158128 134 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Gm22945-201ENSMUST00000158557 157 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Gm22800-201ENSMUST00000175627 94 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Gm28995-201ENSMUST00000186625 261 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Gm44419-201ENSMUST00000203338 229 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Gm44010-201ENSMUST00000204432 331 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Gm24044-201ENSMUST00000083107 156 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Gm26265-201ENSMUST00000083277 135 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Snora69-201ENSMUST00000083708 131 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 AW112010-201ENSMUST00000099676 770 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
Actn1Q7TPR4 Gm43373-201ENSMUST00000202552 2870 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Actn1Q7TPR4 Olfr1201-203ENSMUST00000216213 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
Actn1Q7TPR4 Cyp3a59-201ENSMUST00000035571 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Actn1Q7TPR4 Gm14215-201ENSMUST00000120578 221 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Actn1Q7TPR4 Gm12721-201ENSMUST00000120621 268 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Actn1Q7TPR4 Gm11254-201ENSMUST00000122368 653 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Actn1Q7TPR4 Gm25961-201ENSMUST00000157174 135 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Actn1Q7TPR4 Gm22491-201ENSMUST00000157190 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 245.9 ms