Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 AC154472.1-201ENSMUST00000222663 236 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Rpl31-ps1-201ENSMUST00000085128 378 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm23130-201ENSMUST00000104252 74 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm11429-201ENSMUST00000119089 144 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 A130030D18Rik-201ENSMUST00000128608 654 ntTSL 1 (best) BASIC-0.27□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 1700063H06Rik-201ENSMUST00000183678 445 ntTSL 1 (best) BASIC-0.27□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm45455-202ENSMUST00000211156 630 ntTSL 1 (best) BASIC-0.27□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Serf1-201ENSMUST00000022145 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.27□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 AC133176.1-201ENSMUST00000226668 219 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm9795-201ENSMUST00000062156 693 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm26210-201ENSMUST00000158680 91 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm15882-201ENSMUST00000161344 855 ntTSL 3 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm27588-201ENSMUST00000185096 263 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm28666-201ENSMUST00000186649 274 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm44128-201ENSMUST00000204909 219 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Traj20-201ENSMUST00000103721 58 ntAPPRIS P1 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm11358-201ENSMUST00000122310 373 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps67-201ENSMUST00000173843 691 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm28825-201ENSMUST00000186233 238 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 1810007C17Rik-201ENSMUST00000187665 710 ntTSL 1 (best) BASIC-0.28□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm43301-201ENSMUST00000198918 778 ntTSL 1 (best) BASIC-0.28□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Olfr1466-202ENSMUST00000207124 1981 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.28□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Gm13341-201ENSMUST00000120780 672 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Gm23370-202ENSMUST00000197008 129 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Olfr797-ps1-201ENSMUST00000203614 415 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Gm45541-201ENSMUST00000210443 54 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Snora75-201ENSMUST00000082903 133 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Gm22520-201ENSMUST00000158269 129 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Mir6338-201ENSMUST00000183389 109 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Gm44961-201ENSMUST00000207450 196 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Olfr1476-ps1-201ENSMUST00000208572 367 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Gm11512-201ENSMUST00000119669 663 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Gm13725-201ENSMUST00000122139 207 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Gm15230-201ENSMUST00000153701 510 ntTSL 2 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Gm25558-201ENSMUST00000158083 106 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Gm8897-202ENSMUST00000179679 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Mir6238-201ENSMUST00000184140 129 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Gm29352-201ENSMUST00000188054 544 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Gm36984-201ENSMUST00000192770 235 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Gm45146-201ENSMUST00000207108 221 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 AC126691.1-201ENSMUST00000226534 202 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Gm23197-201ENSMUST00000158809 112 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Mir344h-1-201ENSMUST00000174922 60 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Mir344h-2-201ENSMUST00000175612 60 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Gm19280-201ENSMUST00000190191 205 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Gm45730-201ENSMUST00000212560 395 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Olfr193-201ENSMUST00000076262 1009 ntAPPRIS P1 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Snord116l9-201ENSMUST00000101891 94 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Gm26504-201ENSMUST00000102033 94 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Mir667-201ENSMUST00000102441 92 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Gm3221-201ENSMUST00000164869 440 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Gm26502-201ENSMUST00000177732 94 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Snord116l13-201ENSMUST00000177737 94 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Gm25350-201ENSMUST00000177849 94 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Snord116l15-201ENSMUST00000177940 94 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Gm23446-201ENSMUST00000177977 94 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Snord116l4-201ENSMUST00000177982 94 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Gm26201-201ENSMUST00000178047 94 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Gm24711-201ENSMUST00000178062 94 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Gm24609-201ENSMUST00000178166 94 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Gm23265-201ENSMUST00000178321 94 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Gm22812-201ENSMUST00000178329 94 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Snord116l3-201ENSMUST00000178370 94 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Gm26246-201ENSMUST00000178388 94 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Gm25155-201ENSMUST00000178450 94 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Gm24760-201ENSMUST00000178530 94 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Gm22285-201ENSMUST00000178576 94 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Gm22417-201ENSMUST00000178656 94 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Snord116l2-201ENSMUST00000178675 94 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Gm26270-201ENSMUST00000178690 94 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Snord116l16-201ENSMUST00000178777 94 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Gm23313-201ENSMUST00000178931 94 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Snord116l17-201ENSMUST00000178936 94 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Gm23089-201ENSMUST00000178947 94 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Snord116l10-201ENSMUST00000179053 94 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Gm24153-201ENSMUST00000179280 94 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Gm25597-201ENSMUST00000179388 94 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Snord116l1-201ENSMUST00000179518 94 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Gm25816-201ENSMUST00000179764 94 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Snord116l8-201ENSMUST00000179889 94 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Snord116l7-201ENSMUST00000179895 94 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Snord116l5-201ENSMUST00000179927 94 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Snord116l6-201ENSMUST00000179955 94 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Gm26188-201ENSMUST00000179963 94 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Gm26433-201ENSMUST00000180227 94 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Snord116l11-201ENSMUST00000180312 94 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Gm22128-201ENSMUST00000180346 94 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Gm37418-201ENSMUST00000195031 274 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 AC124772.1-201ENSMUST00000221325 151 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Gm25794-201ENSMUST00000083286 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Gm26143-201ENSMUST00000104480 108 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Gm14411-201ENSMUST00000121798 914 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Gm23656-201ENSMUST00000122626 112 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 n-R5s6-201ENSMUST00000122663 88 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Gm22338-201ENSMUST00000157715 129 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Gm26335-201ENSMUST00000178449 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
NipblQ6KCD5 Gm44396-201ENSMUST00000199843 114 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
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