Protein–RNA interactions for Protein: Q62458

Gm20809, (clone BALB14N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20809Q62458 Gm37468-201ENSMUST00000194767 854 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
Gm20809Q62458 AC117232.1-201ENSMUST00000197964 119 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Gm20809Q62458 Mir378a-201ENSMUST00000198300 66 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Gm20809Q62458 Olfr1315-ps1-202ENSMUST00000208654 945 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Gm20809Q62458 AC116589.1-201ENSMUST00000220634 327 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Gm20809Q62458 AC122834.1-201ENSMUST00000227182 425 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Gm20809Q62458 Olfr470-201ENSMUST00000073059 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Gm20809Q62458 Snord118-201ENSMUST00000082965 135 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Gm20809Q62458 Snord7-201ENSMUST00000083781 97 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Gm20809Q62458 Gm26314-201ENSMUST00000083891 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Gm20809Q62458 Olfr1156-201ENSMUST00000099842 1076 ntAPPRIS P1 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Gm20809Q62458 Gm14797-201ENSMUST00000119378 1480 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Gm20809Q62458 Gm33962-201ENSMUST00000182643 2592 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Gm20809Q62458 Olfr821-203ENSMUST00000214177 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Gm6444-201ENSMUST00000119611 458 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Gm14392-201ENSMUST00000120332 401 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Gm14413-201ENSMUST00000122158 408 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Gm24895-201ENSMUST00000122742 74 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Gm22963-201ENSMUST00000157960 91 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Gm26024-201ENSMUST00000158657 322 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Gm21905-201ENSMUST00000177616 87 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Mup-ps11-201ENSMUST00000178040 545 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Gm22264-201ENSMUST00000178200 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Mup-ps3-201ENSMUST00000178315 545 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Gm24390-201ENSMUST00000179578 62 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Gm29155-202ENSMUST00000186289 216 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Gm28848-201ENSMUST00000189984 168 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 AC147560.1-201ENSMUST00000197528 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Gm43578-201ENSMUST00000201250 459 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Gm45403-201ENSMUST00000209453 276 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 mt-Atp6-201ENSMUST00000082408 681 ntAPPRIS P1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 AC153964.2-201ENSMUST00000217704 2474 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Olfr1153-202ENSMUST00000217436 2144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Gm10778-201ENSMUST00000105315 1497 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Gm4767-201ENSMUST00000099439 1497 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Gm13432-201ENSMUST00000118861 241 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Gm15115-201ENSMUST00000121145 264 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Gm11471-201ENSMUST00000121824 198 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Gm15529-201ENSMUST00000121833 994 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Gm24858-201ENSMUST00000158058 323 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Gm26936-201ENSMUST00000182424 382 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Mir6997-201ENSMUST00000184313 71 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Mir6352-201ENSMUST00000184495 116 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Gm28343-201ENSMUST00000185386 112 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Gm29603-201ENSMUST00000186792 334 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Gm9156-201ENSMUST00000189660 463 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Gm33051-201ENSMUST00000192940 274 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Gm38361-201ENSMUST00000193419 458 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Gm37228-201ENSMUST00000193574 331 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Gm35736-201ENSMUST00000203681 313 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 A730009L09Rik-202ENSMUST00000210306 201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 AC138290.2-201ENSMUST00000218822 369 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Mir92-2-201ENSMUST00000083679 91 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Catsperb-201ENSMUST00000055156 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Slco6c1-201ENSMUST00000027569 2747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Olfr1002-202ENSMUST00000215548 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Defb43-201ENSMUST00000100491 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Traj20-201ENSMUST00000103721 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Gm22985-201ENSMUST00000122754 116 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Gm6956-201ENSMUST00000134724 546 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Gm22793-201ENSMUST00000157227 330 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Gm17148-201ENSMUST00000164702 249 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Igkv17-134-201ENSMUST00000168310 348 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Gm17215-201ENSMUST00000170074 277 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Gm24085-201ENSMUST00000175172 116 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Vmn1r-ps47-201ENSMUST00000176694 907 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Gm29397-201ENSMUST00000185205 333 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Trbv7-201ENSMUST00000193339 402 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Gm44491-201ENSMUST00000196794 96 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Gm33866-201ENSMUST00000196911 289 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Gm44726-201ENSMUST00000203427 217 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Gm45365-201ENSMUST00000209489 256 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Gm45911-201ENSMUST00000211844 601 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 4930543K20Rik-201ENSMUST00000217044 355 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 AC130821.1-201ENSMUST00000221997 293 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 AC129208.2-201ENSMUST00000228506 320 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Defb21-201ENSMUST00000070722 427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Gm5899-201ENSMUST00000071770 270 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Snora3-201ENSMUST00000083082 132 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Gm2869-201ENSMUST00000124359 2621 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Olfr1442-204ENSMUST00000208657 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Igkv13-85-201ENSMUST00000114212 347 ntAPPRIS P1 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Snord98-201ENSMUST00000116819 65 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Gm12225-201ENSMUST00000117995 298 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Gm14937-201ENSMUST00000119709 208 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Gm14269-201ENSMUST00000120455 306 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Gm23535-201ENSMUST00000157542 106 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Gm23016-201ENSMUST00000158431 62 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Rnu7-201ENSMUST00000158458 62 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Gm24005-201ENSMUST00000158459 296 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Mir669n-201ENSMUST00000158636 54 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Gm22136-201ENSMUST00000158751 268 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Gm24677-201ENSMUST00000158755 150 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Gm17100-201ENSMUST00000168963 272 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Gm17113-201ENSMUST00000170118 171 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Mir5118-201ENSMUST00000175551 67 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Vmn2r-ps18-201ENSMUST00000177972 380 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Vmn2r-ps17-201ENSMUST00000178733 375 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Gm25936-201ENSMUST00000179952 114 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Gm20809Q62458 Mir7068-201ENSMUST00000183439 74 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms