Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Mir687-201ENSMUST00000102166 89 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm11859-201ENSMUST00000118099 455 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm12016-201ENSMUST00000119079 681 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm15807-201ENSMUST00000119880 1128 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm23078-201ENSMUST00000157848 148 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 C230029F24Rik-202ENSMUST00000188673 554 ntTSL 1 (best) BASIC0.15□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm42719-201ENSMUST00000197393 355 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1470-ps1-201ENSMUST00000208620 949 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm7495-201ENSMUST00000215099 426 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm26326-201ENSMUST00000083070 129 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Cylc1-201ENSMUST00000101282 1923 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.15□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Olfr937-202ENSMUST00000215049 2259 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm15327-202ENSMUST00000153958 467 ntTSL 1 (best) BASIC0.14□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm17036-201ENSMUST00000168187 254 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm8871-202ENSMUST00000168945 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm24713-201ENSMUST00000178850 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm24464-201ENSMUST00000179697 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm22263-201ENSMUST00000180060 104 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm25448-201ENSMUST00000180065 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm27013-201ENSMUST00000182441 1024 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm27717-201ENSMUST00000183933 151 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm28299-201ENSMUST00000189908 339 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm29022-201ENSMUST00000190702 225 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm37923-201ENSMUST00000191624 161 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm18971-201ENSMUST00000197240 374 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm43529-201ENSMUST00000199178 412 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm44449-201ENSMUST00000203610 153 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm44828-201ENSMUST00000203745 106 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 1700014L14Rik-201ENSMUST00000211704 481 ntTSL 1 (best) BASIC0.14□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm22810-201ENSMUST00000082741 158 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm24258-201ENSMUST00000083739 133 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm23130-201ENSMUST00000104252 74 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm15266-201ENSMUST00000119635 255 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm14417-201ENSMUST00000120036 1074 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm23120-201ENSMUST00000157654 287 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm24963-201ENSMUST00000157916 144 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm23032-201ENSMUST00000157995 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm26358-201ENSMUST00000158215 97 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm23068-201ENSMUST00000158239 293 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps24-201ENSMUST00000175772 900 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm18396-201ENSMUST00000177095 361 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps18-201ENSMUST00000177972 380 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps17-201ENSMUST00000178733 375 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm28283-201ENSMUST00000185509 178 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm43911-201ENSMUST00000203097 76 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm19855-201ENSMUST00000210145 249 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm46993-201ENSMUST00000220708 259 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1317-201ENSMUST00000060098 951 ntAPPRIS P1 BASIC0.13□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Olfr193-201ENSMUST00000076262 1009 ntAPPRIS P1 BASIC0.13□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 mt-Co3-201ENSMUST00000082409 784 ntAPPRIS P1 BASIC0.13□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm23453-201ENSMUST00000083326 106 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm42755-201ENSMUST00000198533 1493 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm26249-201ENSMUST00000116708 118 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Rpl30-ps5-201ENSMUST00000117104 361 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm14980-201ENSMUST00000121247 736 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm14713-201ENSMUST00000122362 686 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s70-201ENSMUST00000122650 116 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm25393-201ENSMUST00000157336 285 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm22076-201ENSMUST00000158601 84 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm5269-201ENSMUST00000183590 138 ntAPPRIS P1 BASIC0.12□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Mir6365-201ENSMUST00000183990 101 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm34073-201ENSMUST00000195736 212 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Mir3087-201ENSMUST00000199405 56 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm38395-201ENSMUST00000199904 830 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm17911-201ENSMUST00000210806 877 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Olfr865-ps1-201ENSMUST00000212071 85 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Olfr929-ps1-201ENSMUST00000216338 585 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 AC125020.2-201ENSMUST00000218894 348 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm24920-201ENSMUST00000083018 85 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Mir19b-2-201ENSMUST00000083539 84 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm25650-201ENSMUST00000083784 162 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm44177-201ENSMUST00000204338 2667 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm20541-201ENSMUST00000173035 1406 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm10324-201ENSMUST00000092528 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm12105-201ENSMUST00000120846 779 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm25269-201ENSMUST00000122601 104 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm15404-201ENSMUST00000141811 364 ntTSL 2 BASIC0.11□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm24784-201ENSMUST00000157640 62 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm23777-201ENSMUST00000158994 259 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm25361-201ENSMUST00000179358 76 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm25873-201ENSMUST00000180317 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm9022-202ENSMUST00000183285 483 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Mir6389-201ENSMUST00000183661 102 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Mir3569-201ENSMUST00000185080 58 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm28257-201ENSMUST00000185244 463 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 2900035J10Rik-201ENSMUST00000194966 532 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm44754-201ENSMUST00000208155 400 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm19032-201ENSMUST00000208584 592 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 AC192334.2-201ENSMUST00000223087 1091 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm24624-201ENSMUST00000082617 164 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Olfr872-201ENSMUST00000086474 1897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.11□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm44560-201ENSMUST00000207816 3115 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm2768-201ENSMUST00000121062 250 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm25901-201ENSMUST00000158494 130 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm25491-201ENSMUST00000158733 308 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm28666-201ENSMUST00000186649 274 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 Gm38361-201ENSMUST00000193419 458 ntTSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 AC164612.2-202ENSMUST00000216314 253 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 AC122298.1-201ENSMUST00000222574 165 ntTSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
Sft2d1Q5SSN7 AC131085.1-201ENSMUST00000224746 656 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
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