Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm14215-201ENSMUST00000120578 221 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm12956-201ENSMUST00000122184 414 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm22598-201ENSMUST00000157600 127 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm23642-201ENSMUST00000157858 258 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm16584-201ENSMUST00000159267 189 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm24308-201ENSMUST00000177773 114 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm25020-201ENSMUST00000178071 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm24799-201ENSMUST00000178431 79 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm29512-201ENSMUST00000185544 315 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm28110-201ENSMUST00000185782 315 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm29057-201ENSMUST00000186468 315 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm29661-201ENSMUST00000186781 315 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm28737-201ENSMUST00000186808 315 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm29118-201ENSMUST00000186908 315 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm28433-201ENSMUST00000187085 315 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm28759-201ENSMUST00000187621 315 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm28831-201ENSMUST00000187739 315 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm28200-201ENSMUST00000187778 315 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm28752-201ENSMUST00000188340 315 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm29378-201ENSMUST00000188723 315 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm28569-201ENSMUST00000188748 315 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm28120-201ENSMUST00000188812 315 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm28369-201ENSMUST00000188993 315 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm29037-201ENSMUST00000189092 313 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm28909-201ENSMUST00000189406 315 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm28861-201ENSMUST00000189681 315 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Scgb3a2-203ENSMUST00000189750 578 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm29180-201ENSMUST00000190003 315 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm29575-201ENSMUST00000190597 315 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm29469-201ENSMUST00000191448 315 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Trbv18-201ENSMUST00000194256 294 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Mir7661-201ENSMUST00000197023 61 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps13-201ENSMUST00000204697 134 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm24316-201ENSMUST00000083041 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Cyp3a59-201ENSMUST00000035571 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Olfr726-204ENSMUST00000215105 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Olfr1109-202ENSMUST00000214636 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm10033-201ENSMUST00000072427 1813 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Mir669d-201ENSMUST00000104644 121 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Mir872-201ENSMUST00000104728 81 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Vma21-ps-201ENSMUST00000114578 306 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm25543-201ENSMUST00000122678 312 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm22447-201ENSMUST00000158155 92 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm23003-201ENSMUST00000179948 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm10421-202ENSMUST00000186114 132 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm28710-201ENSMUST00000186866 489 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm25820-202ENSMUST00000197479 128 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm43978-201ENSMUST00000203491 451 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm2511-201ENSMUST00000205521 457 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Olfr1315-ps1-202ENSMUST00000208654 945 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 AC158597.1-201ENSMUST00000216234 150 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 AC159632.1-201ENSMUST00000221808 317 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 AC114010.1-201ENSMUST00000222060 379 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm19118-201ENSMUST00000222554 98 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 AC100209.2-201ENSMUST00000224461 451 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm26265-201ENSMUST00000083277 135 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Olfr201-202ENSMUST00000216834 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm45461-201ENSMUST00000211726 4535 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Gm42482-201ENSMUST00000198904 1947 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
Trim71Q1PSW8 Mir465b-1-201ENSMUST00000103940 79 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Mir465b-2-201ENSMUST00000104662 79 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm15010-201ENSMUST00000117153 407 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 n-R5s189-201ENSMUST00000122675 114 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Mir28b-201ENSMUST00000175399 80 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm22800-201ENSMUST00000175627 94 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Mir7226-201ENSMUST00000184953 60 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm28881-201ENSMUST00000187710 470 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm20923-201ENSMUST00000190009 319 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm21088-201ENSMUST00000190875 316 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Mir3069-201ENSMUST00000198802 65 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Mir3970-201ENSMUST00000199287 90 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm44429-201ENSMUST00000203542 186 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 AC117198.1-201ENSMUST00000217080 651 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm13212-202ENSMUST00000105739 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Acer3-202ENSMUST00000120520 3964 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm37061-201ENSMUST00000195066 3243 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm44133-202ENSMUST00000204450 2586 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm12647-201ENSMUST00000118977 265 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm24630-201ENSMUST00000122768 106 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm14978-201ENSMUST00000129000 304 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm23381-201ENSMUST00000157676 94 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm42439-201ENSMUST00000195931 486 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm43587-201ENSMUST00000199590 204 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Mir7227-201ENSMUST00000200408 59 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm15235-201ENSMUST00000200572 194 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm18617-201ENSMUST00000222311 259 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Olfr1317-201ENSMUST00000060098 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm22062-201ENSMUST00000082563 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm25793-201ENSMUST00000083287 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Mir133a-1-201ENSMUST00000083465 68 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm25628-201ENSMUST00000084002 105 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Nkain2-202ENSMUST00000092603 273 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Olfr1201-203ENSMUST00000216213 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm45393-201ENSMUST00000211634 2631 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Olfr606-202ENSMUST00000214631 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Olfr479-202ENSMUST00000209805 2902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Mir542-201ENSMUST00000102186 85 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm15365-201ENSMUST00000122392 300 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm22814-201ENSMUST00000157452 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Trim71Q1PSW8 Gm23579-201ENSMUST00000158528 103 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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