Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Zfp273-203ENSMUST00000181391 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
ptchd1Q14B62 Gm44842-201ENSMUST00000209173 3372 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ptchd1Q14B62 Olfr1293-ps-203ENSMUST00000217845 3628 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
ptchd1Q14B62 Igkv4-57-201ENSMUST00000103357 352 ntAPPRIS P1 BASIC3.16□□□□□ -1.9
ptchd1Q14B62 Gm23532-201ENSMUST00000104569 112 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ptchd1Q14B62 Gm10722-201ENSMUST00000151376 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
ptchd1Q14B62 Gm22722-201ENSMUST00000157467 132 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ptchd1Q14B62 Gm22384-201ENSMUST00000158187 104 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ptchd1Q14B62 Gm22833-201ENSMUST00000158292 132 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ptchd1Q14B62 Vmn2r-ps17-201ENSMUST00000178733 375 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ptchd1Q14B62 Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 184 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ptchd1Q14B62 Gm9712-201ENSMUST00000210842 311 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ptchd1Q14B62 AC122418.1-201ENSMUST00000225012 511 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ptchd1Q14B62 Gm22297-201ENSMUST00000083312 106 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ptchd1Q14B62 Olfr1025-ps1-202ENSMUST00000213474 3578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
ptchd1Q14B62 AC104897.1-201ENSMUST00000222638 3628 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ptchd1Q14B62 Olfr1370-203ENSMUST00000215357 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
ptchd1Q14B62 Zfp984-201ENSMUST00000105734 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
ptchd1Q14B62 Olfr814-202ENSMUST00000213742 3798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
ptchd1Q14B62 AC153964.2-201ENSMUST00000217704 2474 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
ptchd1Q14B62 Pik3c2a-201ENSMUST00000170430 8044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
ptchd1Q14B62 Gm3259-201ENSMUST00000101015 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
ptchd1Q14B62 Gm44846-201ENSMUST00000207127 3243 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
ptchd1Q14B62 Olfr594-202ENSMUST00000214051 2809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
ptchd1Q14B62 Il23r-201ENSMUST00000118364 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
ptchd1Q14B62 Gm15497-201ENSMUST00000119137 551 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Gm12858-201ENSMUST00000121913 208 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Gm13656-201ENSMUST00000123829 345 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Rps15a-ps5-201ENSMUST00000132586 393 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Gm23535-201ENSMUST00000157542 106 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Vmn2r-ps58-201ENSMUST00000173044 242 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Mir7578-201ENSMUST00000183455 82 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Gm6003-201ENSMUST00000187903 463 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Traj57-202ENSMUST00000196977 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Gm34411-201ENSMUST00000201180 280 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 AC158631.1-201ENSMUST00000219202 138 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 AC173115.1-201ENSMUST00000220835 211 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Defb9-201ENSMUST00000057076 310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Gm22248-201ENSMUST00000082482 150 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Gm23297-201ENSMUST00000083184 127 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Gm10813-201ENSMUST00000099936 90 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 A330044P14Rik-201ENSMUST00000176108 2706 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Olfr1354-202ENSMUST00000204587 3781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Olfr1354-203ENSMUST00000217073 3792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Olfr136-204ENSMUST00000214035 1925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Vmn2r37-201ENSMUST00000072787 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Olfr1309-202ENSMUST00000214537 4274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 D930036K23Rik-201ENSMUST00000191894 3964 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Traj6-201ENSMUST00000103734 62 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Gm26423-201ENSMUST00000104277 128 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Gm14973-201ENSMUST00000117248 255 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Gm12926-201ENSMUST00000121158 409 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Gm24138-201ENSMUST00000157572 114 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Gm26291-201ENSMUST00000158889 137 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Gm20538-201ENSMUST00000166808 225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Gm29597-201ENSMUST00000188035 308 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Gm28992-201ENSMUST00000190534 139 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Gm37085-201ENSMUST00000193780 196 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Gm43932-201ENSMUST00000204499 52 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 AC168880.2-201ENSMUST00000224488 201 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Samd9l-201ENSMUST00000120087 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Gm43875-201ENSMUST00000203319 2475 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Gm27047-201ENSMUST00000183072 1819 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Gm42446-201ENSMUST00000199783 3284 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Olfr862-202ENSMUST00000079660 2604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Spata31-201ENSMUST00000070216 3232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Gm22023-201ENSMUST00000104354 130 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Gm24376-201ENSMUST00000104399 127 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Gm13761-201ENSMUST00000117238 807 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Gm12143-201ENSMUST00000119666 332 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Gm22075-201ENSMUST00000158599 192 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Gm22476-201ENSMUST00000158902 100 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
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ptchd1Q14B62 Mir3106-201ENSMUST00000175401 82 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Gm18486-201ENSMUST00000184040 298 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Gm37918-201ENSMUST00000192071 120 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Gm37693-201ENSMUST00000194562 234 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Igkv1-108-201ENSMUST00000198926 298 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Gm43199-201ENSMUST00000200019 307 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Gm43239-201ENSMUST00000200131 201 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Gm44470-201ENSMUST00000203913 142 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Gm45445-201ENSMUST00000209586 232 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Olfr880-ps1-201ENSMUST00000212344 229 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 AC153564.2-201ENSMUST00000219464 273 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Mir125b-2-201ENSMUST00000083538 71 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Adam5-201ENSMUST00000050300 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Gm14440-202ENSMUST00000109051 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Tsga10-204ENSMUST00000123082 3953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Olfr1211-203ENSMUST00000213412 4173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Olfr1162-202ENSMUST00000183862 4800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Gm26135-201ENSMUST00000101993 72 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Gm12449-201ENSMUST00000117572 234 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Gm15365-201ENSMUST00000122392 300 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Gm22382-201ENSMUST00000158185 130 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Mir1936-201ENSMUST00000158699 93 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Snord50b-201ENSMUST00000178497 72 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Mir6402-201ENSMUST00000183406 80 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 A930014E01Rik-201ENSMUST00000194572 330 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Gm34139-201ENSMUST00000196166 294 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ptchd1Q14B62 Igkv13-54-1-201ENSMUST00000196495 303 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
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