Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm16533-201ENSMUST00000140035 228 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Gm22321-201ENSMUST00000157152 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Gm23599-201ENSMUST00000157261 251 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Gm28020-201ENSMUST00000157739 67 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Gm22316-201ENSMUST00000158012 216 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Gm22537-201ENSMUST00000158172 199 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Gm23268-201ENSMUST00000175494 78 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Gm27421-201ENSMUST00000184729 167 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 D730003K21Rik-201ENSMUST00000215052 589 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 CT025619.4-201ENSMUST00000217362 350 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Gm7065-201ENSMUST00000222150 474 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Gm22443-201ENSMUST00000082890 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Olfr1193-202ENSMUST00000213893 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Vmn1r76-202ENSMUST00000226300 8189 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.55□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Igkv17-121-201ENSMUST00000103315 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.55□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Traj37-201ENSMUST00000103705 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Gm25466-201ENSMUST00000103995 132 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Gm14803-201ENSMUST00000117163 361 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Gm11460-201ENSMUST00000118200 361 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Gm15162-201ENSMUST00000119325 283 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Gm14922-201ENSMUST00000121131 163 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Gm15669-201ENSMUST00000147834 526 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Gm24443-201ENSMUST00000157242 132 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Gm22215-201ENSMUST00000157558 96 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Gm23476-201ENSMUST00000158881 274 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Gm16326-201ENSMUST00000162843 414 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Snord93-201ENSMUST00000175580 71 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Mir7242-201ENSMUST00000183710 79 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Gm45907-201ENSMUST00000213023 193 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 AC168266.1-201ENSMUST00000216024 226 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 AC152951.2-201ENSMUST00000218293 3587 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 AC125350.4-201ENSMUST00000225895 273 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Vmn1r83-202ENSMUST00000226701 2788 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Gm26458-201ENSMUST00000082832 128 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Olfr166-203ENSMUST00000216465 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Olfr68-202ENSMUST00000216811 4093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Gm45178-201ENSMUST00000207744 4110 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Zfp638-212ENSMUST00000203891 3968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Olfr623-202ENSMUST00000213840 3980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Trav20-201ENSMUST00000142754 347 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Gm23668-201ENSMUST00000157465 111 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Gm24716-201ENSMUST00000157524 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Gm22330-201ENSMUST00000158068 115 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Gm24006-201ENSMUST00000158462 132 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Mir3965-201ENSMUST00000175570 69 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Gm27220-201ENSMUST00000183453 262 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Gm27540-201ENSMUST00000184950 187 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 AC069074.2-201ENSMUST00000217819 428 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 4930520P13Rik-201ENSMUST00000222622 505 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 AC173482.5-201ENSMUST00000224181 327 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 AC165284.1-201ENSMUST00000228614 458 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Snord47-201ENSMUST00000083034 77 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 1700006A11Rik-201ENSMUST00000029598 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Olfr136-205ENSMUST00000216963 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 AC154386.1-201ENSMUST00000222753 2871 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Gm18751-201ENSMUST00000185777 2013 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Igkv17-127-201ENSMUST00000103309 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Gm24582-201ENSMUST00000103967 103 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 DQ267100-201ENSMUST00000122600 72 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Gm24879-201ENSMUST00000158386 143 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Gm24056-201ENSMUST00000158617 146 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Gm29022-201ENSMUST00000190702 225 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Mir465d-201ENSMUST00000196314 58 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Mir9-1-201ENSMUST00000199907 89 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Gm42739-201ENSMUST00000200687 226 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Olfr454-ps1-201ENSMUST00000205206 348 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Gm36546-201ENSMUST00000206372 230 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Gm44555-201ENSMUST00000209008 148 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Gm24474-201ENSMUST00000220504 469 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 AC159188.1-201ENSMUST00000225198 526 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 AC124524.1-201ENSMUST00000225833 181 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Gm24356-201ENSMUST00000082859 106 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Gm22973-201ENSMUST00000083298 191 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Gm24817-201ENSMUST00000093672 105 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Olfr124-204ENSMUST00000217365 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Olfr1463-202ENSMUST00000207246 2315 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
Hoxd1Q01822 Olfr1135-202ENSMUST00000213835 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Vmn1r185-211ENSMUST00000228467 6915 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 AC153967.1-201ENSMUST00000219333 3190 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm24121-201ENSMUST00000102029 106 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Traj56-201ENSMUST00000103689 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm12162-202ENSMUST00000129432 127 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Tnfaip8-206ENSMUST00000145726 632 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm26279-201ENSMUST00000157095 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm24750-201ENSMUST00000157843 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm23219-201ENSMUST00000158123 87 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm25373-201ENSMUST00000158156 115 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm17166-201ENSMUST00000172006 431 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm23002-201ENSMUST00000179221 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm29005-201ENSMUST00000186773 320 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm29014-201ENSMUST00000191422 326 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Tnfrsf23-203ENSMUST00000208017 544 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm45002-201ENSMUST00000208045 120 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 AC121942.2-201ENSMUST00000223824 600 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm10092-201ENSMUST00000077110 180 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm23461-201ENSMUST00000083265 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm23249-201ENSMUST00000083369 161 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm22744-201ENSMUST00000083444 65 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 U2surp-202ENSMUST00000079659 7630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Hoxd1Q01822 Gm44133-202ENSMUST00000204450 2586 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms