Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 AC158631.1-201ENSMUST00000219202 138 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RabggtbP53612 AC154636.2-201ENSMUST00000222538 161 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RabggtbP53612 AC121942.2-201ENSMUST00000223824 600 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RabggtbP53612 AC166830.2-201ENSMUST00000225821 196 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RabggtbP53612 Gm9218-201ENSMUST00000121068 2694 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RabggtbP53612 Olfr1240-202ENSMUST00000216123 4603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
RabggtbP53612 Vmn1r185-202ENSMUST00000226694 5656 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RabggtbP53612 Olfr104-ps-202ENSMUST00000215398 2771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RabggtbP53612 Snord19-201ENSMUST00000104609 76 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RabggtbP53612 Mir1b-201ENSMUST00000117012 122 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RabggtbP53612 Gm3848-202ENSMUST00000151564 301 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RabggtbP53612 Gm25425-201ENSMUST00000157611 96 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RabggtbP53612 Gm22316-201ENSMUST00000158012 216 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RabggtbP53612 Mir6386-201ENSMUST00000183558 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RabggtbP53612 Trbv6-201ENSMUST00000193743 276 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RabggtbP53612 Gm37624-201ENSMUST00000193751 219 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RabggtbP53612 Gm38064-201ENSMUST00000194032 444 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RabggtbP53612 Olfr468-ps1-201ENSMUST00000207203 593 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RabggtbP53612 Gm45778-201ENSMUST00000211959 153 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RabggtbP53612 Gm10298-201ENSMUST00000074801 265 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RabggtbP53612 Gm24204-201ENSMUST00000082950 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RabggtbP53612 Scai-201ENSMUST00000038874 10709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
RabggtbP53612 Zfp280c-204ENSMUST00000114940 3863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
RabggtbP53612 Gm42482-201ENSMUST00000198904 1947 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RabggtbP53612 Olfr857-203ENSMUST00000217450 2271 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RabggtbP53612 Macc1-203ENSMUST00000221917 4272 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RabggtbP53612 Gm44150-201ENSMUST00000203317 2619 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RabggtbP53612 Vmn1r77-204ENSMUST00000228213 8094 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RabggtbP53612 Mir499-201ENSMUST00000102357 79 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RabggtbP53612 Gm25269-201ENSMUST00000122601 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RabggtbP53612 Gm25051-201ENSMUST00000158602 249 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RabggtbP53612 Gm15562-201ENSMUST00000161397 426 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
RabggtbP53612 Gm16289-201ENSMUST00000162079 183 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RabggtbP53612 Gm25615-201ENSMUST00000177836 94 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RabggtbP53612 Gm27220-201ENSMUST00000183453 262 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RabggtbP53612 Igkv13-80-1-201ENSMUST00000197926 255 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RabggtbP53612 AC157476.1-201ENSMUST00000215555 169 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RabggtbP53612 Gm26204-201ENSMUST00000082906 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RabggtbP53612 Pcdh11x-206ENSMUST00000192677 9097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RabggtbP53612 Macf1-203ENSMUST00000097897 23495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
RabggtbP53612 Olfr346-202ENSMUST00000213258 4104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RabggtbP53612 Olfr352-202ENSMUST00000217325 3337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RabggtbP53612 Gm23011-201ENSMUST00000104148 132 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RabggtbP53612 DQ267100-201ENSMUST00000122600 72 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RabggtbP53612 Gm37997-201ENSMUST00000193515 267 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RabggtbP53612 Gm34648-201ENSMUST00000202460 338 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RabggtbP53612 4930598N05Rik-207ENSMUST00000208997 83 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RabggtbP53612 Gm18000-201ENSMUST00000212153 800 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RabggtbP53612 AC131759.1-201ENSMUST00000220642 310 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RabggtbP53612 AC127371.1-202ENSMUST00000228923 306 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RabggtbP53612 Olfr918-202ENSMUST00000215461 3783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RabggtbP53612 Olfr878-203ENSMUST00000214263 4003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RabggtbP53612 Vmn1r211-202ENSMUST00000228645 5447 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RabggtbP53612 Vmn1r83-202ENSMUST00000226701 2788 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Pak3-205ENSMUST00000112868 8163 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm42684-201ENSMUST00000197663 3615 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm14803-201ENSMUST00000117163 361 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm14402-201ENSMUST00000122217 508 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm12443-201ENSMUST00000122308 323 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm11204-201ENSMUST00000122438 147 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm12325-201ENSMUST00000135553 320 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm23466-201ENSMUST00000157133 106 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm23209-201ENSMUST00000158667 110 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Olfr1366-201ENSMUST00000168629 1054 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm23571-201ENSMUST00000180073 127 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Mir7013-201ENSMUST00000183540 72 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm18341-201ENSMUST00000197538 622 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm18015-201ENSMUST00000214879 316 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Olfr1366-204ENSMUST00000218154 1054 ntAPPRIS P2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 AC123860.1-201ENSMUST00000228033 481 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm26495-201ENSMUST00000083152 137 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Vmn2r81-201ENSMUST00000020547 3276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Wnk3-201ENSMUST00000096285 8551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Olfr298-204ENSMUST00000217110 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm12128-201ENSMUST00000131013 2914 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Olfr789-202ENSMUST00000213992 4421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm44842-201ENSMUST00000209173 3372 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Hsf3-202ENSMUST00000119035 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm16171-201ENSMUST00000118004 324 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm6829-201ENSMUST00000119858 360 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm22560-201ENSMUST00000157332 120 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm17364-201ENSMUST00000163881 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm27648-201ENSMUST00000184315 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Scgb2b14-ps-201ENSMUST00000189424 336 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm44524-201ENSMUST00000203899 271 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 4930520P13Rik-201ENSMUST00000222622 505 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 AC135292.1-201ENSMUST00000227665 204 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm24966-201ENSMUST00000082443 79 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm23377-201ENSMUST00000082943 126 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Mir137-201ENSMUST00000083635 73 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm37479-201ENSMUST00000194169 3841 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Cp-202ENSMUST00000091309 4029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Olfr509-203ENSMUST00000214861 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm25538-201ENSMUST00000101943 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Mir682-201ENSMUST00000102281 96 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Igkv6-13-201ENSMUST00000103395 287 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm24132-201ENSMUST00000104745 91 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Ear-ps8-201ENSMUST00000161935 354 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Gm24106-201ENSMUST00000175498 127 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RabggtbP53612 Mir7242-201ENSMUST00000183710 79 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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