Protein–RNA interactions for Protein: P31311

Hoxa11, Homeobox protein Hox-A11, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa11P31311 Gm18341-201ENSMUST00000197538 622 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Vmn1r-ps6-202ENSMUST00000202526 135 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm15102-201ENSMUST00000118740 1502 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm10033-201ENSMUST00000072427 1813 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Olfr1046-202ENSMUST00000213987 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Cylc1-201ENSMUST00000101282 1923 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 U2surp-202ENSMUST00000079659 7630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm23472-201ENSMUST00000101806 191 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm24640-201ENSMUST00000116949 126 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm22626-201ENSMUST00000116990 126 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm12443-201ENSMUST00000122308 323 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm26479-201ENSMUST00000122620 106 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 n-R5s87-201ENSMUST00000122752 116 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm23559-201ENSMUST00000157824 103 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm24212-201ENSMUST00000158258 132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Mir3075-201ENSMUST00000175340 85 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm24497-201ENSMUST00000177868 191 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm24761-201ENSMUST00000179589 127 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm25939-201ENSMUST00000179876 191 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm24488-201ENSMUST00000179934 127 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm25701-201ENSMUST00000179988 127 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm26431-201ENSMUST00000180199 127 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Rgs1-208ENSMUST00000189061 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm28848-201ENSMUST00000189984 168 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm43978-201ENSMUST00000203491 451 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 AC125350.4-201ENSMUST00000225895 273 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm5899-201ENSMUST00000071770 270 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm23444-201ENSMUST00000082922 191 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Tlr3-202ENSMUST00000167106 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Olfr1463-202ENSMUST00000207246 2315 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Slc16a7-206ENSMUST00000211781 10981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Olfr811-204ENSMUST00000217571 2399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm22984-201ENSMUST00000122751 122 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm23901-201ENSMUST00000157570 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm24726-201ENSMUST00000158232 121 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Ear-ps4-201ENSMUST00000166834 450 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm16405-201ENSMUST00000169247 468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm24308-201ENSMUST00000177773 114 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm7958-201ENSMUST00000178255 468 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm24799-201ENSMUST00000178431 79 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm7950-201ENSMUST00000179633 468 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm5224-201ENSMUST00000183060 350 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Trav6-3-202ENSMUST00000183604 305 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Trav6d-3-202ENSMUST00000184883 308 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm40810-201ENSMUST00000219149 253 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Olfr830-202ENSMUST00000212723 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Olfr1457-204ENSMUST00000215229 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Ranbp2-201ENSMUST00000003310 9608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Cyp3a41a-201ENSMUST00000094111 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Vmn1r76-202ENSMUST00000226300 8189 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm14073-201ENSMUST00000117344 381 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm14402-201ENSMUST00000122217 508 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm25945-201ENSMUST00000122484 135 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm23331-201ENSMUST00000157423 108 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm25333-201ENSMUST00000158035 246 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm26024-201ENSMUST00000158657 322 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm14435-203ENSMUST00000172025 192 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm37923-201ENSMUST00000191624 161 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Sprr2h-202ENSMUST00000191886 297 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm30341-201ENSMUST00000194363 289 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm43680-201ENSMUST00000199466 340 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 AC164161.1-201ENSMUST00000214076 639 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm24152-201ENSMUST00000082764 163 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm14440-201ENSMUST00000098998 192 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Olfr1437-202ENSMUST00000207241 3751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm19965-201ENSMUST00000179777 3030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Adgrg4-204ENSMUST00000153784 9329 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm4746-201ENSMUST00000120395 2406 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Zfp985-201ENSMUST00000081742 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Olfr339-202ENSMUST00000216645 4867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm25875-201ENSMUST00000104323 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Rpl30-ps9-201ENSMUST00000122265 345 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm24358-201ENSMUST00000158424 288 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm23864-201ENSMUST00000177607 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Mir6386-201ENSMUST00000183558 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm29262-201ENSMUST00000190084 196 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm37746-201ENSMUST00000193249 198 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm37754-201ENSMUST00000194406 452 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm37089-201ENSMUST00000195616 129 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm8013-201ENSMUST00000200139 462 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm45859-201ENSMUST00000212794 214 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 AC133517.1-203ENSMUST00000225570 390 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Vmn1r19-201ENSMUST00000089830 2255 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm26473-201ENSMUST00000116763 127 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm14894-201ENSMUST00000117170 270 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm15002-201ENSMUST00000118406 452 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Rps13-ps8-201ENSMUST00000118906 401 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm15183-201ENSMUST00000118933 348 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm12934-201ENSMUST00000119221 343 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm14782-201ENSMUST00000120151 195 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm25543-201ENSMUST00000122678 312 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm25392-201ENSMUST00000157335 297 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm24210-201ENSMUST00000158263 133 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm24056-201ENSMUST00000158617 146 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Mir6336-201ENSMUST00000183581 130 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm37449-201ENSMUST00000193016 270 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm37037-201ENSMUST00000194475 424 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm18658-201ENSMUST00000195558 270 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Gm44337-201ENSMUST00000196553 114 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Hoxa11P31311 Mir376a-201ENSMUST00000197584 68 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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