Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 1700011B04Rik-211ENSMUST00000222690 394 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm23645-201ENSMUST00000083228 108 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm24282-201ENSMUST00000104232 66 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PtprmP28828 AA413626-201ENSMUST00000121125 494 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm25325-201ENSMUST00000122559 86 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm23586-201ENSMUST00000157657 123 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm23090-201ENSMUST00000177331 78 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm27342-201ENSMUST00000183530 109 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm42925-201ENSMUST00000197359 285 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm10033-201ENSMUST00000072427 1813 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm43706-201ENSMUST00000198767 2652 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm23656-201ENSMUST00000122626 112 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm12823-201ENSMUST00000134494 318 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm15279-201ENSMUST00000155593 288 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm8114-201ENSMUST00000172225 484 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Vmn1r-ps150-201ENSMUST00000176659 736 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm10719-203ENSMUST00000179272 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm27420-201ENSMUST00000183823 79 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Gm29648-201ENSMUST00000188651 650 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
PtprmP28828 Vmn1r-ps6-201ENSMUST00000201079 934 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PtprmP28828 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm26338-201ENSMUST00000102372 110 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm23836-201ENSMUST00000104434 129 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Tas2r122-201ENSMUST00000105077 930 ntAPPRIS P1 BASIC0.4□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm23206-201ENSMUST00000122720 184 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm26152-201ENSMUST00000157427 101 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm24480-201ENSMUST00000157442 103 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm16577-201ENSMUST00000161579 471 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm23144-201ENSMUST00000180226 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm28560-201ENSMUST00000186091 315 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm28334-201ENSMUST00000186653 315 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm28495-201ENSMUST00000188452 315 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm28232-201ENSMUST00000188683 315 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm28481-201ENSMUST00000189231 315 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm29059-201ENSMUST00000191534 315 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm37765-201ENSMUST00000192395 315 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm37237-201ENSMUST00000192893 315 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm36968-201ENSMUST00000193737 315 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm38290-201ENSMUST00000195238 315 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm42570-201ENSMUST00000195937 292 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PtprmP28828 CT485607.2-201ENSMUST00000214650 91 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PtprmP28828 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
PtprmP28828 AC154552.7-201ENSMUST00000222824 156 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm23462-201ENSMUST00000083264 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm24610-201ENSMUST00000083270 109 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Mir421-201ENSMUST00000083575 76 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Mir362-201ENSMUST00000093592 65 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm13723-201ENSMUST00000130722 5036 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.39□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Ppp1r42-201ENSMUST00000027049 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm42718-201ENSMUST00000197319 2681 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm23203-201ENSMUST00000104374 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm14937-201ENSMUST00000119709 208 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm11358-201ENSMUST00000122310 373 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Esp4-201ENSMUST00000178498 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm27402-201ENSMUST00000183890 120 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm36956-201ENSMUST00000193830 214 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm2829-201ENSMUST00000213121 499 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PtprmP28828 1700127F24Rik-202ENSMUST00000223214 259 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Olfr907-201ENSMUST00000052901 933 ntAPPRIS P1 BASIC0.39□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm12670-201ENSMUST00000123606 576 ntTSL 2 BASIC0.38□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm11240-201ENSMUST00000142047 751 ntTSL 1 (best) BASIC0.38□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm25059-201ENSMUST00000157367 117 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm26150-201ENSMUST00000157426 151 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm23277-201ENSMUST00000157914 136 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm20438-201ENSMUST00000174441 329 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm10717-206ENSMUST00000177875 675 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm25596-201ENSMUST00000178368 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm10717-207ENSMUST00000179264 672 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm10717-208ENSMUST00000179839 681 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm10717-209ENSMUST00000179982 681 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Mir6364-201ENSMUST00000183396 86 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Mir6411-201ENSMUST00000183556 108 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Ska2l-ps-201ENSMUST00000186208 360 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm28706-201ENSMUST00000186830 355 ntTSL 2 BASIC0.38□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm29600-201ENSMUST00000188687 377 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm38231-201ENSMUST00000192030 347 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm42509-201ENSMUST00000197390 781 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PtprmP28828 AC152951.1-201ENSMUST00000218907 266 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm20102-201ENSMUST00000222445 220 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Stfa2-201ENSMUST00000023619 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.38□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm10717-204ENSMUST00000099056 669 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm11168-201ENSMUST00000177722 684 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm21094-201ENSMUST00000177842 498 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm11168-202ENSMUST00000178077 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm20837-201ENSMUST00000178446 498 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm21739-201ENSMUST00000178639 498 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm28891-201ENSMUST00000178751 498 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm28490-201ENSMUST00000179076 498 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm21861-201ENSMUST00000179480 498 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm21256-201ENSMUST00000179672 498 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm20838-201ENSMUST00000179884 498 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm21679-201ENSMUST00000180373 498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm28110-201ENSMUST00000185782 315 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm29057-201ENSMUST00000186468 315 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm28737-201ENSMUST00000186808 315 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm29147-201ENSMUST00000186846 315 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm29118-201ENSMUST00000186908 315 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm28433-201ENSMUST00000187085 315 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PtprmP28828 Gm29227-201ENSMUST00000187139 315 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
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