Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 AC121844.2-201ENSMUST00000219067 2066 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm9218-201ENSMUST00000121068 2694 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm44680-201ENSMUST00000208414 2910 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RxraP28700 Mir344c-201ENSMUST00000103919 92 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm12235-201ENSMUST00000118596 170 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm12647-201ENSMUST00000118977 265 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm14919-201ENSMUST00000120839 390 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm13942-201ENSMUST00000136950 325 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm25153-201ENSMUST00000157118 156 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm23759-201ENSMUST00000158351 268 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm24053-201ENSMUST00000158620 105 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm22258-201ENSMUST00000177645 94 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm26032-201ENSMUST00000178535 94 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm25210-201ENSMUST00000178813 94 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm25157-201ENSMUST00000178914 94 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm25933-201ENSMUST00000178943 108 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm22046-201ENSMUST00000179027 94 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm22941-201ENSMUST00000179630 94 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm25471-201ENSMUST00000180126 94 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RxraP28700 Mir7013-201ENSMUST00000183540 72 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RxraP28700 Mir6916-201ENSMUST00000184514 63 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm27991-201ENSMUST00000184804 137 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RxraP28700 Ska2l-ps-201ENSMUST00000186208 360 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RxraP28700 Scgb1b13-ps-201ENSMUST00000187330 273 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm37713-201ENSMUST00000191746 198 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RxraP28700 Mir7116-201ENSMUST00000195956 70 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm43583-201ENSMUST00000199235 303 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RxraP28700 Vmn2r-ps102-203ENSMUST00000222739 604 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RxraP28700 Olfr1009-201ENSMUST00000055517 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm26126-201ENSMUST00000083188 164 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm25793-201ENSMUST00000083287 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RxraP28700 Olfr1309-205ENSMUST00000216948 5168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm37331-201ENSMUST00000192367 3375 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm11115-201ENSMUST00000113255 54 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm24691-201ENSMUST00000157762 140 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm23355-201ENSMUST00000177614 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm23148-201ENSMUST00000180367 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm44473-201ENSMUST00000204039 152 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RxraP28700 Olfr277-ps1-201ENSMUST00000205749 285 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm45452-201ENSMUST00000210905 177 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RxraP28700 AC154552.7-201ENSMUST00000222824 156 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm25258-201ENSMUST00000083049 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm25124-201ENSMUST00000083345 164 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm26107-201ENSMUST00000083972 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm24817-201ENSMUST00000093672 105 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RxraP28700 CT009504.1-201ENSMUST00000218252 3330 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RxraP28700 Zfy2-201ENSMUST00000115891 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm15303-201ENSMUST00000118676 2624 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RxraP28700 Mir682-201ENSMUST00000102281 96 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RxraP28700 Mir466k-201ENSMUST00000116774 122 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm14894-201ENSMUST00000117170 270 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm12351-201ENSMUST00000118727 292 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm14001-201ENSMUST00000118847 247 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm13913-201ENSMUST00000121126 260 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm11240-201ENSMUST00000142047 751 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm23223-201ENSMUST00000158119 127 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm23579-201ENSMUST00000158528 103 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RxraP28700 Mir1927-201ENSMUST00000158579 109 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm21827-201ENSMUST00000178247 423 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RxraP28700 Scgb2b17-202ENSMUST00000182640 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RxraP28700 Ranbp2-ps6-201ENSMUST00000183722 381 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm27532-201ENSMUST00000183726 113 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RxraP28700 Mir7014-201ENSMUST00000183853 63 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm38127-201ENSMUST00000191978 468 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm37449-201ENSMUST00000193016 270 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm18658-201ENSMUST00000195558 270 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RxraP28700 Mir7661-201ENSMUST00000197023 61 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RxraP28700 Mir3069-201ENSMUST00000198802 65 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RxraP28700 CAAA01090905.1-201ENSMUST00000219056 426 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RxraP28700 AC129017.1-201ENSMUST00000228363 270 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm37096-201ENSMUST00000192317 2058 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RxraP28700 AC160115.1-201ENSMUST00000224678 1574 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RxraP28700 mt-Nd4-201ENSMUST00000082414 1378 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RxraP28700 Olfr851-202ENSMUST00000214130 7123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm24049-201ENSMUST00000102409 100 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RxraP28700 Mir465b-1-201ENSMUST00000103940 79 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RxraP28700 Mir465b-2-201ENSMUST00000104662 79 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm6574-201ENSMUST00000120037 362 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm12926-201ENSMUST00000121158 409 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RxraP28700 n-R5s191-201ENSMUST00000122724 116 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RxraP28700 Vmn2r-ps18-201ENSMUST00000177972 380 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm29512-201ENSMUST00000185544 315 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm28110-201ENSMUST00000185782 315 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm28058-201ENSMUST00000186421 264 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm29057-201ENSMUST00000186468 315 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm29661-201ENSMUST00000186781 315 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm28737-201ENSMUST00000186808 315 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm29118-201ENSMUST00000186908 315 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm28433-201ENSMUST00000187085 315 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm28759-201ENSMUST00000187621 315 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm28831-201ENSMUST00000187739 315 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm28200-201ENSMUST00000187778 315 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm28752-201ENSMUST00000188340 315 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm29378-201ENSMUST00000188723 315 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm28569-201ENSMUST00000188748 315 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm28120-201ENSMUST00000188812 315 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm28369-201ENSMUST00000188993 315 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm29037-201ENSMUST00000189092 313 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm28909-201ENSMUST00000189406 315 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RxraP28700 Gm28861-201ENSMUST00000189681 315 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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