Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Vmn1r185-202ENSMUST00000226694 5656 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PrkcaP20444 Olfr849-202ENSMUST00000217273 6140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PrkcaP20444 Mgat4c-201ENSMUST00000020039 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
PrkcaP20444 Gm14914-201ENSMUST00000117576 2031 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PrkcaP20444 Zfp984-201ENSMUST00000105734 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PrkcaP20444 Adam5-201ENSMUST00000050300 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
PrkcaP20444 Gm26423-201ENSMUST00000104277 128 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PrkcaP20444 Gm23530-201ENSMUST00000104564 137 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PrkcaP20444 Gm12449-201ENSMUST00000117572 234 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PrkcaP20444 Gm8260-201ENSMUST00000119230 353 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PrkcaP20444 Gm12213-201ENSMUST00000119924 353 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PrkcaP20444 Gm24936-201ENSMUST00000122598 247 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PrkcaP20444 Gm25625-201ENSMUST00000157221 96 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PrkcaP20444 Gm23535-201ENSMUST00000157542 106 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PrkcaP20444 Mir1934-201ENSMUST00000158127 83 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PrkcaP20444 Gm16404-201ENSMUST00000177739 468 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PrkcaP20444 Vmn2r-ps17-201ENSMUST00000178733 375 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PrkcaP20444 Gm14598-201ENSMUST00000180109 468 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PrkcaP20444 Gm14625-201ENSMUST00000180231 468 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PrkcaP20444 AC154296.1-201ENSMUST00000198150 67 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PrkcaP20444 Gm45116-201ENSMUST00000207392 275 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PrkcaP20444 AC122484.1-201ENSMUST00000221578 177 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PrkcaP20444 Gm9765-201ENSMUST00000043170 321 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PrkcaP20444 Zfp273-201ENSMUST00000012725 2277 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
PrkcaP20444 Olfr1216-203ENSMUST00000217000 3667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PrkcaP20444 Olfr124-203ENSMUST00000216478 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PrkcaP20444 Olfr103-202ENSMUST00000173472 3079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PrkcaP20444 AC153964.2-201ENSMUST00000217704 2474 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PrkcaP20444 AC167250.1-201ENSMUST00000213739 3813 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
PrkcaP20444 Gm26075-201ENSMUST00000104062 121 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm15497-201ENSMUST00000119137 551 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm24905-201ENSMUST00000158129 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Vmn2r-ps58-201ENSMUST00000173044 242 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm23933-201ENSMUST00000178405 79 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm8739-201ENSMUST00000185962 181 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm6003-201ENSMUST00000187903 463 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 A930014E01Rik-201ENSMUST00000194572 330 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm44470-201ENSMUST00000203913 142 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Olfr880-ps1-201ENSMUST00000212344 229 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 CT009748.1-201ENSMUST00000216068 269 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 AC154358.1-201ENSMUST00000224871 218 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 AC160984.2-201ENSMUST00000224927 791 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Mir101b-201ENSMUST00000083622 97 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm10813-201ENSMUST00000099936 90 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm27047-201ENSMUST00000183072 1819 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Olfr1461-202ENSMUST00000207113 3481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Olfr881-202ENSMUST00000212489 4237 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm3234-202ENSMUST00000223301 3250 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm45038-201ENSMUST00000207537 3838 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Slc16a7-206ENSMUST00000211781 10981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Olfr609-202ENSMUST00000216075 3429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 A330044P14Rik-201ENSMUST00000176108 2706 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Olfr25-203ENSMUST00000214155 6479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Trav7-2-201ENSMUST00000103636 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm13656-201ENSMUST00000123829 345 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Rps15a-ps5-201ENSMUST00000132586 393 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm25519-201ENSMUST00000158392 127 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm22075-201ENSMUST00000158599 192 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm22699-201ENSMUST00000175376 105 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm22367-201ENSMUST00000178930 132 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm25457-201ENSMUST00000179509 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Mir21b-201ENSMUST00000184317 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm28992-201ENSMUST00000190534 139 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Igkv13-54-1-201ENSMUST00000196495 303 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Trav7d-2-201ENSMUST00000200127 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm45080-201ENSMUST00000206648 283 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Olfr1202-202ENSMUST00000214703 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 AL627387.1-201ENSMUST00000226063 250 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm24453-201ENSMUST00000083346 76 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 AC122850.1-201ENSMUST00000220380 5690 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Olfr835-202ENSMUST00000213018 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Olfr776-202ENSMUST00000213512 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm37515-201ENSMUST00000193321 3817 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm26573-201ENSMUST00000181199 3020 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Olfr814-202ENSMUST00000213742 3798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm15961-201ENSMUST00000156090 266 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm22384-201ENSMUST00000158187 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm26291-201ENSMUST00000158889 137 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm22476-201ENSMUST00000158902 100 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm28314-201ENSMUST00000191276 345 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm40604-202ENSMUST00000219541 522 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm21007-201ENSMUST00000221024 326 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm11351-202ENSMUST00000225724 478 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Thoc1-201ENSMUST00000025137 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm43780-201ENSMUST00000196510 3600 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Prlr-205ENSMUST00000128921 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm43875-201ENSMUST00000203319 2475 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Olfr896-ps1-203ENSMUST00000216276 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Defb43-201ENSMUST00000100491 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm15282-201ENSMUST00000117707 300 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm12143-201ENSMUST00000119666 332 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm12897-201ENSMUST00000120341 250 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Atp5k-ps2-201ENSMUST00000120437 210 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm15365-201ENSMUST00000122392 300 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Mir1936-201ENSMUST00000158699 93 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm22527-201ENSMUST00000158816 106 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm25020-201ENSMUST00000178071 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Gm33424-201ENSMUST00000222317 257 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 AC166369.3-201ENSMUST00000227286 409 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PrkcaP20444 Olfr1370-201ENSMUST00000058168 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms