Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 n-R5s189-201ENSMUST00000122675 114 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
MttpO08601 Gm23813-201ENSMUST00000175153 77 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
MttpO08601 Gm22264-201ENSMUST00000178200 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
MttpO08601 Gm10421-202ENSMUST00000186114 132 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
MttpO08601 Gm42439-201ENSMUST00000195931 486 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
MttpO08601 Gm44654-201ENSMUST00000208052 329 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
MttpO08601 Gm22685-201ENSMUST00000082848 106 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
MttpO08601 AW112010-201ENSMUST00000099676 770 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
MttpO08601 Olfr1201-203ENSMUST00000216213 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
MttpO08601 Gm45393-201ENSMUST00000211634 2631 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MttpO08601 AC132221.1-201ENSMUST00000220577 3841 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MttpO08601 Gm5396-201ENSMUST00000121222 532 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MttpO08601 Gm13976-201ENSMUST00000154367 479 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
MttpO08601 Gm22159-201ENSMUST00000158412 130 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MttpO08601 Snord11-201ENSMUST00000158468 84 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MttpO08601 Gm22800-201ENSMUST00000175627 94 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MttpO08601 Gm24304-201ENSMUST00000177635 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MttpO08601 Mir6399-201ENSMUST00000184050 84 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MttpO08601 Gm25820-202ENSMUST00000197479 128 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MttpO08601 Igkv14-118-1-201ENSMUST00000198645 334 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MttpO08601 Gm44010-201ENSMUST00000204432 331 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MttpO08601 Gm18991-201ENSMUST00000209225 746 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MttpO08601 Gm2829-201ENSMUST00000213121 499 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MttpO08601 AC132437.1-201ENSMUST00000218308 320 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MttpO08601 Mir322-201ENSMUST00000083484 95 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MttpO08601 Gm26329-201ENSMUST00000093723 110 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MttpO08601 Gm37061-201ENSMUST00000195066 3243 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MttpO08601 AC125374.3-201ENSMUST00000214983 2810 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MttpO08601 Zfy2-201ENSMUST00000115891 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
MttpO08601 Defb43-201ENSMUST00000100491 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
MttpO08601 Gm26077-201ENSMUST00000104064 123 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MttpO08601 Mdga2-203ENSMUST00000113942 423 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MttpO08601 Rps13-ps8-201ENSMUST00000118906 401 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MttpO08601 Gm10772-201ENSMUST00000167981 255 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
MttpO08601 Gm22242-201ENSMUST00000175224 118 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MttpO08601 Gm24308-201ENSMUST00000177773 114 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MttpO08601 Gm27753-201ENSMUST00000184742 203 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MttpO08601 Mir7226-201ENSMUST00000184953 60 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MttpO08601 Gm28995-201ENSMUST00000186625 261 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MttpO08601 Igkv2-93-1-201ENSMUST00000196774 272 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MttpO08601 Gm44429-201ENSMUST00000203542 186 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MttpO08601 Gm43914-201ENSMUST00000203592 594 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MttpO08601 Snhg1-208ENSMUST00000206029 408 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
MttpO08601 AC121942.2-201ENSMUST00000223824 600 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MttpO08601 AC124104.1-201ENSMUST00000226279 417 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MttpO08601 AC027184.1-201ENSMUST00000226991 424 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MttpO08601 AC151833.1-201ENSMUST00000227752 574 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MttpO08601 Gm22978-201ENSMUST00000082607 160 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MttpO08601 Cylc1-201ENSMUST00000101282 1923 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
MttpO08601 Gm37895-201ENSMUST00000192448 4550 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MttpO08601 Gpr174-204ENSMUST00000120971 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
MttpO08601 Olfr1148-202ENSMUST00000215230 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
MttpO08601 Gm45558-201ENSMUST00000209384 1895 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MttpO08601 Gm7173-205ENSMUST00000197180 9412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
MttpO08601 Tlr8-202ENSMUST00000112170 3431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.05
MttpO08601 Olfr801-203ENSMUST00000213294 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.05
MttpO08601 Gm24010-201ENSMUST00000157731 282 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
MttpO08601 Gm5269-201ENSMUST00000183590 138 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
MttpO08601 Gm28257-201ENSMUST00000185244 463 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
MttpO08601 Gm28579-201ENSMUST00000186143 369 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
MttpO08601 Gm29155-202ENSMUST00000186289 216 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
MttpO08601 Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 184 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
MttpO08601 Igkv13-55-1-201ENSMUST00000200400 308 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
MttpO08601 Vmn1r-ps13-201ENSMUST00000204697 134 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
MttpO08601 Olfr1315-ps1-202ENSMUST00000208654 945 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
MttpO08601 AC159632.1-201ENSMUST00000221808 317 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
MttpO08601 Defb40-201ENSMUST00000066258 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
MttpO08601 Mir133a-1-201ENSMUST00000083465 68 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
MttpO08601 Nkain2-202ENSMUST00000092603 273 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
MttpO08601 Gm10720-201ENSMUST00000099050 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
MttpO08601 Knl1-202ENSMUST00000028802 7800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
MttpO08601 Gm38255-201ENSMUST00000194910 2996 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
MttpO08601 Olfr1291-ps1-201ENSMUST00000121345 5403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
MttpO08601 Snhg14-213ENSMUST00000190666 3708 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
MttpO08601 Gm22494-201ENSMUST00000104495 128 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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MttpO08601 Trav5n-3-201ENSMUST00000164511 270 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MttpO08601 Gm29069-201ENSMUST00000185857 675 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
MttpO08601 Gm28627-201ENSMUST00000186141 453 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MttpO08601 Gm28951-201ENSMUST00000190742 313 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MttpO08601 Gm37338-201ENSMUST00000191986 127 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MttpO08601 Calml4-204ENSMUST00000214633 394 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
MttpO08601 AC116460.1-201ENSMUST00000219040 313 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MttpO08601 CT033785.1-201ENSMUST00000224872 272 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MttpO08601 AC167669.4-201ENSMUST00000225967 140 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MttpO08601 Gm23625-201ENSMUST00000082457 100 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MttpO08601 Mir181a-2-201ENSMUST00000083489 76 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MttpO08601 Mir222-201ENSMUST00000083537 79 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MttpO08601 Snora69-201ENSMUST00000083708 131 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MttpO08601 Vmn1r86-201ENSMUST00000094828 951 ntAPPRIS P2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
MttpO08601 Olfr857-203ENSMUST00000217450 2271 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
MttpO08601 AC158598.1-201ENSMUST00000214349 3847 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
MttpO08601 Igkv17-127-201ENSMUST00000103309 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
MttpO08601 Igkv17-121-201ENSMUST00000103315 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
MttpO08601 Vmn1r-ps125-201ENSMUST00000117767 290 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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