Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q6

Cdh18, Cadherin 18, mousemouse

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh18E9Q9Q6 Gm23262-201ENSMUST00000158323 168 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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Cdh18E9Q9Q6 Igkv4-65-201ENSMUST00000196986 358 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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Cdh18E9Q9Q6 Gm10772-201ENSMUST00000167981 255 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
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Cdh18E9Q9Q6 Gm32817-202ENSMUST00000210738 527 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
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Cdh18E9Q9Q6 Il1rapl1-202ENSMUST00000113964 1936 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
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Cdh18E9Q9Q6 Defa-ps8-201ENSMUST00000120972 279 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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Cdh18E9Q9Q6 Snora69-201ENSMUST00000083708 131 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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Cdh18E9Q9Q6 Gm26329-201ENSMUST00000093723 110 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cdh18E9Q9Q6 CT030170.3-201ENSMUST00000221205 1815 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cdh18E9Q9Q6 Cylc1-201ENSMUST00000101282 1923 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
Cdh18E9Q9Q6 Gm29106-201ENSMUST00000186264 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Cdh18E9Q9Q6 Gm23951-201ENSMUST00000104029 132 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cdh18E9Q9Q6 Skint2-203ENSMUST00000106560 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
Cdh18E9Q9Q6 Gm14748-201ENSMUST00000119819 411 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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