Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18696-201ENSMUST00000220103 274 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC120383.1-201ENSMUST00000221123 573 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20102-201ENSMUST00000222445 220 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl31-ps2-201ENSMUST00000223231 343 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC124569.4-201ENSMUST00000223830 1220 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT010506.2-201ENSMUST00000225618 183 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp934-201ENSMUST00000082203 993 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 mt-Co3-201ENSMUST00000082409 784 ntAPPRIS P1 BASIC0.81□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10542-201ENSMUST00000097586 273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r75-202ENSMUST00000226622 6638 ntAPPRIS P2 BASIC0.81□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24430-201ENSMUST00000104077 104 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir3061-201ENSMUST00000175129 91 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21815-201ENSMUST00000178213 664 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26652-202ENSMUST00000181672 475 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trbv22-201ENSMUST00000191697 291 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38113-201ENSMUST00000193704 201 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5010-201ENSMUST00000213131 260 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT009696.1-201ENSMUST00000215745 256 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18188-201ENSMUST00000219386 478 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC167229.1-201ENSMUST00000220057 469 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26437-201ENSMUST00000082595 105 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir196b-201ENSMUST00000083509 85 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr199-202ENSMUST00000214186 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12779-201ENSMUST00000121496 143 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20386-201ENSMUST00000174010 132 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn2r-ps18-201ENSMUST00000177972 380 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23619-201ENSMUST00000178411 94 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn2r-ps17-201ENSMUST00000178733 375 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25474-201ENSMUST00000179052 94 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22047-201ENSMUST00000179176 94 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 AL928567.1-201ENSMUST00000197891 138 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm39473-201ENSMUST00000223498 522 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC123709.1-201ENSMUST00000224848 345 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC138667.2-201ENSMUST00000224880 598 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC173482.4-201ENSMUST00000225096 348 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26249-201ENSMUST00000116708 118 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp965-204ENSMUST00000143490 297 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25663-201ENSMUST00000157698 135 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16588-201ENSMUST00000162889 355 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r-ps47-201ENSMUST00000176694 907 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25670-201ENSMUST00000178423 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26239-201ENSMUST00000178842 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24267-201ENSMUST00000179841 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37399-201ENSMUST00000195224 416 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42439-201ENSMUST00000195931 486 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Calml4-204ENSMUST00000214633 394 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC168062.3-201ENSMUST00000227025 165 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24292-201ENSMUST00000082888 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12806-201ENSMUST00000119384 268 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25544-201ENSMUST00000122676 120 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25715-201ENSMUST00000158627 125 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25491-201ENSMUST00000158733 308 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23777-201ENSMUST00000158994 259 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir344d-3-201ENSMUST00000175458 80 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11168-203ENSMUST00000178348 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scgb1b8-ps-201ENSMUST00000189652 249 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm39231-201ENSMUST00000209813 501 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22229-201ENSMUST00000082987 108 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14797-201ENSMUST00000119378 1480 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rgs13-202ENSMUST00000111941 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12080-201ENSMUST00000119821 1883 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23000-201ENSMUST00000157083 139 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17100-201ENSMUST00000168963 272 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn2r-ps65-201ENSMUST00000173309 220 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21518-201ENSMUST00000178115 567 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20736-201ENSMUST00000178198 567 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20843-201ENSMUST00000178505 567 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21209-201ENSMUST00000178556 567 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21258-201ENSMUST00000178673 567 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20888-201ENSMUST00000178934 567 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21650-201ENSMUST00000179073 567 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20937-201ENSMUST00000180329 567 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29005-201ENSMUST00000186773 320 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19901-201ENSMUST00000192191 495 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37146-201ENSMUST00000192572 463 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43602-201ENSMUST00000196772 300 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10264-201ENSMUST00000220589 429 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC167669.4-201ENSMUST00000225967 140 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9795-201ENSMUST00000062156 693 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5899-201ENSMUST00000071770 270 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26228-201ENSMUST00000082512 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25080-201ENSMUST00000082526 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25851-201ENSMUST00000082794 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25518-201ENSMUST00000083864 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 8030445P17Rik-201ENSMUST00000192614 2741 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12432-201ENSMUST00000119540 186 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11389-201ENSMUST00000121407 430 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22477-201ENSMUST00000122569 316 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17052-201ENSMUST00000165496 289 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27974-201ENSMUST00000183415 105 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27420-201ENSMUST00000183823 79 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir7663-201ENSMUST00000183950 61 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir6240-201ENSMUST00000184281 117 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43250-201ENSMUST00000196536 273 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm46997-201ENSMUST00000222108 217 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC121844.2-201ENSMUST00000219067 2066 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24579-201ENSMUST00000103964 144 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir5104-201ENSMUST00000175319 94 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17535-201ENSMUST00000178641 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms