Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 AC155923.1-201ENSMUST00000215676 356 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Spocd1B1ASB6 Gm24929-201ENSMUST00000083403 139 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Spocd1B1ASB6 Snord14d-201ENSMUST00000083424 86 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Spocd1B1ASB6 Olfr873-205ENSMUST00000215540 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
Spocd1B1ASB6 Zfp280c-203ENSMUST00000088898 4024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
Spocd1B1ASB6 Vmn1r89-203ENSMUST00000227176 4189 ntAPPRIS P2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
Spocd1B1ASB6 Nlrp9a-202ENSMUST00000108387 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
Spocd1B1ASB6 Mga-202ENSMUST00000079934 13304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Spocd1B1ASB6 Gm3259-201ENSMUST00000101015 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
Spocd1B1ASB6 AC117226.1-201ENSMUST00000221635 3737 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Spocd1B1ASB6 Igkv2-109-201ENSMUST00000103322 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Spocd1B1ASB6 n-R5s219-201ENSMUST00000104328 132 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Spocd1B1ASB6 Snord90-201ENSMUST00000104568 111 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Spocd1B1ASB6 Gm12025-201ENSMUST00000117768 144 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Spocd1B1ASB6 Gm13443-201ENSMUST00000120770 555 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Spocd1B1ASB6 Uqcrh-ps2-201ENSMUST00000121613 269 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Spocd1B1ASB6 Gm29167-201ENSMUST00000190024 377 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Spocd1B1ASB6 Gm28155-201ENSMUST00000191066 151 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Spocd1B1ASB6 Gm8197-201ENSMUST00000192906 363 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Spocd1B1ASB6 AC164100.1-201ENSMUST00000227214 508 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Spocd1B1ASB6 Rps17-201ENSMUST00000080813 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
Spocd1B1ASB6 Gm22304-201ENSMUST00000082688 129 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Spocd1B1ASB6 Gm23303-201ENSMUST00000082714 152 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Spocd1B1ASB6 Gm24355-201ENSMUST00000082858 122 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Spocd1B1ASB6 Gm25684-201ENSMUST00000083941 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Spocd1B1ASB6 Gpr174-203ENSMUST00000118820 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
Spocd1B1ASB6 Olfr1448-204ENSMUST00000216888 4064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Spocd1B1ASB6 Vmn1r83-202ENSMUST00000226701 2788 ntAPPRIS P1 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 D930036K23Rik-201ENSMUST00000191894 3964 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Olfr901-203ENSMUST00000216644 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Gm22779-201ENSMUST00000104085 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Mir6383-201ENSMUST00000184545 116 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Gm43993-201ENSMUST00000203972 247 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 CT033781.2-201ENSMUST00000221113 153 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Gm24461-201ENSMUST00000082735 103 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Olfr1402-202ENSMUST00000199297 4051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Olfr397-204ENSMUST00000216291 4168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Tug1-201ENSMUST00000132077 6719 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Cfh-202ENSMUST00000111976 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Cfh-201ENSMUST00000066859 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Gm38031-201ENSMUST00000191819 3015 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Mir767-201ENSMUST00000103256 107 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Gm22023-201ENSMUST00000104354 130 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Gm13314-201ENSMUST00000118742 335 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Gm24627-201ENSMUST00000122764 138 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Gm25267-201ENSMUST00000158522 63 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Gm22108-201ENSMUST00000177961 106 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Gm24798-201ENSMUST00000179334 106 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Gm28000-201ENSMUST00000184380 85 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Gm37290-201ENSMUST00000195775 339 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Mir7657-201ENSMUST00000196051 57 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Gm43932-201ENSMUST00000204499 52 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 CT009696.2-201ENSMUST00000216668 432 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Defb19-201ENSMUST00000053180 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 n-R5s220-201ENSMUST00000082926 120 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Snora70-201ENSMUST00000083047 137 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Vmn2r67-201ENSMUST00000168730 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Lrrc19-201ENSMUST00000053419 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Gm44049-201ENSMUST00000204905 2984 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 AC104897.1-201ENSMUST00000222638 3628 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Olfr1434-201ENSMUST00000207186 2714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Olfr513-202ENSMUST00000214670 2029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Olfr713-202ENSMUST00000213623 6329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Dst-211ENSMUST00000183034 23201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 E430014B02Rik-201ENSMUST00000194215 3156 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 AC154481.2-201ENSMUST00000222526 3175 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Vmn1r219-204ENSMUST00000228113 5639 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Gm25022-201ENSMUST00000102205 83 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Gm15067-201ENSMUST00000119534 156 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Gm12723-201ENSMUST00000120700 451 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Gm24061-201ENSMUST00000157489 120 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Vmn2r-ps58-201ENSMUST00000173044 242 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Mir467a-6-201ENSMUST00000177790 83 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Mir467a-3-201ENSMUST00000178082 83 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Mir467a-7-201ENSMUST00000178635 83 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Mir467a-10-201ENSMUST00000179320 83 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Mir467a-5-201ENSMUST00000179352 83 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Mir467a-2-201ENSMUST00000179447 83 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Mir467a-9-201ENSMUST00000179752 83 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Mir467a-4-201ENSMUST00000179923 83 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Mir467a-8-201ENSMUST00000180070 83 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Mir3969-201ENSMUST00000197106 92 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Gm44600-201ENSMUST00000208540 111 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 AC160962.3-201ENSMUST00000225914 112 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Gm22421-201ENSMUST00000083058 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Vmn1r89-208ENSMUST00000228587 2061 ntAPPRIS P2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Cyp3a41a-201ENSMUST00000094111 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Vmn1r178-202ENSMUST00000226450 2880 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Zfp280c-204ENSMUST00000114940 3863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Olfr17-202ENSMUST00000210568 3666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Dst-201ENSMUST00000097785 23251 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Olfr729-203ENSMUST00000215327 4220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Olfr729-204ENSMUST00000215451 4236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Trgj3-201ENSMUST00000103562 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Gm14629-201ENSMUST00000122428 144 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Gm5358-201ENSMUST00000212814 353 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 AC154262.1-201ENSMUST00000225976 286 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 AC124746.2-201ENSMUST00000226594 427 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Gm10242-201ENSMUST00000090064 330 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Spocd1B1ASB6 Gm3055-202ENSMUST00000218939 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
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