Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm25130-201ENSMUST00000082650 156 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm25402-201ENSMUST00000082966 131 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm25632-201ENSMUST00000083112 85 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 n-R5s197-201ENSMUST00000083302 119 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm25628-201ENSMUST00000084002 105 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Gm10192-201ENSMUST00000086672 327 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Grik3B1AS29 Olfr659-202ENSMUST00000214986 4842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Vmn1r83-202ENSMUST00000226701 2788 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Igkv2-109-201ENSMUST00000103322 374 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Mir344e-201ENSMUST00000104677 66 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm15536-201ENSMUST00000121411 114 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm26186-201ENSMUST00000157689 125 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm23642-201ENSMUST00000157858 258 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm22447-201ENSMUST00000158155 92 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm24225-201ENSMUST00000158825 98 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm24799-201ENSMUST00000178431 79 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm43587-201ENSMUST00000199590 204 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Mir7217-201ENSMUST00000200304 62 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Mir7227-201ENSMUST00000200408 59 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Calml4-204ENSMUST00000214633 394 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 AC158597.1-201ENSMUST00000216234 150 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 AC155712.1-201ENSMUST00000219704 160 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Serf1-201ENSMUST00000022145 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm22685-201ENSMUST00000082848 106 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm24044-201ENSMUST00000083107 156 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm37061-201ENSMUST00000195066 3243 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Olfr1186-202ENSMUST00000215912 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Cd209e-201ENSMUST00000033888 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm45844-205ENSMUST00000210333 3861 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Olfr136-204ENSMUST00000214035 1925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm12304-201ENSMUST00000120312 385 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm15379-201ENSMUST00000121224 648 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm24937-201ENSMUST00000122597 134 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 n-R5s164-201ENSMUST00000122664 112 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm23232-201ENSMUST00000157300 105 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Ear-ps8-201ENSMUST00000161935 354 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm27761-201ENSMUST00000184091 131 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm27959-201ENSMUST00000185172 111 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm29604-201ENSMUST00000187176 163 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm29665-201ENSMUST00000191457 528 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Mir497-201ENSMUST00000200557 84 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm43600-201ENSMUST00000202134 223 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Olfr511-ps1-201ENSMUST00000207188 217 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm23625-201ENSMUST00000082457 100 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm23731-201ENSMUST00000083749 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Zfp280c-202ENSMUST00000076635 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Olfr561-202ENSMUST00000213432 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Olfr803-202ENSMUST00000204641 2385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Olfr1148-202ENSMUST00000215230 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm26154-201ENSMUST00000102339 96 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm12924-201ENSMUST00000121747 318 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm14770-201ENSMUST00000122197 312 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm25543-201ENSMUST00000122678 312 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm12162-202ENSMUST00000129432 127 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm23579-201ENSMUST00000158528 103 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm5269-201ENSMUST00000183590 138 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm28257-201ENSMUST00000185244 463 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm29155-202ENSMUST00000186289 216 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm36891-201ENSMUST00000191995 655 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm36946-201ENSMUST00000192706 435 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm44429-201ENSMUST00000203542 186 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm2511-201ENSMUST00000205521 457 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm46389-201ENSMUST00000223199 392 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 AC100209.2-201ENSMUST00000224461 451 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Mucl2-201ENSMUST00000037685 639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Mir30d-201ENSMUST00000083503 82 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm23040-201ENSMUST00000083869 163 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 AC123052.1-201ENSMUST00000220604 4616 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 F8-202ENSMUST00000114085 7295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Ifi203-205ENSMUST00000129829 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Olfr394-202ENSMUST00000214284 5562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Cylc1-201ENSMUST00000101282 1923 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Defb43-201ENSMUST00000100491 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm25094-201ENSMUST00000103992 131 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm11115-201ENSMUST00000113255 54 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm14602-201ENSMUST00000118625 340 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm27332-201ENSMUST00000184893 112 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm43250-201ENSMUST00000196536 273 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm43583-201ENSMUST00000199235 303 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm44024-201ENSMUST00000203008 476 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Olfr1315-ps1-202ENSMUST00000208654 945 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 AC155715.1-201ENSMUST00000213575 463 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 mt-Td-201ENSMUST00000082404 70 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm23679-201ENSMUST00000083161 119 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Zfp160-201ENSMUST00000088811 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm26500-201ENSMUST00000101867 106 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm6954-201ENSMUST00000117416 225 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm24892-201ENSMUST00000122747 104 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm24348-201ENSMUST00000158710 130 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm24813-201ENSMUST00000175310 84 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm24308-201ENSMUST00000177773 114 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Ska2l-ps-201ENSMUST00000186208 360 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm28951-201ENSMUST00000190742 313 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm37377-201ENSMUST00000191733 304 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm43914-201ENSMUST00000203592 594 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm44473-201ENSMUST00000204039 152 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm35077-201ENSMUST00000204999 275 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Gm24152-201ENSMUST00000082764 163 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 AC125374.3-201ENSMUST00000214983 2810 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Grik3B1AS29 Olfr1177-ps-202ENSMUST00000216713 2821 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
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