Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Mir5118-201ENSMUST00000175551 67 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm22263-201ENSMUST00000180060 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm38361-201ENSMUST00000193419 458 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm45402-201ENSMUST00000211796 223 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 AL935138.1-201ENSMUST00000215309 196 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 AC108945.1-201ENSMUST00000226477 94 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm24805-201ENSMUST00000082931 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gpr174-202ENSMUST00000117310 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Olfr948-202ENSMUST00000216132 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Olfr199-202ENSMUST00000214186 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm14797-201ENSMUST00000119378 1480 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Igkv13-85-201ENSMUST00000114212 347 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm22075-201ENSMUST00000158599 192 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm20438-201ENSMUST00000174441 329 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm25035-201ENSMUST00000175414 77 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 9230113P08Rik-202ENSMUST00000176153 414 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm21094-201ENSMUST00000177842 498 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm20837-201ENSMUST00000178446 498 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm21739-201ENSMUST00000178639 498 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm28891-201ENSMUST00000178751 498 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm25730-201ENSMUST00000178753 165 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm28490-201ENSMUST00000179076 498 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm21861-201ENSMUST00000179480 498 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm21256-201ENSMUST00000179672 498 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm20838-201ENSMUST00000179884 498 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm21679-201ENSMUST00000180373 498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Mir6388-201ENSMUST00000184417 75 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm29069-201ENSMUST00000185857 675 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm29155-202ENSMUST00000186289 216 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm33051-201ENSMUST00000192940 274 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Trbv7-201ENSMUST00000193339 402 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Obox4-ps25-201ENSMUST00000199090 210 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm46312-201ENSMUST00000220961 420 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Sval1-201ENSMUST00000031898 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm23100-201ENSMUST00000083455 141 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Gm25207-201ENSMUST00000093745 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Cldn8Q9Z260 Olfr1431-202ENSMUST00000213759 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Vmn2r69-201ENSMUST00000171213 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Mir873a-201ENSMUST00000104863 77 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm14709-201ENSMUST00000121225 304 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm22217-201ENSMUST00000157556 313 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm24726-201ENSMUST00000158232 121 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm25314-201ENSMUST00000178810 79 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm27248-201ENSMUST00000184004 166 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm27236-201ENSMUST00000184147 442 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm28434-201ENSMUST00000187738 500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm28848-201ENSMUST00000189984 168 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Olfr1315-ps1-202ENSMUST00000208654 945 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm45911-201ENSMUST00000211844 601 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm45754-201ENSMUST00000212380 279 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm7495-201ENSMUST00000215099 426 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 AC123709.1-201ENSMUST00000224848 345 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 AC133156.1-202ENSMUST00000227284 363 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Olfr805-204ENSMUST00000217219 3314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 AC124456.1-201ENSMUST00000217391 2597 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Olfr1151-202ENSMUST00000217376 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm24079-201ENSMUST00000104352 132 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm14674-201ENSMUST00000117816 342 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm12417-201ENSMUST00000119153 403 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm24851-201ENSMUST00000158028 103 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm25333-201ENSMUST00000158035 246 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm23016-201ENSMUST00000158431 62 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm23022-201ENSMUST00000158768 180 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm16306-201ENSMUST00000160568 176 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm24085-201ENSMUST00000175172 116 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm21754-201ENSMUST00000177550 479 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm26430-201ENSMUST00000178054 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Mir7679-201ENSMUST00000183379 63 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Mir6351-201ENSMUST00000183826 99 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm44384-201ENSMUST00000200208 114 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 AC116589.9-201ENSMUST00000221462 908 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 CT485608.2-201ENSMUST00000227210 291 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 mt-Atp6-201ENSMUST00000082408 681 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Vmn1r29-202ENSMUST00000226971 4714 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm26396-201ENSMUST00000104093 132 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm26474-201ENSMUST00000116762 122 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm23109-201ENSMUST00000116867 126 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm22193-201ENSMUST00000116868 76 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm6444-201ENSMUST00000119611 458 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm14972-201ENSMUST00000121780 364 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm15899-201ENSMUST00000128586 238 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm3848-201ENSMUST00000136693 299 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm22555-201ENSMUST00000157801 62 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm24005-201ENSMUST00000158459 296 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm16038-201ENSMUST00000159317 193 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Scgb2b2-202ENSMUST00000205821 357 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 AC167192.1-201ENSMUST00000225908 139 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Vmn1r230-201ENSMUST00000053974 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Hmgb1l-201ENSMUST00000082150 571 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm10778-201ENSMUST00000105315 1497 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm4767-201ENSMUST00000099439 1497 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm15526-201ENSMUST00000112504 204 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm11386-201ENSMUST00000117761 347 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm12351-201ENSMUST00000118727 292 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm23169-201ENSMUST00000157157 112 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm26181-201ENSMUST00000157687 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm26024-201ENSMUST00000158657 322 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm22136-201ENSMUST00000158751 268 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm24174-201ENSMUST00000158933 111 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Cldn8Q9Z260 Gm23090-201ENSMUST00000177331 78 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
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