Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Prl-203ENSMUST00000224228 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Cln8Q9QUK3 AC164297.3-201ENSMUST00000224238 94 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Cln8Q9QUK3 Gm22364-201ENSMUST00000083097 98 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Cln8Q9QUK3 Mir300-201ENSMUST00000083485 79 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Cln8Q9QUK3 Gm45557-201ENSMUST00000210004 1651 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Cln8Q9QUK3 Tlr8-201ENSMUST00000049023 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
Cln8Q9QUK3 Catsperb-201ENSMUST00000055156 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
Cln8Q9QUK3 Gm13672-201ENSMUST00000117554 459 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Cln8Q9QUK3 n-R5s159-201ENSMUST00000122681 120 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Cln8Q9QUK3 Gm29247-202ENSMUST00000148542 571 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Cln8Q9QUK3 Gm3027-201ENSMUST00000167579 451 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Cln8Q9QUK3 Gm24085-201ENSMUST00000175172 116 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Cln8Q9QUK3 4930555M17Rik-201ENSMUST00000176666 402 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
Cln8Q9QUK3 Gm21978-201ENSMUST00000179696 377 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Cln8Q9QUK3 Mir6376-201ENSMUST00000185149 131 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Cln8Q9QUK3 Gm44811-201ENSMUST00000209120 228 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Cln8Q9QUK3 Gm45754-201ENSMUST00000212380 279 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Cln8Q9QUK3 Gm45704-201ENSMUST00000212582 403 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Cln8Q9QUK3 AC188459.1-201ENSMUST00000216651 300 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Cln8Q9QUK3 AC130821.1-201ENSMUST00000221997 293 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Cln8Q9QUK3 AC121942.2-201ENSMUST00000223824 600 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Cln8Q9QUK3 AC027184.1-201ENSMUST00000226991 424 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Cln8Q9QUK3 Olfr822-201ENSMUST00000080460 942 ntAPPRIS P1 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Cln8Q9QUK3 Gm24043-201ENSMUST00000083108 116 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Cln8Q9QUK3 Olfr1109-203ENSMUST00000217066 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Cln8Q9QUK3 Gm38388-201ENSMUST00000195569 1430 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Cln8Q9QUK3 Vmn1r83-202ENSMUST00000226701 2788 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.14
Cln8Q9QUK3 Gm22750-201ENSMUST00000102076 103 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm42606-201ENSMUST00000114209 239 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm23381-201ENSMUST00000157676 94 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm24192-201ENSMUST00000157978 145 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm22535-201ENSMUST00000158174 119 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm25051-201ENSMUST00000158602 249 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm22800-201ENSMUST00000175627 94 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm21737-201ENSMUST00000178112 664 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm21518-201ENSMUST00000178115 567 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm20736-201ENSMUST00000178198 567 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm20843-201ENSMUST00000178505 567 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm21209-201ENSMUST00000178556 567 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm21258-201ENSMUST00000178673 567 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm20888-201ENSMUST00000178934 567 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm21650-201ENSMUST00000179073 567 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm20901-201ENSMUST00000180177 664 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm20937-201ENSMUST00000180329 567 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm27722-201ENSMUST00000183908 76 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm27544-201ENSMUST00000185069 155 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm28090-201ENSMUST00000189458 664 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm21647-201ENSMUST00000189755 664 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Ighv1-1-201ENSMUST00000194912 291 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm44337-201ENSMUST00000196553 114 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm42672-201ENSMUST00000197821 352 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm43021-201ENSMUST00000198692 337 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm43976-201ENSMUST00000203637 235 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm44687-201ENSMUST00000204975 235 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm32817-202ENSMUST00000210738 527 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Olfr1228-203ENSMUST00000216392 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm35101-201ENSMUST00000219218 243 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 AC164117.2-201ENSMUST00000222090 327 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm26265-201ENSMUST00000083277 135 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm25578-201ENSMUST00000083406 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm15088-201ENSMUST00000117973 1508 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm15098-201ENSMUST00000119036 1508 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Agmo-201ENSMUST00000049874 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Vmn1r185-210ENSMUST00000228367 6982 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Olfr1442-204ENSMUST00000208657 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm26500-201ENSMUST00000101867 106 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Igkv17-127-201ENSMUST00000103309 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Traj6-201ENSMUST00000103734 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm25909-201ENSMUST00000157619 121 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm24853-201ENSMUST00000158026 121 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm21858-202ENSMUST00000185713 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm21409-201ENSMUST00000186110 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 C230029F24Rik-202ENSMUST00000188673 554 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm28961-201ENSMUST00000190573 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Ighv2-8-201ENSMUST00000193935 262 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm44182-201ENSMUST00000204052 115 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 AC069074.1-201ENSMUST00000220048 381 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 AC133156.1-202ENSMUST00000227284 363 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm26314-201ENSMUST00000083891 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Vmn1r178-202ENSMUST00000226450 2880 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm24338-201ENSMUST00000104205 127 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm6444-201ENSMUST00000119611 458 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm14215-201ENSMUST00000120578 221 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm22080-201ENSMUST00000157591 106 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm25888-201ENSMUST00000157778 302 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm22803-201ENSMUST00000158049 283 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm24858-201ENSMUST00000158058 323 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm22435-201ENSMUST00000158552 128 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Ear-ps4-201ENSMUST00000166834 450 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Vmn2r-ps55-201ENSMUST00000173834 240 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm24573-201ENSMUST00000175499 112 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm37778-201ENSMUST00000191732 190 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Igkv13-55-1-201ENSMUST00000200400 308 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm2829-201ENSMUST00000213121 499 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm18617-201ENSMUST00000222311 259 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 n-R5s94-201ENSMUST00000082573 119 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm23242-201ENSMUST00000083055 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Gm26066-201ENSMUST00000083385 109 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Olfr805-204ENSMUST00000217219 3314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Cln8Q9QUK3 Olfr1039-203ENSMUST00000216566 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
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