Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm28992-201ENSMUST00000190534 139 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Igkv11-118-201ENSMUST00000199448 346 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm45116-201ENSMUST00000207392 275 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm45445-201ENSMUST00000209586 232 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 AC168880.2-201ENSMUST00000224488 201 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm22248-201ENSMUST00000082482 150 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Nkain2-202ENSMUST00000092603 273 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm2869-201ENSMUST00000124359 2621 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Olfr617-202ENSMUST00000215755 3000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r178-205ENSMUST00000227993 2518 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm38071-201ENSMUST00000195792 3378 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 AI504432-201ENSMUST00000070085 5569 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm43875-201ENSMUST00000203319 2475 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Olfr611-202ENSMUST00000216074 2301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Trbv15-201ENSMUST00000103273 370 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm22115-201ENSMUST00000103976 133 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm23923-201ENSMUST00000104108 133 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm24376-201ENSMUST00000104399 127 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm22497-201ENSMUST00000104499 131 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Tra2b-ps-201ENSMUST00000119906 168 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 n-R5s68-201ENSMUST00000122639 82 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm23391-201ENSMUST00000157579 104 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm23257-201ENSMUST00000158322 132 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm22075-201ENSMUST00000158599 192 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm26337-201ENSMUST00000178000 79 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps17-201ENSMUST00000178733 375 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm32250-201ENSMUST00000191885 322 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm43991-201ENSMUST00000203751 274 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 AC158631.1-201ENSMUST00000219202 138 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 AC154527.5-201ENSMUST00000224448 496 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm25204-201ENSMUST00000082843 106 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Fsip2-203ENSMUST00000143764 21116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Mga-202ENSMUST00000079934 13304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm43046-201ENSMUST00000198771 2451 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm43883-201ENSMUST00000204002 3750 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm11356-201ENSMUST00000118974 192 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm11704-201ENSMUST00000120031 214 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm13431-201ENSMUST00000122948 476 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm26482-201ENSMUST00000158015 62 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm23666-201ENSMUST00000158053 116 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm23922-201ENSMUST00000178792 79 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm26097-201ENSMUST00000179642 93 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm24657-201ENSMUST00000180085 79 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm22996-201ENSMUST00000180236 79 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm37693-201ENSMUST00000194562 234 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Igkv1-115-201ENSMUST00000198714 302 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 AC132465.3-201ENSMUST00000219326 195 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Ccr3-201ENSMUST00000039171 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm37494-202ENSMUST00000188038 16021 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Themis-201ENSMUST00000056097 5082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm21940-201ENSMUST00000204940 2278 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 A630033H20Rik-206ENSMUST00000180182 2997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Zfp600-204ENSMUST00000168483 4244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Olfr267-202ENSMUST00000216719 4050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Olfr1477-202ENSMUST00000217001 4000 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm22270-201ENSMUST00000104034 132 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm23532-201ENSMUST00000104569 112 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm12276-201ENSMUST00000121709 301 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm12858-201ENSMUST00000121913 208 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm26020-201ENSMUST00000122729 183 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Crem-231ENSMUST00000152108 654 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm24008-201ENSMUST00000157733 138 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Pnrc2-203ENSMUST00000180300 171 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm27582-201ENSMUST00000184084 126 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Scgb2b29-ps-201ENSMUST00000187539 331 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm37001-201ENSMUST00000193377 190 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 AC159188.1-201ENSMUST00000225198 526 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Defb9-201ENSMUST00000057076 310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Mir124a-3-201ENSMUST00000083520 68 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm44846-201ENSMUST00000207127 3243 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 AC153964.2-201ENSMUST00000217704 2474 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Olfr142-202ENSMUST00000213968 3630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm24126-201ENSMUST00000104111 106 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 n-R5s219-201ENSMUST00000104328 132 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm23667-201ENSMUST00000157466 120 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm22699-201ENSMUST00000175376 105 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm16404-201ENSMUST00000177739 468 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm14598-201ENSMUST00000180109 468 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm14625-201ENSMUST00000180231 468 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm6003-201ENSMUST00000187903 463 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm42470-201ENSMUST00000198086 251 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm24625-201ENSMUST00000082622 130 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Defb33-201ENSMUST00000098908 424 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Zfp273-201ENSMUST00000012725 2277 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Dst-211ENSMUST00000183034 23201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm44842-201ENSMUST00000209173 3372 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm22590-201ENSMUST00000104247 128 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm24482-201ENSMUST00000117005 93 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm13076-201ENSMUST00000118041 204 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Atp5k-ps2-201ENSMUST00000120437 210 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm38255-201ENSMUST00000194910 2996 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Mir1291-201ENSMUST00000199842 117 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm45288-201ENSMUST00000210236 151 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm25814-201ENSMUST00000082754 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm24148-201ENSMUST00000082762 80 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Snora34-201ENSMUST00000083402 138 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm10192-201ENSMUST00000086672 327 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Olfr1130-202ENSMUST00000216580 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Gm27047-201ENSMUST00000183072 1819 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r219-204ENSMUST00000228113 5639 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.8 ms