Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Gm28995-201ENSMUST00000186625 261 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Gm43587-201ENSMUST00000199590 204 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Gm44353-201ENSMUST00000200618 138 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Gm44024-201ENSMUST00000203008 476 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Gm44478-201ENSMUST00000204875 114 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Tnfrsf23-203ENSMUST00000208017 544 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Gm32817-202ENSMUST00000210738 527 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 AC158597.1-201ENSMUST00000216234 150 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Vmn1r29-203ENSMUST00000227761 4671 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Vmn1r29-205ENSMUST00000228909 4658 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Gm24460-201ENSMUST00000082731 106 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Mirlet7c-1-201ENSMUST00000083623 94 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Gm23040-201ENSMUST00000083869 163 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Gm13378-201ENSMUST00000117483 336 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Gm11606-201ENSMUST00000120706 617 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Gm23670-201ENSMUST00000157469 119 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Gm24212-201ENSMUST00000158258 132 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Gm22945-201ENSMUST00000158557 157 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Gm22192-201ENSMUST00000175128 85 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Gm23921-201ENSMUST00000175258 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Scgb3a2-203ENSMUST00000189750 578 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Gm28848-201ENSMUST00000189984 168 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Gm43512-201ENSMUST00000198495 176 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 AC164161.1-201ENSMUST00000214076 639 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 AC188459.1-201ENSMUST00000216651 300 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Olfr1108-ps1-201ENSMUST00000216930 121 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 AC173345.1-201ENSMUST00000222837 306 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 AC160962.2-201ENSMUST00000224761 632 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 AC151833.1-201ENSMUST00000227752 574 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Gm25632-201ENSMUST00000083112 85 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Gm23462-201ENSMUST00000083264 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Gm25793-201ENSMUST00000083287 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Acer3-202ENSMUST00000120520 3964 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Olfr623-202ENSMUST00000213840 3980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Gm1980-201ENSMUST00000123131 2306 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 A630081D01Rik-201ENSMUST00000195842 1833 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Cd209e-201ENSMUST00000033888 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Igkv8-16-201ENSMUST00000103392 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Gm25094-201ENSMUST00000103992 131 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Gm22486-201ENSMUST00000116815 137 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Rps15a-ps6-201ENSMUST00000117476 393 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Gm23589-201ENSMUST00000157660 105 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Gm24726-201ENSMUST00000158232 121 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Gm17065-201ENSMUST00000165245 239 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Rpl31-ps15-201ENSMUST00000181857 375 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Gm29512-201ENSMUST00000185544 315 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Gm28110-201ENSMUST00000185782 315 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Gm29057-201ENSMUST00000186468 315 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Gm29661-201ENSMUST00000186781 315 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Gm28737-201ENSMUST00000186808 315 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Gm29118-201ENSMUST00000186908 315 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Gm28433-201ENSMUST00000187085 315 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Gm28759-201ENSMUST00000187621 315 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Gm28831-201ENSMUST00000187739 315 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Gm28200-201ENSMUST00000187778 315 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Gm28752-201ENSMUST00000188340 315 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Gm29378-201ENSMUST00000188723 315 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Gm28569-201ENSMUST00000188748 315 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Gm28120-201ENSMUST00000188812 315 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Gm28369-201ENSMUST00000188993 315 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Gm29037-201ENSMUST00000189092 313 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Gm28909-201ENSMUST00000189406 315 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Gm28861-201ENSMUST00000189681 315 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Gm29180-201ENSMUST00000190003 315 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Gm29575-201ENSMUST00000190597 315 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 1700063A18Rik-201ENSMUST00000190901 356 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Gm29469-201ENSMUST00000191448 315 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Gm44794-201ENSMUST00000206550 411 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Serf1-201ENSMUST00000022145 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 AC124104.1-201ENSMUST00000226279 417 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 AC133156.1-202ENSMUST00000227284 363 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Hmgb1l-201ENSMUST00000082150 571 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Gm37063-201ENSMUST00000194678 3520 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Pak3-210ENSMUST00000172330 8135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Gm12580-201ENSMUST00000127456 1751 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Skint2-203ENSMUST00000106560 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 mt-Nd4-201ENSMUST00000082414 1378 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Ifi203-205ENSMUST00000129829 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Gm16355-201ENSMUST00000128606 231 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Mir7017-201ENSMUST00000184894 62 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Gm10421-202ENSMUST00000186114 132 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Gm29490-201ENSMUST00000190923 342 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Gm18991-201ENSMUST00000209225 746 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Defb40-201ENSMUST00000066258 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Gm24764-201ENSMUST00000083686 199 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Olfr339-202ENSMUST00000216645 4867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Rgs13-201ENSMUST00000052375 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Adgrg4-204ENSMUST00000153784 9329 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Snora36b-201ENSMUST00000104383 132 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Gm12304-201ENSMUST00000120312 385 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Gm22316-201ENSMUST00000158012 216 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Gm24177-201ENSMUST00000158927 131 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Vmn2r-ps65-201ENSMUST00000173309 220 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Gm3852-201ENSMUST00000182781 264 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Gm28710-201ENSMUST00000186866 489 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Gm15235-201ENSMUST00000200572 194 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Gm35077-201ENSMUST00000204999 275 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Gm45150-201ENSMUST00000206051 467 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Mir133a-1-201ENSMUST00000083465 68 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ddx20Q9JJY4 Gm23731-201ENSMUST00000083749 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.6 ms