Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Gm26573-201ENSMUST00000181199 3020 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 A930027P06Rik-201ENSMUST00000221298 2975 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Olfr606-203ENSMUST00000217250 2313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Olfr592-203ENSMUST00000218618 5978 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
RabggtaQ9JHK4 Tcrg-V4-201ENSMUST00000103554 426 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Gm15669-201ENSMUST00000147834 526 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Gm22215-201ENSMUST00000157558 96 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Gm27465-201ENSMUST00000184290 91 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Mir6371-201ENSMUST00000184470 111 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Gm37624-201ENSMUST00000193751 219 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Gm38382-201ENSMUST00000193790 2499 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Gm38064-201ENSMUST00000194032 444 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 AC093316.2-201ENSMUST00000220015 172 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 AC134596.2-201ENSMUST00000222158 171 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 n-R5s40-201ENSMUST00000082475 124 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Snord82-201ENSMUST00000082889 70 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Olfr1042-201ENSMUST00000099908 4119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Olfr165-202ENSMUST00000206110 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Olfr918-202ENSMUST00000215461 3783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Olfr857-203ENSMUST00000217450 2271 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Ighv1-54-201ENSMUST00000103525 377 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Gm25269-201ENSMUST00000122601 104 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Gm12801-201ENSMUST00000153228 263 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Gm25863-201ENSMUST00000158249 329 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Gm16289-201ENSMUST00000162079 183 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Gm43680-201ENSMUST00000199466 340 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Gm45687-201ENSMUST00000209454 155 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 AC121942.2-201ENSMUST00000223824 600 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 AC166830.2-201ENSMUST00000225821 196 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 AC115291.1-201ENSMUST00000226803 258 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Gm10025-201ENSMUST00000079568 372 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Olfr1211-203ENSMUST00000213412 4173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Olfr839-ps1-201ENSMUST00000212127 7759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Olfr881-202ENSMUST00000212489 4237 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Olfr862-202ENSMUST00000079660 2604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Olfr896-ps1-202ENSMUST00000215219 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Gm42684-201ENSMUST00000197663 3615 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Olfr609-202ENSMUST00000216075 3429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Snord19-201ENSMUST00000104609 76 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Gm26247-201ENSMUST00000116702 91 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Gm22961-201ENSMUST00000157964 106 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Gm23209-201ENSMUST00000158667 110 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Gm26200-201ENSMUST00000180273 79 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Igkv5-40-1-201ENSMUST00000196457 359 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Gm43521-201ENSMUST00000197838 255 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Gm43107-201ENSMUST00000198729 255 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Olfr483-202ENSMUST00000215159 2691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 P2ry10-202ENSMUST00000118666 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Tlr3-202ENSMUST00000167106 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Gm42448-201ENSMUST00000197122 2644 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Tex16-201ENSMUST00000038546 3972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Mir344c-201ENSMUST00000103919 92 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Gm22674-201ENSMUST00000104413 131 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Gm22316-201ENSMUST00000158012 216 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Gm24879-201ENSMUST00000158386 143 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Gm17117-201ENSMUST00000163665 299 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Krtap27-1-201ENSMUST00000165580 646 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Gm25615-201ENSMUST00000177836 94 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Gm27220-201ENSMUST00000183453 262 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Mrgprb1-203ENSMUST00000188918 435 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Gm43427-201ENSMUST00000198188 331 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Gm34648-201ENSMUST00000202460 338 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 AC069074.2-201ENSMUST00000217819 428 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 AC123860.1-201ENSMUST00000228033 481 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Gm26204-201ENSMUST00000082906 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Snord7-201ENSMUST00000083781 97 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Gm15697-201ENSMUST00000121946 2902 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Fnd3c2-201ENSMUST00000091282 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Olfr186-203ENSMUST00000216415 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Gm12443-201ENSMUST00000122308 323 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Tnfaip8-206ENSMUST00000145726 632 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Gm12068-201ENSMUST00000153153 376 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Gm22560-201ENSMUST00000157332 120 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Gm25425-201ENSMUST00000157611 96 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Gm25051-201ENSMUST00000158602 249 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Gm23571-201ENSMUST00000180073 127 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 A930014E01Rik-201ENSMUST00000194572 330 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 AC159188.1-201ENSMUST00000225198 526 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Gm26495-201ENSMUST00000083152 137 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Olfr789-202ENSMUST00000213992 4421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r83-202ENSMUST00000226701 2788 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Gm42482-201ENSMUST00000198904 1947 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Gm38083-201ENSMUST00000194758 3498 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Vmn2r66-201ENSMUST00000124773 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Olfr298-204ENSMUST00000217110 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Gm4746-201ENSMUST00000120395 2406 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Hsf3-202ENSMUST00000119035 2691 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Gm25538-201ENSMUST00000101943 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Gm25500-201ENSMUST00000104426 123 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Gm14803-201ENSMUST00000117163 361 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Gm23466-201ENSMUST00000157133 106 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Gm15562-201ENSMUST00000161397 426 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Olfr1366-201ENSMUST00000168629 1054 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Gm23268-201ENSMUST00000175494 78 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Trbv6-201ENSMUST00000193743 276 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 AC155839.1-201ENSMUST00000200105 147 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Gm34314-201ENSMUST00000203622 367 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Olfr454-ps1-201ENSMUST00000205206 348 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Olfr468-ps1-201ENSMUST00000207203 593 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RabggtaQ9JHK4 Olfr1366-204ENSMUST00000218154 1054 ntAPPRIS P2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
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