Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

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Length 937 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43529-201ENSMUST00000199178 412 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Mir7215-201ENSMUST00000200383 51 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44938-201ENSMUST00000208614 427 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44811-201ENSMUST00000209120 228 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm9318-201ENSMUST00000222444 438 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23629-201ENSMUST00000082465 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23924-201ENSMUST00000082474 108 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22246-201ENSMUST00000082478 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22749-201ENSMUST00000082490 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22747-201ENSMUST00000082495 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22063-201ENSMUST00000082560 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23057-201ENSMUST00000082801 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26328-201ENSMUST00000082821 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26331-201ENSMUST00000082824 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24205-201ENSMUST00000082953 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25405-201ENSMUST00000082973 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22628-201ENSMUST00000082988 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26324-201ENSMUST00000083073 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24535-201ENSMUST00000083140 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26496-201ENSMUST00000083150 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26127-201ENSMUST00000083193 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24456-201ENSMUST00000083198 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24458-201ENSMUST00000083204 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24018-201ENSMUST00000083232 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25794-201ENSMUST00000083286 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25790-201ENSMUST00000083293 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22295-201ENSMUST00000083311 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25127-201ENSMUST00000083336 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25583-201ENSMUST00000083413 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25577-201ENSMUST00000083414 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24414-201ENSMUST00000083434 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24861-201ENSMUST00000083459 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24803-201ENSMUST00000083693 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23103-201ENSMUST00000083725 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm23732-201ENSMUST00000083751 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22682-201ENSMUST00000083854 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25869-201ENSMUST00000083855 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24693-201ENSMUST00000083885 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26317-201ENSMUST00000083894 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22352-201ENSMUST00000083917 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24448-201ENSMUST00000083979 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22798-201ENSMUST00000083992 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26427-201ENSMUST00000093648 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22886-201ENSMUST00000093714 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22170-201ENSMUST00000097247 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr138-202ENSMUST00000172843 1769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
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Ccdc39Q9D5Y1 Snord98-201ENSMUST00000116819 65 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12550-201ENSMUST00000118478 329 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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Ccdc39Q9D5Y1 Mir1898-201ENSMUST00000122643 83 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccdc39Q9D5Y1 Mir9-3-201ENSMUST00000175497 90 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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Ccdc39Q9D5Y1 Defa-ps13-202ENSMUST00000212360 204 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
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Ccdc39Q9D5Y1 AC154472.1-201ENSMUST00000222663 236 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccdc39Q9D5Y1 Gm6109-201ENSMUST00000223297 348 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccdc39Q9D5Y1 Snord42a-201ENSMUST00000082606 65 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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Ccdc39Q9D5Y1 Skint5-202ENSMUST00000169631 4497 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm23310-201ENSMUST00000179105 79 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23307-201ENSMUST00000179167 105 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25461-201ENSMUST00000179293 79 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25286-201ENSMUST00000179790 105 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccdc39Q9D5Y1 Gm37313-201ENSMUST00000191673 290 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10192-201ENSMUST00000086672 327 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm14296-202ENSMUST00000108931 750 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14551-201ENSMUST00000120802 256 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25325-201ENSMUST00000122559 86 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15281-201ENSMUST00000125181 351 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccdc39Q9D5Y1 Gm16349-201ENSMUST00000149990 394 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23586-201ENSMUST00000157657 123 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27510-201ENSMUST00000158214 64 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25486-201ENSMUST00000158726 63 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23196-201ENSMUST00000158806 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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