Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm21737-201ENSMUST00000178112 664 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Zbed3Q9D0L1 Gm21815-201ENSMUST00000178213 664 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Zbed3Q9D0L1 Gm21729-201ENSMUST00000180058 664 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Zbed3Q9D0L1 Gm21853-201ENSMUST00000180071 664 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Zbed3Q9D0L1 Gm20901-201ENSMUST00000180177 664 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Zbed3Q9D0L1 Gm29073-201ENSMUST00000185563 664 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Zbed3Q9D0L1 Gm29406-201ENSMUST00000186400 235 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Zbed3Q9D0L1 Gm29495-201ENSMUST00000189319 664 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Zbed3Q9D0L1 Gm28151-201ENSMUST00000189404 951 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Zbed3Q9D0L1 Gm28090-201ENSMUST00000189458 664 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Zbed3Q9D0L1 Gm21647-201ENSMUST00000189755 664 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Zbed3Q9D0L1 Gm29165-201ENSMUST00000190655 664 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Zbed3Q9D0L1 Gm29211-201ENSMUST00000191470 664 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Zbed3Q9D0L1 Gm42570-201ENSMUST00000195937 292 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Zbed3Q9D0L1 Zc3h14-201ENSMUST00000021399 1430 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
Zbed3Q9D0L1 Gm25068-201ENSMUST00000103895 110 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Zbed3Q9D0L1 Gm26424-201ENSMUST00000122530 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Zbed3Q9D0L1 Gm12869-201ENSMUST00000156265 344 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Zbed3Q9D0L1 Gm22328-201ENSMUST00000158074 112 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Zbed3Q9D0L1 Gm22386-201ENSMUST00000158192 129 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Zbed3Q9D0L1 Gm20438-201ENSMUST00000174441 329 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Zbed3Q9D0L1 Gm26936-201ENSMUST00000182424 382 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
Zbed3Q9D0L1 Mir7683-201ENSMUST00000183842 61 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Zbed3Q9D0L1 Gm18546-201ENSMUST00000197245 676 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Zbed3Q9D0L1 Gm34408-201ENSMUST00000222104 655 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Zbed3Q9D0L1 Olfr1094-202ENSMUST00000217509 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Zbed3Q9D0L1 Olfr1496-202ENSMUST00000209137 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
Zbed3Q9D0L1 Gm25541-201ENSMUST00000116888 126 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Zbed3Q9D0L1 Rpl31-ps6-201ENSMUST00000119959 378 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Zbed3Q9D0L1 Gm22654-201ENSMUST00000157874 105 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Zbed3Q9D0L1 Gm16043-201ENSMUST00000160030 616 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
Zbed3Q9D0L1 Olfr772-201ENSMUST00000169800 1004 ntAPPRIS P1 BASIC1.73□□□□□ -2.13
Zbed3Q9D0L1 Gm27624-201ENSMUST00000185047 177 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Zbed3Q9D0L1 Gm29350-201ENSMUST00000189141 541 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Zbed3Q9D0L1 Gm28930-201ENSMUST00000189525 437 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
Zbed3Q9D0L1 Gm29167-201ENSMUST00000190024 377 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Zbed3Q9D0L1 Gm44337-201ENSMUST00000196553 114 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Zbed3Q9D0L1 Gm44655-201ENSMUST00000207768 423 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Zbed3Q9D0L1 Gm32817-202ENSMUST00000210738 527 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
Zbed3Q9D0L1 AC116465.1-201ENSMUST00000220324 235 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Zbed3Q9D0L1 Gm3333-201ENSMUST00000221637 452 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
Zbed3Q9D0L1 Sval3-201ENSMUST00000080742 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
Zbed3Q9D0L1 Gm24172-201ENSMUST00000104127 117 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Zbed3Q9D0L1 Gm10721-201ENSMUST00000143083 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Zbed3Q9D0L1 Gm23122-201ENSMUST00000157645 103 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Zbed3Q9D0L1 Gm25371-201ENSMUST00000158162 101 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Zbed3Q9D0L1 Mir3057-201ENSMUST00000175040 91 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Zbed3Q9D0L1 Gm25936-201ENSMUST00000179952 114 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Zbed3Q9D0L1 4930598A11Rik-201ENSMUST00000180742 628 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
Zbed3Q9D0L1 Gm27326-201ENSMUST00000183504 95 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Zbed3Q9D0L1 Mir6351-201ENSMUST00000183826 99 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Zbed3Q9D0L1 Gm46993-201ENSMUST00000220708 259 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Zbed3Q9D0L1 Gm16976-205ENSMUST00000227324 226 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Zbed3Q9D0L1 AC163646.2-201ENSMUST00000227962 141 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Zbed3Q9D0L1 Gm10718-201ENSMUST00000099046 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Zbed3Q9D0L1 Olfr1153-202ENSMUST00000217436 2144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Zbed3Q9D0L1 Traj26-201ENSMUST00000103715 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Gm23170-201ENSMUST00000157158 106 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Gm26149-201ENSMUST00000157432 108 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Gm24901-201ENSMUST00000158125 110 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Gm24315-201ENSMUST00000177835 127 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Cypt14-201ENSMUST00000179096 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Gm27013-201ENSMUST00000182441 1024 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Gm27265-201ENSMUST00000183559 77 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Mir6419-201ENSMUST00000184784 113 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Mir7665-201ENSMUST00000184907 63 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Gm25586-201ENSMUST00000082499 112 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Olfr1109-203ENSMUST00000217066 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Gm25992-201ENSMUST00000102437 109 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Gm23336-201ENSMUST00000117023 123 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Gm16242-201ENSMUST00000117741 334 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Gm12823-201ENSMUST00000134494 318 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Gm22221-201ENSMUST00000157362 103 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Gm24677-201ENSMUST00000158755 150 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Gm16577-201ENSMUST00000161579 471 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Gm22166-201ENSMUST00000178419 121 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Gm23288-201ENSMUST00000179213 121 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Mir6388-201ENSMUST00000184417 75 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Gm28434-201ENSMUST00000187738 500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Gm44336-201ENSMUST00000203696 468 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 AC126691.1-201ENSMUST00000226534 202 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Gm25859-201ENSMUST00000083710 91 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Mir653-201ENSMUST00000102402 85 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Gm12351-201ENSMUST00000118727 292 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Gm16225-201ENSMUST00000146152 276 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Gm26278-201ENSMUST00000157098 132 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Gm24229-201ENSMUST00000158830 118 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Gm23090-201ENSMUST00000177331 78 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Smr3a-202ENSMUST00000189633 467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Gm9156-201ENSMUST00000189660 463 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Gm37658-201ENSMUST00000192672 315 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 AC122367.2-201ENSMUST00000220987 534 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 1700019M22Rik-201ENSMUST00000073560 354 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Gm24406-201ENSMUST00000083026 128 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Gm25896-201ENSMUST00000083713 136 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Olfr730-202ENSMUST00000205837 4903 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Gm13231-201ENSMUST00000119218 2850 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Igkv4-63-201ENSMUST00000103351 286 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Gm12512-201ENSMUST00000119620 217 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r-ps59-201ENSMUST00000172698 199 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.5 ms