Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm28930-201ENSMUST00000189525 437 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm18546-201ENSMUST00000197245 676 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Scgb2b2-202ENSMUST00000205821 357 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Snhg1-208ENSMUST00000206029 408 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 AC160863.1-201ENSMUST00000218412 317 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 AC132918.1-201ENSMUST00000227877 925 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 AC124456.1-201ENSMUST00000217391 2597 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Olfr8-203ENSMUST00000214952 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm24172-201ENSMUST00000104127 117 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm11407-201ENSMUST00000120362 1058 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm13153-201ENSMUST00000120969 637 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Oosp2-202ENSMUST00000135994 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm23170-201ENSMUST00000157158 106 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm23122-201ENSMUST00000157645 103 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm22328-201ENSMUST00000158074 112 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm27510-201ENSMUST00000158214 64 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm24551-201ENSMUST00000158645 92 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Mir3057-201ENSMUST00000175040 91 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm21815-201ENSMUST00000178213 664 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm20874-201ENSMUST00000178356 663 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm22862-201ENSMUST00000178593 121 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm24638-201ENSMUST00000179807 132 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm28437-201ENSMUST00000190277 783 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm38280-201ENSMUST00000192610 158 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm44654-201ENSMUST00000208052 329 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 AC239878.2-201ENSMUST00000224048 464 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm2869-201ENSMUST00000124359 2621 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm14390-201ENSMUST00000117505 1695 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm25759-201ENSMUST00000103988 129 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm11606-201ENSMUST00000120706 617 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm29247-202ENSMUST00000148542 571 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm26278-201ENSMUST00000157098 132 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm17215-201ENSMUST00000170074 277 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Cypt14-201ENSMUST00000179096 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm5269-201ENSMUST00000183590 138 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Ighv2-8-201ENSMUST00000193935 262 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm43245-201ENSMUST00000197603 468 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm32817-202ENSMUST00000210738 527 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm45907-201ENSMUST00000213023 193 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm34408-201ENSMUST00000222104 655 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm16368-201ENSMUST00000222340 435 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm25586-201ENSMUST00000082499 112 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm23448-201ENSMUST00000083151 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Olfr1148-202ENSMUST00000215230 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 AC161250.2-201ENSMUST00000215114 3107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm25068-201ENSMUST00000103895 110 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm12823-201ENSMUST00000134494 318 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm22099-201ENSMUST00000157925 123 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm25831-201ENSMUST00000158924 163 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm22166-201ENSMUST00000178419 121 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm9830-201ENSMUST00000178509 357 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm23288-201ENSMUST00000179213 121 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm29352-201ENSMUST00000188054 544 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 AC116726.2-201ENSMUST00000217629 986 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Vmn1r75-204ENSMUST00000227611 4336 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm22654-201ENSMUST00000157874 105 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Ranbp2-ps4-201ENSMUST00000183481 385 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm27385-201ENSMUST00000184747 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm18296-201ENSMUST00000192475 783 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Mir1291-201ENSMUST00000199842 117 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 AC124772.1-201ENSMUST00000221325 151 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm24977-201ENSMUST00000083106 163 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Snora34-201ENSMUST00000083402 138 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Olfr821-203ENSMUST00000214177 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Olfr730-202ENSMUST00000205837 4903 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Zc3h14-201ENSMUST00000021399 1430 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm12309-201ENSMUST00000119889 182 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm26149-201ENSMUST00000157432 108 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm23120-201ENSMUST00000157654 287 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm24902-201ENSMUST00000158126 123 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm16577-201ENSMUST00000161579 471 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm21094-201ENSMUST00000177842 498 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm20837-201ENSMUST00000178446 498 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm21739-201ENSMUST00000178639 498 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm28891-201ENSMUST00000178751 498 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm28490-201ENSMUST00000179076 498 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm21861-201ENSMUST00000179480 498 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm21256-201ENSMUST00000179672 498 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm20838-201ENSMUST00000179884 498 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm23523-201ENSMUST00000180190 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm21679-201ENSMUST00000180373 498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm27493-201ENSMUST00000184128 78 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Mir6419-201ENSMUST00000184784 113 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Mir195b-201ENSMUST00000184814 97 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Mir3569-201ENSMUST00000185080 58 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm43140-201ENSMUST00000197317 456 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm42857-201ENSMUST00000200823 339 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm44282-201ENSMUST00000203199 190 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm45207-201ENSMUST00000207469 145 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm44830-201ENSMUST00000207667 584 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Sult3a1-202ENSMUST00000218204 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Defb10-201ENSMUST00000054162 298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm26457-201ENSMUST00000082678 78 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm22750-201ENSMUST00000102076 103 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm12417-201ENSMUST00000119153 403 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm26049-201ENSMUST00000157313 108 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm22559-201ENSMUST00000157329 134 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm24191-201ENSMUST00000157977 122 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm24076-201ENSMUST00000158179 94 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Ccdc47Q9D024 Gm24229-201ENSMUST00000158830 118 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.1 ms