Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Snora34-201ENSMUST00000083402 138 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Mir181a-2-201ENSMUST00000083489 76 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Mir423-201ENSMUST00000083584 109 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Olfr1454-202ENSMUST00000213806 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Ifi214-203ENSMUST00000139092 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Olfr394-203ENSMUST00000216608 5628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Traj56-201ENSMUST00000103689 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Gm12926-201ENSMUST00000121158 409 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Gm24598-201ENSMUST00000122510 74 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Gm25321-201ENSMUST00000122558 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Tnfaip8-206ENSMUST00000145726 632 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Gm25115-201ENSMUST00000157187 140 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Gm22216-201ENSMUST00000157557 114 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Gm25450-201ENSMUST00000179144 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Gm29406-201ENSMUST00000186400 235 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Gm24350-202ENSMUST00000198309 132 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Gm44482-201ENSMUST00000199232 103 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Gm43264-201ENSMUST00000202284 325 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Gm44473-201ENSMUST00000204039 152 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Olfr1064-ps1-201ENSMUST00000213670 600 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Sgo1Q9CXH7 Olfr800-202ENSMUST00000217094 3831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Olfr65-203ENSMUST00000214300 2855 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm22782-201ENSMUST00000104082 132 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm25500-201ENSMUST00000104426 123 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm15526-201ENSMUST00000112504 204 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm13992-201ENSMUST00000120558 156 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm13581-201ENSMUST00000120675 278 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm23232-201ENSMUST00000157300 105 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm24879-201ENSMUST00000158386 143 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Vmn1r-ps59-201ENSMUST00000172698 199 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm23355-201ENSMUST00000177614 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm23148-201ENSMUST00000180367 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Mir7242-201ENSMUST00000183710 79 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm19901-201ENSMUST00000192191 495 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm36946-201ENSMUST00000192706 435 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm43406-201ENSMUST00000200356 334 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 AC163289.1-201ENSMUST00000215919 262 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm7214-201ENSMUST00000222428 272 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 CT025538.3-201ENSMUST00000225279 3848 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm25258-201ENSMUST00000083049 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm25793-201ENSMUST00000083287 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Mir29c-201ENSMUST00000083614 88 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm22866-201ENSMUST00000083947 177 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Zfy2-201ENSMUST00000115891 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Olfr1309-205ENSMUST00000216948 5168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Olfr868-201ENSMUST00000212767 4196 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm44578-201ENSMUST00000207236 3835 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm22193-201ENSMUST00000116868 76 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm12924-201ENSMUST00000121747 318 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 4930527E20Rik-201ENSMUST00000135700 351 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm22814-201ENSMUST00000157452 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm23474-201ENSMUST00000158884 75 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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Sgo1Q9CXH7 Gm27878-201ENSMUST00000184000 106 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm27905-201ENSMUST00000184005 207 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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Sgo1Q9CXH7 Mrgprb1-203ENSMUST00000188918 435 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm28160-201ENSMUST00000191229 315 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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Sgo1Q9CXH7 Gm44794-201ENSMUST00000206550 411 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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Sgo1Q9CXH7 AC171206.2-201ENSMUST00000215252 389 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm23406-201ENSMUST00000082537 122 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Mir193a-201ENSMUST00000083461 66 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Vmn1r76-202ENSMUST00000226300 8189 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Adgrg4-205ENSMUST00000154818 8857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm44644-202ENSMUST00000208825 3133 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Olfr394-202ENSMUST00000214284 5562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Olfr623-202ENSMUST00000213840 3980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm45518-201ENSMUST00000210776 2583 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm12956-201ENSMUST00000122184 414 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 n-R5s191-201ENSMUST00000122724 116 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm23668-201ENSMUST00000157465 111 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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Sgo1Q9CXH7 Gm24837-201ENSMUST00000158683 81 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm23268-201ENSMUST00000175494 78 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 AC150314.1-201ENSMUST00000214798 238 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm30534-201ENSMUST00000217928 207 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 AC127578.1-201ENSMUST00000227289 93 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 2210407C18Rik-201ENSMUST00000048801 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm25078-201ENSMUST00000082530 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm24764-201ENSMUST00000083686 199 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Olfr1148-202ENSMUST00000215230 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm42536-201ENSMUST00000197562 1613 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm23175-201ENSMUST00000104371 132 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm11572-201ENSMUST00000119164 120 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm12837-201ENSMUST00000120131 373 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm13913-201ENSMUST00000121126 260 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm22141-201ENSMUST00000157403 277 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm17067-202ENSMUST00000180131 123 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm29665-201ENSMUST00000191457 528 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm38127-201ENSMUST00000191978 468 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Gm42672-201ENSMUST00000197821 352 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Sgo1Q9CXH7 Mir7227-201ENSMUST00000200408 59 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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