Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm44011-201ENSMUST00000203336 394 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm2628-201ENSMUST00000218019 426 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Rprd1bQ9CSU0 AC167192.4-201ENSMUST00000224087 993 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Rprd1bQ9CSU0 Zfp934-201ENSMUST00000082203 993 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm24707-201ENSMUST00000082812 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm24921-201ENSMUST00000083024 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Rprd1bQ9CSU0 Olfr307-203ENSMUST00000217494 4515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
Rprd1bQ9CSU0 AC124426.1-203ENSMUST00000221814 1362 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Rprd1bQ9CSU0 Vma21-ps-201ENSMUST00000114578 306 ntAPPRIS P1 BASIC1□□□□□ -2.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm22193-201ENSMUST00000116868 76 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm15443-201ENSMUST00000118947 820 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm23981-201ENSMUST00000157136 106 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm18396-201ENSMUST00000177095 361 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm24390-201ENSMUST00000179578 62 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm28344-201ENSMUST00000185704 279 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm29661-201ENSMUST00000186781 315 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm29308-201ENSMUST00000188863 315 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm42891-201ENSMUST00000199340 281 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm45456-201ENSMUST00000210841 243 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Rprd1bQ9CSU0 4930543K20Rik-201ENSMUST00000217044 355 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Rprd1bQ9CSU0 AC130829.3-201ENSMUST00000222735 154 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm39473-201ENSMUST00000223498 522 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
Rprd1bQ9CSU0 AC168056.1-201ENSMUST00000225270 180 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Rprd1bQ9CSU0 Snora41-201ENSMUST00000082668 132 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm25683-201ENSMUST00000083940 131 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm37061-201ENSMUST00000195066 3243 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm24282-201ENSMUST00000104232 66 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm24910-201ENSMUST00000157289 272 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm25384-201ENSMUST00000157807 105 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm23083-201ENSMUST00000157851 116 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm25557-201ENSMUST00000158084 315 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm22929-201ENSMUST00000175517 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm44870-201ENSMUST00000207291 357 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1109-202ENSMUST00000214636 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm21814-203ENSMUST00000203729 1352 ntTSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm24588-201ENSMUST00000116696 83 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm12670-201ENSMUST00000123606 576 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
Rprd1bQ9CSU0 AC163357.1-201ENSMUST00000220847 233 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm11891-201ENSMUST00000121241 619 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm22551-201ENSMUST00000157795 103 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm20689-201ENSMUST00000176033 279 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Rprd1bQ9CSU0 9230113P08Rik-202ENSMUST00000176153 414 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
Rprd1bQ9CSU0 Mir6381-201ENSMUST00000183426 87 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Rprd1bQ9CSU0 AC156560.1-201ENSMUST00000221425 256 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Rprd1bQ9CSU0 AC159885.1-201ENSMUST00000222221 199 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm23299-201ENSMUST00000082708 79 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm25357-201ENSMUST00000082745 72 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm25582-201ENSMUST00000083412 110 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Rprd1bQ9CSU0 Mir16-2-201ENSMUST00000083672 95 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm25651-201ENSMUST00000083782 119 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1466-202ENSMUST00000207124 1981 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
Rprd1bQ9CSU0 AC164629.4-201ENSMUST00000218505 3247 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Rprd1bQ9CSU0 Gm23011-201ENSMUST00000104148 132 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Rprd1bQ9CSU0 Gm12779-201ENSMUST00000121496 143 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Rprd1bQ9CSU0 Gm23277-201ENSMUST00000157914 136 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Rprd1bQ9CSU0 Mir3098-201ENSMUST00000175416 87 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Rprd1bQ9CSU0 Gm27419-201ENSMUST00000184576 109 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Rprd1bQ9CSU0 1700031L13Rik-204ENSMUST00000188072 812 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
Rprd1bQ9CSU0 Gm37291-201ENSMUST00000195637 533 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
Rprd1bQ9CSU0 AC139186.1-201ENSMUST00000197610 94 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Rprd1bQ9CSU0 Gm35736-201ENSMUST00000203681 313 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Rprd1bQ9CSU0 Olfr991-ps1-201ENSMUST00000215967 908 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Rprd1bQ9CSU0 AC164629.1-201ENSMUST00000220250 1113 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Rprd1bQ9CSU0 AC173482.4-201ENSMUST00000225096 348 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Rprd1bQ9CSU0 Gm25938-201ENSMUST00000104139 166 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Rprd1bQ9CSU0 Gm14775-201ENSMUST00000122089 310 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Rprd1bQ9CSU0 n-R5s157-201ENSMUST00000122543 121 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Rprd1bQ9CSU0 Gm23000-201ENSMUST00000157083 139 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Rprd1bQ9CSU0 Gm27898-201ENSMUST00000183987 80 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Rprd1bQ9CSU0 Mir7118-201ENSMUST00000197760 61 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Rprd1bQ9CSU0 AC152414.2-201ENSMUST00000219620 537 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
Rprd1bQ9CSU0 Gm46997-201ENSMUST00000222108 217 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Rprd1bQ9CSU0 AC167669.4-201ENSMUST00000225967 140 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Rprd1bQ9CSU0 Sval1-201ENSMUST00000031898 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
Rprd1bQ9CSU0 Clec4a4-201ENSMUST00000079379 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
Rprd1bQ9CSU0 Gm24889-201ENSMUST00000104388 132 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Rprd1bQ9CSU0 Gm26029-201ENSMUST00000158659 132 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Rprd1bQ9CSU0 Gm25491-201ENSMUST00000158733 308 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Rprd1bQ9CSU0 Gm24221-201ENSMUST00000158833 313 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Rprd1bQ9CSU0 Gm24020-201ENSMUST00000180156 108 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Rprd1bQ9CSU0 Gm37693-201ENSMUST00000194562 234 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Rprd1bQ9CSU0 Gm36992-201ENSMUST00000195463 428 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
Rprd1bQ9CSU0 Igkv15-102-201ENSMUST00000197885 287 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1482-ps1-201ENSMUST00000207181 178 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Rprd1bQ9CSU0 1700019M22Rik-201ENSMUST00000073560 354 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Rprd1bQ9CSU0 Mir219a-2-201ENSMUST00000083551 97 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Rprd1bQ9CSU0 Olfr199-202ENSMUST00000214186 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
Rprd1bQ9CSU0 Gm22780-201ENSMUST00000104084 132 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Rprd1bQ9CSU0 n-R5s67-201ENSMUST00000104336 114 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Rprd1bQ9CSU0 Gm13396-201ENSMUST00000120617 271 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Rprd1bQ9CSU0 Gm22233-201ENSMUST00000157464 114 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Rprd1bQ9CSU0 Gm25868-201ENSMUST00000158253 114 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Rprd1bQ9CSU0 Gm26173-201ENSMUST00000158416 136 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Rprd1bQ9CSU0 Gm23777-201ENSMUST00000158994 259 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Rprd1bQ9CSU0 Mir3061-201ENSMUST00000175129 91 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r-ps47-201ENSMUST00000176694 907 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r-ps18-201ENSMUST00000177972 380 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r-ps17-201ENSMUST00000178733 375 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Rprd1bQ9CSU0 Gm28794-201ENSMUST00000185276 136 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Rprd1bQ9CSU0 Gm37089-201ENSMUST00000195616 129 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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