Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Gm43007-201ENSMUST00000197618 291 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TrabdQ99JY4 4930511M18Rik-201ENSMUST00000197811 679 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
TrabdQ99JY4 Obox4-ps25-201ENSMUST00000199090 210 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TrabdQ99JY4 Gm43978-201ENSMUST00000203491 451 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TrabdQ99JY4 Gm44149-201ENSMUST00000204256 226 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TrabdQ99JY4 Gm45386-201ENSMUST00000210194 218 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TrabdQ99JY4 Gm8940-201ENSMUST00000212585 219 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TrabdQ99JY4 AC164117.2-201ENSMUST00000222090 327 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TrabdQ99JY4 Gm6109-201ENSMUST00000223297 348 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TrabdQ99JY4 AC117202.2-201ENSMUST00000226491 1101 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TrabdQ99JY4 Gm26056-201ENSMUST00000083043 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TrabdQ99JY4 Olfr229-202ENSMUST00000214904 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
TrabdQ99JY4 AC117226.1-201ENSMUST00000221635 3737 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
TrabdQ99JY4 Gm37941-201ENSMUST00000192170 2309 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TrabdQ99JY4 Gm26080-201ENSMUST00000104069 131 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TrabdQ99JY4 Gm13661-201ENSMUST00000154297 318 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TrabdQ99JY4 Gm22386-201ENSMUST00000158192 129 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TrabdQ99JY4 Ighv1-78-201ENSMUST00000163670 294 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TrabdQ99JY4 Gm25958-201ENSMUST00000175114 71 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TrabdQ99JY4 Gm27588-201ENSMUST00000185096 263 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TrabdQ99JY4 Gm44446-201ENSMUST00000204864 255 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TrabdQ99JY4 Gm44794-201ENSMUST00000206550 411 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TrabdQ99JY4 Gm35309-201ENSMUST00000208337 478 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TrabdQ99JY4 AC126672.1-201ENSMUST00000217096 396 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TrabdQ99JY4 Olfr1153-202ENSMUST00000217436 2144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
TrabdQ99JY4 AC164567.2-201ENSMUST00000219363 445 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TrabdQ99JY4 AC126554.1-201ENSMUST00000222161 271 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TrabdQ99JY4 Gm9318-201ENSMUST00000222444 438 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
TrabdQ99JY4 Olfr1218-204ENSMUST00000215054 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 Olfr138-203ENSMUST00000173841 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 Zfp960-201ENSMUST00000127027 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 Gm13378-201ENSMUST00000117483 336 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 Atp5k-ps2-201ENSMUST00000120437 210 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 Gm23169-201ENSMUST00000157157 112 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 Gm25970-201ENSMUST00000157165 86 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 Gm25888-201ENSMUST00000157778 302 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 Gm24499-201ENSMUST00000158446 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 Gm7925-201ENSMUST00000166690 401 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 4930518C09Rik-201ENSMUST00000172700 478 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 Gm25996-201ENSMUST00000175393 117 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 Esp4-201ENSMUST00000178498 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 Gm26864-201ENSMUST00000181346 156 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 Gm39473-201ENSMUST00000223498 522 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 CT009713.9-201ENSMUST00000223604 389 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 Gm26457-201ENSMUST00000082678 78 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 Olfr1018-202ENSMUST00000214416 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 Olfr165-202ENSMUST00000206110 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 Dnal1-203ENSMUST00000136159 403 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 Gm25961-201ENSMUST00000157174 135 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 Gm23829-201ENSMUST00000157392 270 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 Gm21518-201ENSMUST00000178115 567 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 Gm20736-201ENSMUST00000178198 567 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 Gm20843-201ENSMUST00000178505 567 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 Gm9830-201ENSMUST00000178509 357 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 Gm21209-201ENSMUST00000178556 567 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 Gm21258-201ENSMUST00000178673 567 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 Gm20888-201ENSMUST00000178934 567 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 Gm21650-201ENSMUST00000179073 567 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 Gm20937-201ENSMUST00000180329 567 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 Mir7241-201ENSMUST00000184532 64 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 Gm10105-201ENSMUST00000184601 270 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 Gm37923-201ENSMUST00000191624 161 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 Gm32250-201ENSMUST00000191885 322 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 Gm37128-201ENSMUST00000192599 232 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 Mirlet7f-1-201ENSMUST00000198652 89 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 Gm8013-201ENSMUST00000200139 462 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 4930431P19Rik-201ENSMUST00000207570 451 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 Gm45403-201ENSMUST00000209453 276 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 AC124772.1-201ENSMUST00000221325 151 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 Vmn2r-ps102-203ENSMUST00000222739 604 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 Gm25578-201ENSMUST00000083406 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 Gm23040-201ENSMUST00000083869 163 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 Olfr1340-201ENSMUST00000094834 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 Olfr730-202ENSMUST00000205837 4903 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 Skint2-203ENSMUST00000106560 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 Gm14296-202ENSMUST00000108931 750 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 Gm15115-201ENSMUST00000121145 264 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 Olfr719-ps-201ENSMUST00000137795 252 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 Gm24481-201ENSMUST00000157210 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 Gm22080-201ENSMUST00000157591 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 Gm24846-201ENSMUST00000158033 108 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 Gm22382-201ENSMUST00000158185 130 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 Gm25486-201ENSMUST00000158726 63 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 Gm25162-201ENSMUST00000158906 159 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 Gm16004-201ENSMUST00000161981 311 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 2210418O10Rik-204ENSMUST00000166464 750 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 4930555M17Rik-201ENSMUST00000176666 402 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 Gm23191-201ENSMUST00000179147 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 Gm18356-201ENSMUST00000185677 623 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 Gm28825-201ENSMUST00000186233 238 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 Trav5d-2-201ENSMUST00000196107 275 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 Trav5n-2-201ENSMUST00000197136 275 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 Gm26379-202ENSMUST00000200225 132 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 Gm44459-201ENSMUST00000203926 160 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 AC154747.1-201ENSMUST00000225265 239 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 Gm22364-201ENSMUST00000083097 98 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 BC100530-201ENSMUST00000096089 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 Gm21897-201ENSMUST00000178312 1500 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TrabdQ99JY4 Igkv6-13-201ENSMUST00000103395 287 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
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