Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm5396-201ENSMUST00000121222 532 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Apobec3Q99J72 Gm22145-201ENSMUST00000157396 148 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Apobec3Q99J72 Gm24291-201ENSMUST00000157633 162 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Apobec3Q99J72 Gm25454-201ENSMUST00000157947 315 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Apobec3Q99J72 Gm24056-201ENSMUST00000158617 146 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Apobec3Q99J72 Gm26200-201ENSMUST00000180273 79 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Apobec3Q99J72 Mir6917-201ENSMUST00000184111 61 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Apobec3Q99J72 Gm27421-201ENSMUST00000184729 167 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Apobec3Q99J72 Gm19123-201ENSMUST00000190716 651 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Apobec3Q99J72 Gm6842-201ENSMUST00000211361 390 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Apobec3Q99J72 CAAA01090905.1-201ENSMUST00000219056 426 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Apobec3Q99J72 Gm19563-201ENSMUST00000222031 270 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Apobec3Q99J72 Gm31025-201ENSMUST00000222553 482 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Apobec3Q99J72 AC159188.1-201ENSMUST00000225198 526 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Apobec3Q99J72 Defb21-201ENSMUST00000070722 427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Apobec3Q99J72 Gm10025-201ENSMUST00000079568 372 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Apobec3Q99J72 Gm43889-201ENSMUST00000203950 3681 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Apobec3Q99J72 Fam111a-203ENSMUST00000144662 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Apobec3Q99J72 C630028M04Rik-201ENSMUST00000141452 3387 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Apobec3Q99J72 Vmn1r83-202ENSMUST00000226701 2788 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Olfr1168-202ENSMUST00000215996 2322 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Olfr124-204ENSMUST00000217365 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Gm24670-201ENSMUST00000104154 132 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Mir1b-201ENSMUST00000117012 122 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Gm11460-201ENSMUST00000118200 361 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Gm12797-201ENSMUST00000118645 273 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Gm23982-201ENSMUST00000157141 106 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Gm22321-201ENSMUST00000157152 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Gm25373-201ENSMUST00000158156 115 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Gm26215-201ENSMUST00000158584 139 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Gm17117-201ENSMUST00000163665 299 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Gm22450-201ENSMUST00000179641 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Gm25024-201ENSMUST00000179667 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Gm25473-201ENSMUST00000180191 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Gm27699-201ENSMUST00000183553 180 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Mir7050-201ENSMUST00000184636 60 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Gm38311-201ENSMUST00000192945 165 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Gm44399-201ENSMUST00000205043 226 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Gm44533-201ENSMUST00000207782 268 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Gm20734-201ENSMUST00000216939 193 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 CT025619.4-201ENSMUST00000217362 350 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 mt-Atp8-201ENSMUST00000082407 204 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Gm24856-201ENSMUST00000082809 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Gm24356-201ENSMUST00000082859 106 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Gm26071-201ENSMUST00000083261 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Mir181b-2-201ENSMUST00000083644 89 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Gm24521-201ENSMUST00000083958 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Olfr623-202ENSMUST00000213840 3980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Olfr1454-202ENSMUST00000213806 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Vmn1r80-205ENSMUST00000227755 10455 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Dpp10-201ENSMUST00000112603 4477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Olfr679-204ENSMUST00000215704 5018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Olfr1463-202ENSMUST00000207246 2315 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Igkv17-121-201ENSMUST00000103315 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Gm24867-201ENSMUST00000104161 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Gm14838-201ENSMUST00000118913 248 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Gm15162-201ENSMUST00000119325 283 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Tnfaip8-206ENSMUST00000145726 632 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Gm24716-201ENSMUST00000157524 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Gm24958-201ENSMUST00000158009 97 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Gm24392-201ENSMUST00000158136 103 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Gm24667-201ENSMUST00000158938 103 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Vmn2r-ps58-201ENSMUST00000173044 242 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Mir6916-201ENSMUST00000184514 63 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Gm37428-201ENSMUST00000193886 137 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 D730003K21Rik-201ENSMUST00000215052 589 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 4930520P13Rik-201ENSMUST00000222622 505 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 CT009504.1-201ENSMUST00000218252 3330 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Zfp934-202ENSMUST00000101547 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Olfr1437-202ENSMUST00000207241 3751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Gm43256-201ENSMUST00000199995 3091 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Cyp3a41a-201ENSMUST00000094111 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Vmn1r82-203ENSMUST00000227672 3651 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Gm14803-201ENSMUST00000117163 361 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Gm25654-201ENSMUST00000158467 88 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Gm2962-201ENSMUST00000159266 336 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Gm23268-201ENSMUST00000175494 78 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Mir6540-201ENSMUST00000184886 108 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 AC140254.1-201ENSMUST00000220063 331 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Gm7065-201ENSMUST00000222150 474 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Gm10139-201ENSMUST00000081471 171 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Olfr136-205ENSMUST00000216963 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Gm45039-201ENSMUST00000209181 3477 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Igkv17-127-201ENSMUST00000103309 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Gm25390-201ENSMUST00000157341 103 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Gm25720-201ENSMUST00000157503 105 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Gm22215-201ENSMUST00000157558 96 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Gm26411-201ENSMUST00000157668 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Gm23219-201ENSMUST00000158123 87 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Gm22537-201ENSMUST00000158172 199 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Mir3965-201ENSMUST00000175570 69 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Mir465d-201ENSMUST00000196314 58 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Gm42739-201ENSMUST00000200687 226 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Gm43264-201ENSMUST00000202284 325 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 AC125350.4-201ENSMUST00000225895 273 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 n-R5s40-201ENSMUST00000082475 124 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Gm23723-201ENSMUST00000082996 132 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Gm22154-201ENSMUST00000083844 131 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Olfr1240-202ENSMUST00000216123 4603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Apobec3Q99J72 Olfr1354-202ENSMUST00000204587 3781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.7 ms