Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

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Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Mir344e-201ENSMUST00000104677 66 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm12785-201ENSMUST00000122052 172 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm12956-201ENSMUST00000122184 414 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Snord11-201ENSMUST00000158468 84 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm22945-201ENSMUST00000158557 157 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm23921-201ENSMUST00000175258 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Mir6399-201ENSMUST00000184050 84 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm45522-201ENSMUST00000210784 166 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 AC117198.1-201ENSMUST00000217080 651 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 AC173345.1-201ENSMUST00000222837 306 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm25130-201ENSMUST00000082650 156 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm10720-201ENSMUST00000099050 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Vmn2r72-201ENSMUST00000063425 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Olfr857-203ENSMUST00000217450 2271 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Vma21-ps-201ENSMUST00000114578 306 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm15365-201ENSMUST00000122392 300 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm23381-201ENSMUST00000157676 94 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm22517-201ENSMUST00000158265 136 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm23005-201ENSMUST00000158950 136 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm16584-201ENSMUST00000159267 189 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm10772-201ENSMUST00000167981 255 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm24799-201ENSMUST00000178431 79 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm42439-201ENSMUST00000195931 486 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm44419-201ENSMUST00000203338 229 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm44858-201ENSMUST00000207360 154 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Olfr1315-ps1-202ENSMUST00000208654 945 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 AC159632.1-201ENSMUST00000221808 317 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 AC100209.2-201ENSMUST00000224461 451 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm23731-201ENSMUST00000083749 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm23345-201ENSMUST00000083817 150 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm45178-201ENSMUST00000207744 4110 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Olfr1109-202ENSMUST00000214636 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Mir872-201ENSMUST00000104728 81 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm22678-201ENSMUST00000116974 101 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm13885-201ENSMUST00000117569 187 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm11935-201ENSMUST00000118608 399 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm15536-201ENSMUST00000121411 114 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm24937-201ENSMUST00000122597 134 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm25543-201ENSMUST00000122678 312 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm23223-201ENSMUST00000158119 127 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm23262-201ENSMUST00000158323 168 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm24348-201ENSMUST00000158710 130 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm25488-201ENSMUST00000158728 118 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm22800-201ENSMUST00000175627 94 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Scgb3a2-203ENSMUST00000189750 578 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm28744-201ENSMUST00000189939 340 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 AC132384.11-201ENSMUST00000219676 178 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm45941-202ENSMUST00000223144 389 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 AC167669.4-201ENSMUST00000225967 140 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Mir133a-1-201ENSMUST00000083465 68 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Nkain2-202ENSMUST00000092603 273 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Gm26329-201ENSMUST00000093723 110 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Atg4cQ811C2 Tlr7-202ENSMUST00000112161 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Gm13212-202ENSMUST00000105739 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Olfr974-202ENSMUST00000213246 3561 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Tlr3-201ENSMUST00000034056 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Gm13432-201ENSMUST00000118861 241 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Gm2830-201ENSMUST00000140330 385 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Gm24813-201ENSMUST00000175310 84 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Mir5624-201ENSMUST00000176635 61 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Gm28257-201ENSMUST00000185244 463 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Gm28627-201ENSMUST00000186141 453 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Gm43583-201ENSMUST00000199235 303 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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Atg4cQ811C2 AC121942.2-201ENSMUST00000223824 600 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Gm22685-201ENSMUST00000082848 106 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Snord104-201ENSMUST00000083192 70 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Gm37063-201ENSMUST00000194678 3520 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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Atg4cQ811C2 Trbv6-201ENSMUST00000193743 276 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Gm43540-201ENSMUST00000196320 3848 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Gm44182-201ENSMUST00000204052 115 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Snhg1-208ENSMUST00000206029 408 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Olfr1317-201ENSMUST00000060098 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Il1rapl1-202ENSMUST00000113964 1936 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Zfp638-212ENSMUST00000203891 3968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Olfr1177-ps-202ENSMUST00000216713 2821 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Gm44133-202ENSMUST00000204450 2586 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Olfr681-203ENSMUST00000215517 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Pak3-210ENSMUST00000172330 8135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Snora36b-201ENSMUST00000104383 132 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Gm22713-201ENSMUST00000116895 130 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Cox20-ps-201ENSMUST00000119872 353 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Gm14761-201ENSMUST00000121363 262 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Gm13433-201ENSMUST00000121701 240 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Gm23867-201ENSMUST00000122649 274 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Gm14298-201ENSMUST00000139032 237 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Atg4cQ811C2 Gm16356-201ENSMUST00000143300 169 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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