Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm12370-201ENSMUST00000117809 604 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm15177-201ENSMUST00000120491 577 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm16359-201ENSMUST00000124511 289 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm11998-201ENSMUST00000146304 972 ntTSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm26936-201ENSMUST00000182424 382 ntTSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Mir7675-201ENSMUST00000184262 58 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm38231-201ENSMUST00000192030 347 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Igkv13-56-1-201ENSMUST00000198481 209 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm45439-201ENSMUST00000211723 359 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm45907-201ENSMUST00000213023 193 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm2628-201ENSMUST00000218019 426 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm23733-201ENSMUST00000083750 106 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm22489-201ENSMUST00000116813 62 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm12053-201ENSMUST00000119022 252 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm13603-201ENSMUST00000119404 83 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm14972-201ENSMUST00000121780 364 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm26102-201ENSMUST00000157251 284 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm24851-201ENSMUST00000158028 103 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm16405-201ENSMUST00000169247 468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm16404-201ENSMUST00000177739 468 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm7958-201ENSMUST00000178255 468 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm7950-201ENSMUST00000179633 468 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm14598-201ENSMUST00000180109 468 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm14625-201ENSMUST00000180231 468 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Ranbp2-ps3-201ENSMUST00000183549 388 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Mir6388-201ENSMUST00000184417 75 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm27715-201ENSMUST00000184714 260 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm21858-202ENSMUST00000185713 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm28706-201ENSMUST00000186830 355 ntTSL 2 BASIC0.48□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm28961-201ENSMUST00000190573 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm43531-201ENSMUST00000200676 1114 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm44336-201ENSMUST00000203696 468 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 AC140477.1-201ENSMUST00000222354 246 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 AC167977.2-201ENSMUST00000225676 682 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 AC112935.1-201ENSMUST00000227603 250 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm26224-201ENSMUST00000082506 80 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm22974-201ENSMUST00000083301 103 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Clec1b-202ENSMUST00000112079 455 ntTSL 1 (best) BASIC0.47□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm13356-201ENSMUST00000121678 335 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm23206-201ENSMUST00000122720 184 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm26038-201ENSMUST00000158151 106 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm17631-201ENSMUST00000171980 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm22800-201ENSMUST00000175627 94 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm24388-201ENSMUST00000177872 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm27717-201ENSMUST00000183933 151 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Ighv2-8-201ENSMUST00000193935 262 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm39154-201ENSMUST00000210257 560 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm19709-201ENSMUST00000215403 482 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm5955-201ENSMUST00000222712 219 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm24622-201ENSMUST00000082619 162 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Snora41-201ENSMUST00000082668 132 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm23042-201ENSMUST00000083866 101 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NischQ80TM9 Gm42718-201ENSMUST00000197319 2681 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 AA413626-201ENSMUST00000121125 494 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm24598-201ENSMUST00000122510 74 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm25914-201ENSMUST00000157618 153 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm24997-201ENSMUST00000157910 105 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm23858-201ENSMUST00000158384 106 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm17215-201ENSMUST00000170074 277 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm8114-201ENSMUST00000172225 484 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm24366-201ENSMUST00000175383 86 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm25120-201ENSMUST00000180148 79 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm29600-201ENSMUST00000188687 377 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Trbv24-201ENSMUST00000194614 347 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 2900035J10Rik-201ENSMUST00000194966 532 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm43026-201ENSMUST00000202972 325 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm44961-201ENSMUST00000207450 196 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm44644-201ENSMUST00000207994 642 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 AC159476.2-201ENSMUST00000216221 418 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 AC153522.1-201ENSMUST00000220047 1090 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 AC158606.1-201ENSMUST00000220078 325 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 1700127F24Rik-202ENSMUST00000223214 259 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 AC154692.1-201ENSMUST00000228314 544 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm37096-201ENSMUST00000192317 2058 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm43924-201ENSMUST00000204851 1736 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm26074-201ENSMUST00000104063 129 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Sval2-203ENSMUST00000120605 497 ntTSL 2 BASIC0.45□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm12881-201ENSMUST00000121191 203 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm12162-202ENSMUST00000129432 127 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm22337-201ENSMUST00000157721 132 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm25334-201ENSMUST00000158036 110 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm23854-201ENSMUST00000158378 108 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm23208-201ENSMUST00000158666 127 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm23090-201ENSMUST00000177331 78 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm10717-206ENSMUST00000177875 675 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm10717-207ENSMUST00000179264 672 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm10717-208ENSMUST00000179839 681 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm10717-209ENSMUST00000179982 681 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm29044-202ENSMUST00000188980 300 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm29037-201ENSMUST00000189092 313 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm34139-201ENSMUST00000196166 294 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm45459-201ENSMUST00000209882 442 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm45911-201ENSMUST00000211844 601 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 AC131759.1-201ENSMUST00000220642 310 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 AC126691.1-201ENSMUST00000226534 202 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm25128-201ENSMUST00000083339 76 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm23102-201ENSMUST00000083724 116 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Nkain2-202ENSMUST00000092603 273 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Gm10717-204ENSMUST00000099056 669 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
NischQ80TM9 Traj6-201ENSMUST00000103734 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.45□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.9 ms