Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Vmn1r-ps150-201ENSMUST00000176659 736 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Cnot1Q6ZQ08 Gm21094-201ENSMUST00000177842 498 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
Cnot1Q6ZQ08 Gm20837-201ENSMUST00000178446 498 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
Cnot1Q6ZQ08 Gm21739-201ENSMUST00000178639 498 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
Cnot1Q6ZQ08 Gm28891-201ENSMUST00000178751 498 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
Cnot1Q6ZQ08 Gm28490-201ENSMUST00000179076 498 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
Cnot1Q6ZQ08 Gm21861-201ENSMUST00000179480 498 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
Cnot1Q6ZQ08 Gm21256-201ENSMUST00000179672 498 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
Cnot1Q6ZQ08 Gm20838-201ENSMUST00000179884 498 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
Cnot1Q6ZQ08 Gm21679-201ENSMUST00000180373 498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
Cnot1Q6ZQ08 Ranbp2-ps3-201ENSMUST00000183549 388 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Cnot1Q6ZQ08 Ska2l-ps-201ENSMUST00000186208 360 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Cnot1Q6ZQ08 Mir6964-201ENSMUST00000200252 59 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Cnot1Q6ZQ08 Gm19855-201ENSMUST00000210145 249 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Cnot1Q6ZQ08 AC166060.1-201ENSMUST00000213509 425 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
Cnot1Q6ZQ08 AC156794.1-201ENSMUST00000214415 214 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
Cnot1Q6ZQ08 AC164086.1-201ENSMUST00000221038 289 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Cnot1Q6ZQ08 2210407C18Rik-201ENSMUST00000048801 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.03□□□□□ -2.41
Cnot1Q6ZQ08 Gm12080-201ENSMUST00000119821 1883 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Gm22796-201ENSMUST00000157234 106 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Gm22077-201ENSMUST00000157594 93 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Gm26355-201ENSMUST00000158220 105 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Vmn1r85-202ENSMUST00000209822 1251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Gm17911-201ENSMUST00000210806 877 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Olfr1142-ps1-201ENSMUST00000213624 805 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Gm31447-201ENSMUST00000222345 384 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Gm12370-201ENSMUST00000117809 604 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Gm7350-201ENSMUST00000120964 636 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Defa-ps12-201ENSMUST00000122353 193 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Gm22765-201ENSMUST00000158371 128 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Gm20477-201ENSMUST00000174028 280 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Gm42516-201ENSMUST00000198691 767 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Mir3961-201ENSMUST00000198795 59 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Gm43898-201ENSMUST00000204456 424 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 A530053G22Rik-204ENSMUST00000204579 536 ntTSL 2 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Gm45911-201ENSMUST00000211844 601 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Gm19709-201ENSMUST00000215403 482 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 AC167202.1-201ENSMUST00000219027 331 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 AC154521.1-201ENSMUST00000222635 330 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Olfr969-202ENSMUST00000213266 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Gm22769-201ENSMUST00000158367 98 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Vmn2r-ps111-201ENSMUST00000161565 241 ntTSL 2 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Ear-ps8-201ENSMUST00000161935 354 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Gm24197-201ENSMUST00000175085 109 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Gm21744-201ENSMUST00000178403 662 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Gm24218-201ENSMUST00000180163 105 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Gm28214-201ENSMUST00000185663 420 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Gm42719-201ENSMUST00000197393 355 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 AC125523.1-201ENSMUST00000228018 934 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Mir411-201ENSMUST00000083543 82 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Gm23130-201ENSMUST00000104252 74 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Mir669m-1-201ENSMUST00000158945 98 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Vmn2r-ps62-201ENSMUST00000174119 616 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Mir126a-201ENSMUST00000083606 73 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Olfr1466-202ENSMUST00000207124 1981 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Tas2r122-201ENSMUST00000105077 930 ntAPPRIS P1 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Gm14530-201ENSMUST00000122391 333 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Gm25663-201ENSMUST00000157698 135 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Mir3112-201ENSMUST00000175431 82 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Gm22446-201ENSMUST00000180108 104 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Gm36992-201ENSMUST00000195463 428 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Olfr1486-ps1-201ENSMUST00000208835 220 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 AC123062.1-201ENSMUST00000221287 481 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Gm24494-201ENSMUST00000083804 81 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Gm25309-201ENSMUST00000116728 126 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Gm22027-201ENSMUST00000122737 127 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Gm25185-201ENSMUST00000157754 96 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Gm25371-201ENSMUST00000158162 101 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Scgb2b17-202ENSMUST00000182640 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Mir6370-201ENSMUST00000183510 120 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 C030015E24Rik-201ENSMUST00000198148 828 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Gm45815-201ENSMUST00000220241 146 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Gm25799-201ENSMUST00000082643 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Gm26377-201ENSMUST00000102184 108 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Gm22527-201ENSMUST00000158816 106 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Gm2962-201ENSMUST00000159266 336 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Eif3s6-ps2-201ENSMUST00000163304 219 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Esp4-201ENSMUST00000178498 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.07□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Rpl23a-ps12-201ENSMUST00000179178 468 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Gm43897-201ENSMUST00000204019 309 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 AC147240.1-201ENSMUST00000218767 431 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Snord82-201ENSMUST00000082889 70 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Mir103-1-201ENSMUST00000083619 86 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Gm24598-201ENSMUST00000122510 74 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Gm24997-201ENSMUST00000157910 105 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Gm17655-201ENSMUST00000167969 255 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Gm23090-201ENSMUST00000177331 78 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Il6st-202ENSMUST00000183513 201 ntTSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Gm43602-201ENSMUST00000196772 300 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Cyp3a61-ps1-201ENSMUST00000218470 592 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Gm25578-201ENSMUST00000083406 104 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Gm23463-201ENSMUST00000122468 99 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Gm22800-201ENSMUST00000175627 94 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Gm28110-201ENSMUST00000185782 315 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Gm29057-201ENSMUST00000186468 315 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Gm28737-201ENSMUST00000186808 315 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Cnot1Q6ZQ08 Gm29147-201ENSMUST00000186846 315 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
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