Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Gm23381-201ENSMUST00000157676 94 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Soga3Q6NZL0 Gm37162-201ENSMUST00000191708 551 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Soga3Q6NZL0 Igkv2-93-1-201ENSMUST00000196774 272 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Soga3Q6NZL0 Gm43669-201ENSMUST00000198229 436 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Soga3Q6NZL0 Gm43914-201ENSMUST00000203592 594 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Soga3Q6NZL0 Gm8031-201ENSMUST00000213430 626 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Soga3Q6NZL0 AC125020.2-201ENSMUST00000218894 348 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Soga3Q6NZL0 Gm46389-201ENSMUST00000223199 392 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Soga3Q6NZL0 AC125350.4-201ENSMUST00000225895 273 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Soga3Q6NZL0 Mucl2-201ENSMUST00000037685 639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Soga3Q6NZL0 Gm23041-201ENSMUST00000083868 106 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Soga3Q6NZL0 Gm25937-201ENSMUST00000083912 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Soga3Q6NZL0 Skint2-203ENSMUST00000106560 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Gm12941-201ENSMUST00000117934 220 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Gm23670-201ENSMUST00000157469 119 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Gm22316-201ENSMUST00000158012 216 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Gm24726-201ENSMUST00000158232 121 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Gm24487-201ENSMUST00000178017 63 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Mir6997-201ENSMUST00000184313 71 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Gm27753-201ENSMUST00000184742 203 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Gm29069-201ENSMUST00000185857 675 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Trbv6-201ENSMUST00000193743 276 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Gm44308-201ENSMUST00000197080 99 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Mir497-201ENSMUST00000200557 84 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Gm31025-201ENSMUST00000222553 482 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Gm45941-202ENSMUST00000223144 389 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Snord68-201ENSMUST00000082516 86 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Gm23249-201ENSMUST00000083369 161 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 AW112010-201ENSMUST00000099676 770 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Olfr1442-202ENSMUST00000207341 3126 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Olfr1442-204ENSMUST00000208657 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Ifi203-201ENSMUST00000042228 3754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Gm7173-205ENSMUST00000197180 9412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Gm24280-201ENSMUST00000104237 134 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Gm22151-201ENSMUST00000116963 58 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Gm15010-201ENSMUST00000117153 407 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Gm25961-201ENSMUST00000157174 135 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Gm23548-201ENSMUST00000158963 106 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Gm16038-201ENSMUST00000159317 193 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Gm22800-201ENSMUST00000175627 94 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Gm28724-201ENSMUST00000186149 625 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Gm37404-201ENSMUST00000195726 359 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Igkv4-65-201ENSMUST00000196986 358 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 AC117198.1-201ENSMUST00000217080 651 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 AC158622.1-201ENSMUST00000217107 230 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 AC121942.2-201ENSMUST00000223824 600 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Gm22062-201ENSMUST00000082563 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Mirlet7c-1-201ENSMUST00000083623 94 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Gm10720-201ENSMUST00000099050 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Gm37761-201ENSMUST00000194989 2098 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Zfp160-201ENSMUST00000088811 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Uty-201ENSMUST00000069309 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Gm42755-201ENSMUST00000198533 1493 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Vmn1r185-204ENSMUST00000227411 4928 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Gm1980-201ENSMUST00000123131 2306 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Igkv2-109-201ENSMUST00000103322 374 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Gm23950-201ENSMUST00000104026 129 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Gm26077-201ENSMUST00000104064 123 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Mir669i-201ENSMUST00000117007 127 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Gm13711-201ENSMUST00000119708 453 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Gm13518-201ENSMUST00000120018 233 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Mir1898-201ENSMUST00000122643 83 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Gm24436-201ENSMUST00000157889 302 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Gm28008-201ENSMUST00000184021 186 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Mir7017-201ENSMUST00000184894 62 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Gm29155-202ENSMUST00000186289 216 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Gm44182-201ENSMUST00000204052 115 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 AC164161.1-201ENSMUST00000214076 639 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 AC124104.1-201ENSMUST00000226279 417 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 AC165415.1-201ENSMUST00000228924 273 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Olfr470-201ENSMUST00000073059 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Hmgb1l-201ENSMUST00000082150 571 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Gm23851-201ENSMUST00000083831 103 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Nkain2-202ENSMUST00000092603 273 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Olfr1177-ps-202ENSMUST00000216713 2821 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Gm13885-201ENSMUST00000117569 187 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Gm22843-201ENSMUST00000157710 134 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Gm28418-201ENSMUST00000186179 423 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Gm28995-201ENSMUST00000186625 261 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Gm29005-201ENSMUST00000186773 320 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Gm44010-201ENSMUST00000204432 331 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Gm44555-201ENSMUST00000209008 148 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Gm18991-201ENSMUST00000209225 746 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 AC116460.1-201ENSMUST00000219040 313 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 AC173345.1-201ENSMUST00000222837 306 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 AC027184.1-201ENSMUST00000226991 424 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 mt-Td-201ENSMUST00000082404 70 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 2410141K09Rik-201ENSMUST00000091541 288 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Il1rapl1-202ENSMUST00000113964 1936 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Olfr1450-203ENSMUST00000213925 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Olfr1225-202ENSMUST00000216961 3231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Sel1l2-201ENSMUST00000120133 579 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Gm15365-201ENSMUST00000122392 300 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 n-R5s164-201ENSMUST00000122664 112 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Gm12865-201ENSMUST00000137353 326 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Gm13467-201ENSMUST00000145568 281 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Gm17065-201ENSMUST00000165245 239 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Mir28b-201ENSMUST00000175399 80 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Gm25284-201ENSMUST00000180345 141 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Soga3Q6NZL0 Gm25820-201ENSMUST00000198589 127 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms