Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm25011-201ENSMUST00000158398 126 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm24085-201ENSMUST00000175172 116 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm22239-201ENSMUST00000175220 103 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm27420-201ENSMUST00000183823 79 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm23370-201ENSMUST00000199545 130 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm24149-201ENSMUST00000082757 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm24868-201ENSMUST00000157265 136 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm24077-201ENSMUST00000158183 136 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Mir7086-201ENSMUST00000183683 65 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm38154-201ENSMUST00000195444 340 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm6105-201ENSMUST00000200580 624 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm44564-201ENSMUST00000207985 180 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 AC156794.1-201ENSMUST00000214415 214 ntTSL 5 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 2010005H15Rik-201ENSMUST00000063539 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.22□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm24038-201ENSMUST00000082872 159 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm24494-201ENSMUST00000083804 81 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
NipblQ6KCD5 Gm37096-201ENSMUST00000192317 2058 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm11859-201ENSMUST00000118099 455 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm15177-201ENSMUST00000120491 577 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm14530-201ENSMUST00000122391 333 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm7846-201ENSMUST00000145844 274 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm24965-201ENSMUST00000157922 106 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm24321-201ENSMUST00000175348 80 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm27878-201ENSMUST00000184000 106 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm44328-201ENSMUST00000199331 75 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm42739-201ENSMUST00000200687 226 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm45911-201ENSMUST00000211844 601 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm14412-201ENSMUST00000108959 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm15861-201ENSMUST00000120979 339 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm28214-201ENSMUST00000185663 420 ntTSL 5 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm28956-201ENSMUST00000189047 427 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Mir7218-201ENSMUST00000200050 59 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 AC125374.2-201ENSMUST00000214278 162 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm19709-201ENSMUST00000215403 482 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 AC154262.1-201ENSMUST00000225976 286 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 AC155314.1-201ENSMUST00000227624 508 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 mt-Nd1-201ENSMUST00000082392 957 ntAPPRIS P1 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Mir19b-2-201ENSMUST00000083539 84 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm22886-201ENSMUST00000093714 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm14774-201ENSMUST00000117857 536 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Olfr1144-ps1-201ENSMUST00000118227 328 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm24959-201ENSMUST00000157924 146 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm24925-201ENSMUST00000178157 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps20-201ENSMUST00000179853 382 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm43531-201ENSMUST00000200676 1114 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm24764-201ENSMUST00000083686 199 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm26166-201ENSMUST00000083788 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm13992-201ENSMUST00000120558 156 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm20058-201ENSMUST00000186939 284 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 9530003O04Rik-201ENSMUST00000192663 908 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Cyp3a61-ps1-201ENSMUST00000218470 592 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Mir429-201ENSMUST00000083493 83 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Mir183-201ENSMUST00000083685 70 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm26395-201ENSMUST00000104094 132 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm23482-201ENSMUST00000104172 122 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm23821-201ENSMUST00000158738 106 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Mir6388-201ENSMUST00000184417 75 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm29014-201ENSMUST00000191422 326 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm31520-201ENSMUST00000203048 733 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm17911-201ENSMUST00000210806 877 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm45815-201ENSMUST00000220241 146 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Mir717-201ENSMUST00000102259 109 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm14945-201ENSMUST00000119556 1118 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Snora81-201ENSMUST00000157310 178 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm23777-201ENSMUST00000158994 259 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm17215-201ENSMUST00000170074 277 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm26501-201ENSMUST00000178307 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm24565-201ENSMUST00000180099 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm8940-201ENSMUST00000212585 219 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 2210407C18Rik-201ENSMUST00000048801 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.25□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm26125-201ENSMUST00000083357 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm23103-201ENSMUST00000083725 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm25650-201ENSMUST00000083784 162 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm15807-201ENSMUST00000119880 1128 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm12823-201ENSMUST00000134494 318 ntTSL 5 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm15914-201ENSMUST00000161922 309 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Mir7057-201ENSMUST00000184685 58 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm44024-201ENSMUST00000203008 476 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm44524-201ENSMUST00000203899 271 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm35077-201ENSMUST00000204999 275 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm26256-201ENSMUST00000122499 186 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm25663-201ENSMUST00000157698 135 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm22765-201ENSMUST00000158371 128 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm23415-201ENSMUST00000175519 83 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm27007-201ENSMUST00000183264 279 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 AC163033.1-201ENSMUST00000218608 157 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm14792-201ENSMUST00000119725 258 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Mup-ps21-201ENSMUST00000119998 448 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm12686-201ENSMUST00000120546 397 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm25706-201ENSMUST00000157828 247 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm24002-201ENSMUST00000158456 104 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm29613-201ENSMUST00000185846 313 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm29544-201ENSMUST00000188860 313 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm28808-201ENSMUST00000190978 313 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm44560-201ENSMUST00000207816 3115 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm7429-201ENSMUST00000118664 348 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm11606-201ENSMUST00000120706 617 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm24388-201ENSMUST00000177872 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm44977-201ENSMUST00000205283 420 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
NipblQ6KCD5 Gm45023-201ENSMUST00000207951 379 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.3 ms