Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Gm43587-201ENSMUST00000199590 204 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Pkp4Q68FH0 Gm43578-201ENSMUST00000201250 459 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Pkp4Q68FH0 Gm43865-201ENSMUST00000204721 127 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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Pkp4Q68FH0 Snora33-201ENSMUST00000093556 129 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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Pkp4Q68FH0 Gm14972-201ENSMUST00000121780 364 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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Pkp4Q68FH0 AW112010-201ENSMUST00000099676 770 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
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Pkp4Q68FH0 Gm5900-201ENSMUST00000179862 375 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Pkp4Q68FH0 Scgb2b17-202ENSMUST00000182640 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Pkp4Q68FH0 Gm27410-201ENSMUST00000183851 115 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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Pkp4Q68FH0 Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 184 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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Pkp4Q68FH0 Nbdy-205ENSMUST00000208235 132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Pkp4Q68FH0 Gm35101-201ENSMUST00000219218 243 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Pkp4Q68FH0 AC192333.1-201ENSMUST00000224573 376 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Pkp4Q68FH0 AC154245.1-201ENSMUST00000224615 601 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Pkp4Q68FH0 Snord42a-201ENSMUST00000082606 65 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Pkp4Q68FH0 Mir30d-201ENSMUST00000083503 82 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Pkp4Q68FH0 Mir151-201ENSMUST00000083678 68 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Pkp4Q68FH0 Gm26164-201ENSMUST00000083793 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Pkp4Q68FH0 Ifi203-205ENSMUST00000129829 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
Pkp4Q68FH0 Gm42664-201ENSMUST00000199417 3239 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Pkp4Q68FH0 Gm22021-201ENSMUST00000104353 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Pkp4Q68FH0 Gm11798-201ENSMUST00000119150 421 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Pkp4Q68FH0 Gm13396-201ENSMUST00000120617 271 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Pkp4Q68FH0 Gm12926-201ENSMUST00000121158 409 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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