Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Sycp1-ps1-201ENSMUST00000207882 2768 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Olfr138-202ENSMUST00000172843 1769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.2□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm14884-201ENSMUST00000120456 196 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm23605-201ENSMUST00000157255 127 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm22221-201ENSMUST00000157362 103 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm23538-201ENSMUST00000157535 101 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm15914-201ENSMUST00000161922 309 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm23967-201ENSMUST00000175062 78 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm24323-201ENSMUST00000175342 77 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm25156-201ENSMUST00000179809 79 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Mir6364-201ENSMUST00000183396 86 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm29661-201ENSMUST00000186781 315 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm20257-202ENSMUST00000188643 130 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm29308-201ENSMUST00000188863 315 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm44358-201ENSMUST00000196301 98 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm44988-201ENSMUST00000203835 1161 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 AC162387.1-201ENSMUST00000213369 213 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 AC093316.1-201ENSMUST00000218793 529 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 AC152414.2-201ENSMUST00000219620 537 ntTSL 1 (best) BASIC0.2□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 AC156560.1-201ENSMUST00000221425 256 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 CT009733.1-203ENSMUST00000224033 451 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 AC173482.5-201ENSMUST00000224181 327 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 AC168062.2-201ENSMUST00000228907 422 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm14797-201ENSMUST00000119378 1480 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm8858-201ENSMUST00000118259 342 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm14887-201ENSMUST00000119522 663 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm23754-201ENSMUST00000157576 63 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm23589-201ENSMUST00000157660 105 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm9944-201ENSMUST00000177649 309 ntAPPRIS P1 BASIC0.19□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Mir6355-201ENSMUST00000183687 106 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Mir7059-201ENSMUST00000184825 59 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm29044-202ENSMUST00000188980 300 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 1700112D23Rik-202ENSMUST00000193387 299 ntTSL 2 BASIC0.19□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Igkv13-82-201ENSMUST00000200308 346 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 AC134334.1-201ENSMUST00000214277 255 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 AC113305.1-201ENSMUST00000214664 724 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm46997-201ENSMUST00000222108 217 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 AC159621.1-201ENSMUST00000223249 163 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 AC113441.1-201ENSMUST00000223464 134 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 AW112010-201ENSMUST00000099676 770 ntTSL 1 (best) BASIC0.19□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 AC158598.2-201ENSMUST00000213397 3832 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Esp31-201ENSMUST00000174742 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.18□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Mup-ps14-201ENSMUST00000118437 532 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm14917-201ENSMUST00000118872 2105 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm11792-201ENSMUST00000120640 168 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm23184-201ENSMUST00000122594 131 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Mup-ps2-201ENSMUST00000142602 533 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm22038-201ENSMUST00000157277 242 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm24476-201ENSMUST00000157437 131 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm27898-201ENSMUST00000183987 80 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Mir6382-201ENSMUST00000184055 110 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm37713-201ENSMUST00000191746 198 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm42958-201ENSMUST00000197595 318 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm43004-201ENSMUST00000201872 703 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 4930543K20Rik-201ENSMUST00000217044 355 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm38407-201ENSMUST00000218017 474 ntTSL 2 BASIC0.18□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm31447-201ENSMUST00000222345 384 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Olfr152-201ENSMUST00000090709 951 ntAPPRIS P2 BASIC0.18□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 AC127302.3-201ENSMUST00000215480 2791 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm382-201ENSMUST00000096332 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.18□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 AC164297.1-201ENSMUST00000224484 1561 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm24271-201ENSMUST00000102327 111 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm26339-201ENSMUST00000102368 99 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm25378-201ENSMUST00000104333 129 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm22193-201ENSMUST00000116868 76 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Sult2a-ps3-201ENSMUST00000117899 428 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm13153-201ENSMUST00000120969 637 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm23331-201ENSMUST00000157423 108 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm22706-201ENSMUST00000157907 112 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps59-201ENSMUST00000172698 199 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm27289-201ENSMUST00000183341 82 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm27964-201ENSMUST00000185195 62 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm37727-201ENSMUST00000191637 819 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm37642-201ENSMUST00000193166 1735 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm34783-201ENSMUST00000209159 303 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm45556-201ENSMUST00000210689 345 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 CT010506.2-201ENSMUST00000225618 183 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm26446-201ENSMUST00000082455 103 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm25138-201ENSMUST00000083248 136 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm24610-201ENSMUST00000083270 109 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm21876-201ENSMUST00000096511 282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Olfr867-202ENSMUST00000212098 4228 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm25938-201ENSMUST00000104139 166 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s207-201ENSMUST00000122497 118 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm25294-201ENSMUST00000122791 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm23230-201ENSMUST00000157298 133 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Mir15a-201ENSMUST00000175266 84 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm26116-201ENSMUST00000175600 77 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm23267-201ENSMUST00000178490 132 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm29216-201ENSMUST00000187117 492 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 AC164161.1-201ENSMUST00000214076 639 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 AC168062.3-201ENSMUST00000227025 165 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 AC122834.1-201ENSMUST00000227182 425 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 AC122341.1-201ENSMUST00000227291 560 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Olfr916-201ENSMUST00000081196 933 ntAPPRIS P1 BASIC0.16□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 DQ267101-201ENSMUST00000082562 73 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm22306-201ENSMUST00000082692 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Sft2d1Q5SSN7 Gm10720-201ENSMUST00000099050 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
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